Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0I612

Protein Details
Accession R0I612    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-154PSFQPGKPVAPRKSRPPKQKQPQAPKSTAPDHydrophilic
844-863DPDQKRLRFKPMPRNQRAFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-38GGGRGGRGRGRG
67-90RGGRGGRGGRGGGRGRGGPDRPQR
132-143VAPRKSRPPKQK
552-557NRRKAR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MSTPTVAPQPPTSAPANAPRGQQSQRGGGRGGRGRGRGNRNDAGAHAQPNPVAPELVPTSVQEAAHRGGRGGRGGRGGGRGRGGPDRPQRIAAGGRQFGGQLTVEGDTASVSSELPQGLQADAPSFQPGKPVAPRKSRPPKQKQPQAPKSTAPDIATRTHEDIDNGHYECAICTEEVTRRSRGVWSCRTCWTVFHLGCIKKWSTNEGSAAARQQAQDGEAPPPRQWRCPGCNLPKDVLPKNFHCWCEKELDPRSTPGLPPFSCGQTCSRPRVLPKPCPHPCGSTCHAGPCPPCNLMGPTQHCFCAKKSVTRRCVDTDYEHGWSCGDVCGKSMSCGQHRCERPCHDGPCGACEERVPARCYCGQIEKDILCHDRDVEKASSQLHIATDGTTTVENWVGSFQCLNKCGRSFDCGKHTCELPCHPQVSKAPHCPRSPDVVTHCPCGKTALRDMPSKPRAACEDPIPNCNKPCGQMLACGHTCRQHCHQGECRPCLEKVDIACRCGRTSSQSICHQGSVEPPQCMRVCRISLNCGRHECGQRCCAGEKKAAERQSNRRKARPLDSAPRRPLENFEAEHICTRSCGRPLKCGNPEHRCQELCHKGPCGTCRDAIFEELSCHCGRTILYPPLPCGTKPPPCRFKCERPKECGHPQLDHTCHEDDQACPKCAFLTAKPCLCGKSVLKNQPCWLNEVRCGQVCGRTLKCGTHKCQKQCHRPGECEEPCTQACGKELSTCGHPCLAPCHFPQPCKEEKPCPHKIFVTCECQRIKQEAKCNASCSGDGNLKKTLKCDEECARLERNRVLALALNVDPEHQSDHIPYSDATLNMYQQNATWAATQEKQLRLFAADPDQKRLRFKPMPRNQRAFIHSLAEDFGMDSESMDPEPHRHVAIFKTPKFVMAPMRTLAECARTRQIQQRIAPAPAPAPAPTAALRPKPNNANVDPYNAFLILNPRFALTIEELAPVVKSVLSKTSFRCELEMTFLPGEVVALKPPLAARLSIPEREMQTMLESIQAPLSQALSAQSIGKIQLARLDSTLTVLRKESDVGPGSGWSQVAASKGTPLRQVQKSTPFGNKGGFAVLSLSSKKKKKEAPVEVAEDWEAAEEEEEQKEKSGANSGVASEDEGGAWNTSSTATKDVPEASESTAVGEENNATSSDDAHLTIKPMPGRWADLEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.43
4 0.42
5 0.44
6 0.46
7 0.5
8 0.5
9 0.53
10 0.49
11 0.51
12 0.52
13 0.52
14 0.48
15 0.44
16 0.49
17 0.49
18 0.52
19 0.48
20 0.49
21 0.54
22 0.61
23 0.67
24 0.67
25 0.68
26 0.66
27 0.62
28 0.59
29 0.53
30 0.5
31 0.45
32 0.4
33 0.35
34 0.31
35 0.29
36 0.3
37 0.3
38 0.24
39 0.2
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.18
46 0.19
47 0.22
48 0.22
49 0.18
50 0.19
51 0.2
52 0.24
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.26
57 0.31
58 0.3
59 0.31
60 0.3
61 0.32
62 0.33
63 0.37
64 0.38
65 0.35
66 0.34
67 0.33
68 0.34
69 0.39
70 0.4
71 0.42
72 0.48
73 0.53
74 0.52
75 0.53
76 0.5
77 0.47
78 0.49
79 0.46
80 0.45
81 0.39
82 0.37
83 0.35
84 0.34
85 0.29
86 0.26
87 0.2
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.19
115 0.2
116 0.24
117 0.32
118 0.41
119 0.46
120 0.55
121 0.61
122 0.67
123 0.77
124 0.81
125 0.83
126 0.85
