Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTV4

Protein Details
Accession B0CTV4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MVLQRRKTARARMQRPDIKFEPHydrophilic
43-64TGRFGHANKRRKHQDSHSDSDVHydrophilic
83-104LSPGPTPQVQRKRKTTNASDVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
928-980DRPQHDRGGSRGWRGGGRGRGKGWESPPRPIDSGWPRRGRGGGPASNSPPRRW
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305279  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MVLQRRKTARARMQRPDIKFEPEESEEEEGSEDEYVAEDSQTTGRFGHANKRRKHQDSHSDSDVAASDNEGTTKRHSISNVPLSPGPTPQVQRKRKTTNASDVTPASKRKKAAEVEAVDDPIRKYCLGKLEELFRDIFLRYPHVHVKIEEGGQGQKSVIIPKPLEELSDEDKDALIEESKQFAEGLERCVFEIYSEPDRNGNSQAGGNYKDRFRMLQFNLSKPDRVIIHQRITSANISPKEISLMSSTDLADEETKQSIKIAEKEALAYSILQKATAPRAKITHKGLQDIEDINGQTTTTRELDRQVERDLEGEERRERERTARLKVQRQRTDSVSVPPESPTVSQTPSESWGAPPPIPPHAVSTNAGEMASPISRPPVNPLFIHTASELALPAPEPELNLADLINIDDEPTEQESLLPSSSSSLPSMVVDEPMSTEPVALEPPSPSLPLPTGISPFAARAEKSRAMSFDLNALWNAPKSEDASKTATPRSPPLTTTPPLSITNGDQKDIPMELESEADDEAKDQDFDMFLEDREVEKIEPVNAADVLQAAFDALPHVWTGQISMPLDSTIPQETAIIARQVGGKPLAANSPLWKTLFPSSNLRIDGRVPVEGSAKYLLQMRMNAAKELFSVAFTPSSDASETGFKALSDFLTAKSRHGLIFPWGSRPKEHHPGRELYIIPLPATQPLPDYIELLDNLKLPPVRKADYLVGIWILNKGKLAPPPPSPPPPPVTVPALPAHLSIPSFNAAIVPPATASTPPIPHPPPILSNLPPIAPAALAAEVASLTPEQIQNVLKALASATPLLPTAPPAQVPQQFRPPPQNPPPPPVQHARLQMPPSHAQPQLPPPQVPQRYPPPPPTTQHQQPTWPPPPAPYPSNYPPMQQPNMPPYRGPPQPPPPSVYDRPDYGRDPRADVVYERERGGGDRGDRPQHDRGGSRGWRGGGRGRGKGWESPPRPIDSGWPRRGRGGGPASNSPPRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.82
3 0.81
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.56
8 0.52
9 0.46
10 0.44
11 0.39
12 0.38
13 0.31
14 0.29
15 0.27
16 0.2
17 0.17
18 0.15
19 0.11
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.14
32 0.18
33 0.2
34 0.3
35 0.36
36 0.45
37 0.51
38 0.62
39 0.7
40 0.73
41 0.8
42 0.8
43 0.81
44 0.81
45 0.81
46 0.75
47 0.66
48 0.59
49 0.52
50 0.42
51 0.32
52 0.23
53 0.16
54 0.12
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.17
60 0.22
61 0.23
62 0.26
63 0.28
64 0.33
65 0.41
66 0.49
67 0.48
68 0.47
69 0.47
70 0.45
71 0.44
72 0.4
73 0.33
74 0.29
75 0.31
76 0.37
77 0.46
78 0.53
79 0.61
80 0.68
81 0.75
82 0.78
83 0.83
84 0.81
85 0.82
86 0.79
87 0.73
88 0.68
89 0.6
90 0.57
91 0.53
92 0.52
93 0.48
94 0.46
95 0.46
96 0.47
97 0.53
98 0.53
99 0.56
100 0.57
101 0.54
102 0.53
103 0.52
104 0.49
105 0.41
106 0.37
107 0.3
108 0.23
109 0.21
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.27
114 0.27
115 0.32
116 0.33
117 0.39
118 0.41
119 0.42
120 0.38
121 0.3
122 0.29
123 0.25
124 0.24
125 0.18
126 0.21
127 0.21
128 0.25
129 0.31
130 0.34
131 0.36
132 0.34
133 0.37
134 0.36
135 0.35
136 0.33
137 0.28
138 0.27
139 0.25
140 0.25
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.23
148 0.24
149 0.28
150 0.26
151 0.26
152 0.22
153 0.24
154 0.23
155 0.26
156 0.25
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.15
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.18