127 0.87
128 0.88
129 0.93
130 0.93
131 0.93
132 0.94
133 0.92
134 0.86
135 0.81
136 0.77
137 0.71
138 0.64
139 0.55
140 0.49
141 0.43
142 0.42
143 0.4
144 0.37
145 0.35
146 0.32
147 0.31
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.27
152 0.24
153 0.21
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.18
158 0.14
159 0.09
160 0.09
161 0.13
162 0.18
163 0.23
164 0.27
165 0.28
166 0.28
167 0.29
168 0.35
169 0.39
170 0.43
171 0.47
172 0.5
173 0.52
174 0.56
175 0.58
176 0.52
177 0.46
178 0.44
179 0.44
180 0.37
181 0.4
182 0.43
183 0.41
184 0.42
185 0.46
186 0.41
187 0.35
188 0.36
189 0.37
190 0.34
191 0.36
192 0.36
193 0.34
194 0.35
195 0.33
196 0.34
197 0.29
198 0.26
199 0.22
200 0.22
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.22
206 0.24
207 0.26
208 0.27
209 0.35
210 0.36
211 0.39
212 0.44
213 0.47
214 0.49
215 0.57
216 0.65
217 0.66
218 0.71
219 0.7
220 0.65
221 0.61
222 0.62
223 0.58
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.52
228 0.56
229 0.53
230 0.5
231 0.47
232 0.41
233 0.42
234 0.41
235 0.43
236 0.45
237 0.48
238 0.46
239 0.45
240 0.46
241 0.42
242 0.4
243 0.37
244 0.37
245 0.3
246 0.32
247 0.32
248 0.32
249 0.3
250 0.31
251 0.3
252 0.32
253 0.37
254 0.4
255 0.43
256 0.43
257 0.48
258 0.57
259 0.61
260 0.61
261 0.64
262 0.69
263 0.7
264 0.72
265 0.69
266 0.66
267 0.59
268 0.57
269 0.52
270 0.48
271 0.42
272 0.41
273 0.4
274 0.37
275 0.37
276 0.33
277 0.33
278 0.26
279 0.26
280 0.23
281 0.25
282 0.26
283 0.31
284 0.32
285 0.32
286 0.33
287 0.34
288 0.34
289 0.34
290 0.31
291 0.33
292 0.31
293 0.38
294 0.46
295 0.55
296 0.61
297 0.63
298 0.66
299 0.6
300 0.62
301 0.56
302 0.49
303 0.45
304 0.4
305 0.39
306 0.35
307 0.3
308 0.25
309 0.22
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.1
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.16
318 0.19
319 0.21
320 0.26
321 0.31
322 0.33
323 0.39
324 0.46
325 0.5
326 0.53
327 0.55
328 0.56
329 0.59
330 0.59
331 0.53
332 0.51
333 0.46
334 0.42
335 0.4
336 0.33
337 0.25
338 0.22
339 0.23
340 0.25
341 0.29
342 0.27
343 0.23
344 0.27
345 0.29
346 0.32
347 0.3
348 0.32
349 0.29
350 0.28
351 0.32
352 0.29
353 0.28
354 0.29
355 0.27
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.17
360 0.17
361 0.2
362 0.19
363 0.18
364 0.19
365 0.2
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.11
387 0.13
388 0.15
389 0.17
390 0.19
391 0.21
392 0.24
393 0.24
394 0.26
395 0.28
396 0.31
397 0.39
398 0.39
399 0.4
400 0.39
401 0.39
402 0.36
403 0.36
404 0.35
405 0.32
406 0.33
407 0.33
408 0.3
409 0.33
410 0.37
411 0.41
412 0.43
413 0.47
414 0.51
415 0.55
416 0.56
417 0.56
418 0.54
419 0.53
420 0.48
421 0.43
422 0.42
423 0.44
424 0.45
425 0.44
426 0.43
427 0.36
428 0.34
429 0.33
430 0.29
431 0.23
432 0.27
433 0.31
434 0.32
435 0.36
436 0.39
437 0.44
438 0.45
439 0.45
440 0.39
441 0.34
442 0.36
443 0.36
444 0.35
445 0.3
446 0.36
447 0.34
448 0.4
449 0.41
450 0.38
451 0.35
452 0.36
453 0.31
454 0.24
455 0.25
456 0.24
457 0.21
458 0.24
459 0.25
460 0.29
461 0.29
462 0.28
463 0.26
464 0.27
465 0.27
466 0.25
467 0.29
468 0.32
469 0.33
470 0.39
471 0.46
472 0.5
473 0.56
474 0.55
475 0.53
476 0.46
477 0.43
478 0.39
479 0.32
480 0.26
481 0.21
482 0.28
483 0.26
484 0.26
485 0.28
486 0.26
487 0.25
488 0.24
489 0.23
490 0.18
491 0.23
492 0.25
493 0.29
494 0.33
495 0.37
496 0.36
497 0.36
498 0.31
499 0.25
500 0.25
501 0.27
502 0.25
503 0.21
504 0.2
505 0.24
506 0.25
507 0.25
508 0.24
509 0.21
510 0.2
511 0.23
512 0.24
513 0.27
514 0.32
515 0.35
516 0.37
517 0.35
518 0.35
519 0.36
520 0.42
521 0.39
522 0.37
523 0.36
524 0.34
525 0.33
526 0.33
527 0.33
528 0.28
529 0.29
530 0.27
531 0.31
532 0.35
533 0.39
534 0.42
535 0.44
536 0.52
537 0.58
538 0.65
539 0.64
540 0.64
541 0.64
542 0.65
543 0.65
544 0.63
545 0.59
546 0.6
547 0.65
548 0.68
549 0.65
550 0.61
551 0.55
552 0.47
553 0.43
554 0.36
555 0.31
556 0.23
557 0.22
558 0.22
559 0.22
560 0.23
561 0.19
562 0.16
563 0.12
564 0.14
565 0.13
566 0.16
567 0.23
568 0.23
569 0.31
570 0.36
571 0.43
572 0.48
573 0.51
574 0.55
575 0.53
576 0.56
577 0.52
578 0.52
579 0.44
580 0.39
581 0.43
582 0.43
583 0.4
584 0.39
585 0.36
586 0.35
587 0.36
588 0.38
589 0.34
590 0.27
591 0.25
592 0.24
593 0.26
594 0.23
595 0.22
596 0.2
597 0.15
598 0.15
599 0.13
600 0.15
601 0.12
602 0.12
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.12
607 0.17
608 0.19
609 0.22
610 0.23
611 0.24
612 0.25
613 0.26
614 0.22
615 0.22
616 0.23
617 0.29
618 0.36
619 0.44
620 0.52
621 0.53
622 0.62
623 0.63
624 0.68
625 0.7
626 0.74
627 0.72
628 0.69
629 0.74
630 0.73
631 0.74
632 0.71
633 0.62
634 0.53
635 0.5
636 0.51
637 0.46
638 0.4
639 0.36
640 0.29
641 0.26
642 0.26
643 0.23
644 0.16
645 0.23
646 0.26
647 0.24
648 0.23
649 0.22
650 0.21
651 0.22
652 0.24
653 0.18
654 0.22
655 0.26
656 0.27
657 0.29
658 0.3
659 0.28
660 0.27
661 0.29
662 0.22
663 0.27
664 0.34
665 0.41
666 0.44
667 0.45
668 0.47
669 0.49
670 0.47
671 0.42
672 0.38
673 0.32
674 0.33
675 0.34
676 0.34
677 0.27
678 0.29
679 0.24
680 0.25