171 0.17
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.16
179 0.19
180 0.18
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.27
185 0.28
186 0.3
187 0.29
188 0.25
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.27
201 0.33
202 0.34
203 0.4
204 0.43
205 0.44
206 0.51
207 0.51
208 0.49
209 0.39
210 0.39
211 0.31
212 0.31
213 0.36
214 0.35
215 0.39
216 0.39
217 0.41
218 0.38
219 0.4
220 0.38
221 0.32
222 0.32
223 0.27
224 0.28
225 0.27
226 0.25
227 0.25
228 0.23
229 0.2
230 0.15
231 0.15
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.15
246 0.18
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.18
255 0.15
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.23
263 0.26
264 0.25
265 0.24
266 0.29
267 0.33
268 0.4
269 0.43
270 0.42
271 0.4
272 0.43
273 0.41
274 0.38
275 0.38
276 0.32
277 0.26
278 0.22
279 0.2
280 0.16
281 0.15
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.15
290 0.22
291 0.25
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.26
296 0.26
297 0.23
298 0.21
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.22
303 0.24
304 0.25
305 0.25
306 0.26
307 0.34
308 0.37
309 0.42
310 0.48
311 0.54
312 0.62
313 0.68
314 0.73
315 0.72
316 0.69
317 0.66
318 0.6
319 0.57
320 0.49
321 0.48
322 0.41
323 0.34
324 0.31
325 0.27
326 0.24
327 0.21
328 0.2
329 0.16
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.17
336 0.18
337 0.16
338 0.15
339 0.17
340 0.19
341 0.18
342 0.2
343 0.19
344 0.2
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.2
349 0.22
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.17
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.07
360 0.06
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.15
365 0.18
366 0.2
367 0.21
368 0.24
369 0.28
370 0.28
371 0.29
372 0.23
373 0.19
374 0.17
375 0.17
376 0.13
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.16
449 0.19
450 0.2
451 0.21
452 0.19
453 0.22
454 0.23
455 0.21
456 0.18
457 0.16
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.12
468 0.13
469 0.15
470 0.19
471 0.21
472 0.23
473 0.25
474 0.24
475 0.22
476 0.24
477 0.25
478 0.22
479 0.22
480 0.24
481 0.27
482 0.26
483 0.27
484 0.25
485 0.23
486 0.23
487 0.23
488 0.19
489 0.16
490 0.23
491 0.21
492 0.21
493 0.18
494 0.17
495 0.17
496 0.16
497 0.15
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.06
548 0.06
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.13
579 0.15
580 0.15
581 0.14
582 0.15
583 0.2
584 0.23
585 0.23
586 0.27
587 0.28
588 0.32
589 0.34
590 0.32
591 0.27
592 0.25
593 0.26
594 0.21
595 0.19
596 0.15
597 0.14
598 0.16
599 0.15
600 0.15
601 0.13
602 0.11
603 0.11
604 0.15
605 0.16
606 0.15
607 0.16
608 0.17
609 0.23
610 0.24
611 0.24
612 0.19
613 0.18
614 0.16
615 0.17
616 0.15
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.1
621 0.09
622 0.11
623 0.09
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.1
628 0.12
629 0.12
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.17
640 0.17
641 0.17
642 0.19
643 0.2
644 0.18
645 0.19
646 0.18
647 0.16
648 0.23
649 0.23
650 0.29
651 0.33
652 0.33
653 0.34
654 0.39
655 0.42
656 0.45
657 0.5
658 0.49
659 0.49
660 0.52
661 0.54
662 0.53
663 0.47
664 0.38
665 0.36
666 0.29
667 0.24
668 0.21
669 0.18
670 0.15
671 0.15
672 0.12
673 0.1
674 0.11
675 0.14
676 0.13
677 0.14
678 0.12
679 0.13
680 0.14
681 0.14
682 0.13
683 0.12
684 0.11
685 0.13
686 0.15
687 0.14
688 0.19
689 0.23
690 0.24
691 0.24
692 0.28
693 0.28
694 0.3
695 0.29
696 0.24
697 0.2
698 0.18
699 0.17
700 0.17
701 0.15
702 0.12
703 0.12
704 0.12
705 0.14
706 0.18
707 0.21
708 0.23
709 0.27
710 0.33
711 0.39
712 0.45
713 0.45
714 0.45
715 0.45
716 0.44
717 0.42
718 0.39
719 0.39
720 0.34
721 0.33
722 0.3
723 0.29
724 0.25
725 0.23
726 0.2
727 0.15
728 0.15
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.07
740 0.08
741 0.09
742 0.08
743 0.11
744 0.13
745 0.15
746 0.17
747 0.24
748 0.25
749 0.27
750 0.3
751 0.29
752 0.29
753 0.31
754 0.34
755 0.29
756 0.31
757 0.3
758 0.27
759 0.25
760 0.23
761 0.18
762 0.13
763 0.11
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.04
773 0.04
774 0.06
775 0.07
776 0.07
777 0.11
778 0.12
779 0.12
780 0.14
781 0.14
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.09
789 0.1
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.11
794 0.13
795 0.13
796 0.14
797 0.16
798 0.23
799 0.29
800 0.34
801 0.37
802 0.44
803 0.47
804 0.5
805 0.58
806 0.55
807 0.59
808 0.63
809 0.69
810 0.63
811 0.64
812 0.69
813 0.63
814 0.65
815 0.62
816 0.56
817 0.52
818 0.55
819 0.54
820 0.52
821 0.5
822 0.49
823 0.48
824 0.47
825 0.45
826 0.44
827 0.41
828 0.36
829 0.38
830 0.43
831 0.47
832 0.47
833 0.43
834 0.43
835 0.51
836 0.56
837 0.54
838 0.52
839 0.52
840 0.56
841 0.61
842 0.64
843 0.61
844 0.61
845 0.63
846 0.63
847 0.63
848 0.64
849 0.67
850 0.61
851 0.62
852 0.64
853 0.7
854 0.69
855 0.64
856 0.56
857 0.52
858 0.55
859 0.53
860 0.49
861 0.42
862 0.43
863 0.44
864 0.51
865 0.48
866 0.43
867 0.46
868 0.51
869 0.51
870 0.47
871 0.47
872 0.5
873 0.56
874 0.54
875 0.47
876 0.44
877 0.48
878 0.5
879 0.49
880 0.49
881 0.53
882 0.61
883 0.63
884 0.62
885 0.61
886 0.63
887 0.64
888 0.6
889 0.55
890 0.49
891 0.51
892 0.52
893 0.5
894 0.48
895 0.5
896 0.46
897 0.47
898 0.45
899 0.43
900 0.41
901 0.38
902 0.39
903 0.38
904 0.38
905 0.34
906 0.32
907 0.3
908 0.29
909 0.32
910 0.29
911 0.26
912 0.31
913 0.37
914 0.44
915 0.46
916 0.51
917 0.54
918 0.55
919 0.55
920 0.51
921 0.48
922 0.51
923 0.53
924 0.53
925 0.5
926 0.46
927 0.44
928 0.45
929 0.48
930 0.47
931 0.49
932 0.49
933 0.47
934 0.51
935 0.51
936 0.55
937 0.56
938 0.57
939 0.54
940 0.58
941 0.6
942 0.59
943 0.57
944 0.51
945 0.53
946 0.53
947 0.59
948 0.6
949 0.63
950 0.59
951 0.62
952 0.64
953 0.56
954 0.55
955 0.54
956 0.5
957 0.48
958 0.53
959 0.55
960 0.61