681 0.25
682 0.26
683 0.23
684 0.24
685 0.25
686 0.27
687 0.34
688 0.36
689 0.39
690 0.44
691 0.5
692 0.54
693 0.63
694 0.69
695 0.72
696 0.75
697 0.8
698 0.75
699 0.72
700 0.7
701 0.71
702 0.63
703 0.55
704 0.47
705 0.41
706 0.35
707 0.34
708 0.29
709 0.19
710 0.19
711 0.17
712 0.17
713 0.15
714 0.16
715 0.16
716 0.2
717 0.19
718 0.19
719 0.18
720 0.18
721 0.16
722 0.2
723 0.2
724 0.19
725 0.19
726 0.27
727 0.28
728 0.3
729 0.34
730 0.34
731 0.39
732 0.42
733 0.46
734 0.46
735 0.53
736 0.6
737 0.66
738 0.64
739 0.6
740 0.58
741 0.57
742 0.55
743 0.51
744 0.52
745 0.44
746 0.47
747 0.45
748 0.43
749 0.42
750 0.41
751 0.43
752 0.39
753 0.46
754 0.48
755 0.53
756 0.53
757 0.53
758 0.49
759 0.43
760 0.38
761 0.31
762 0.26
763 0.25
764 0.25
765 0.25
766 0.29
767 0.3
768 0.3
769 0.3
770 0.32
771 0.31
772 0.31
773 0.34
774 0.33
775 0.38
776 0.4
777 0.42
778 0.42
779 0.39
780 0.41
781 0.38
782 0.35
783 0.28
784 0.25
785 0.23
786 0.19
787 0.17
788 0.17
789 0.14
790 0.13
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.1
795 0.11
796 0.09
797 0.09
798 0.1
799 0.12
800 0.12
801 0.13
802 0.12
803 0.14
804 0.16
805 0.15
806 0.16
807 0.14
808 0.16
809 0.16
810 0.16
811 0.13
812 0.11
813 0.13
814 0.12
815 0.12
816 0.11
817 0.12
818 0.14
819 0.16
820 0.21
821 0.25
822 0.28
823 0.29
824 0.28
825 0.27
826 0.26
827 0.26
828 0.23
829 0.26
830 0.29
831 0.28
832 0.35
833 0.39
834 0.4
835 0.44
836 0.45
837 0.46
838 0.47
839 0.55
840 0.59
841 0.64
842 0.73
843 0.77
844 0.8
845 0.74
846 0.73
847 0.68
848 0.6
849 0.52
850 0.44
851 0.35
852 0.29
853 0.26
854 0.19
855 0.15
856 0.11
857 0.1
858 0.07
859 0.07
860 0.06
861 0.06
862 0.07
863 0.07
864 0.08
865 0.08
866 0.1
867 0.14
868 0.15
869 0.14
870 0.14
871 0.16
872 0.2
873 0.29
874 0.36
875 0.34
876 0.38
877 0.38
878 0.39
879 0.38
880 0.37
881 0.36
882 0.3
883 0.32
884 0.28
885 0.3
886 0.28
887 0.28
888 0.26
889 0.25
890 0.23
891 0.23
892 0.28
893 0.28
894 0.32
895 0.4
896 0.47
897 0.47
898 0.49
899 0.54
900 0.52
901 0.52
902 0.49
903 0.41
904 0.34
905 0.28
906 0.26
907 0.17
908 0.16
909 0.14
910 0.15
911 0.15
912 0.19
913 0.22
914 0.27
915 0.33
916 0.34
917 0.4
918 0.45
919 0.5
920 0.52
921 0.49
922 0.52
923 0.47
924 0.5
925 0.44
926 0.38
927 0.33
928 0.26
929 0.24
930 0.17
931 0.22
932 0.18
933 0.19
934 0.18
935 0.17
936 0.17
937 0.17
938 0.19
939 0.14
940 0.15
941 0.14
942 0.15
943 0.15
944 0.14
945 0.14
946 0.11
947 0.09
948 0.07
949 0.07
950 0.08
951 0.14
952 0.17
953 0.2
954 0.23
955 0.31
956 0.34
957 0.34
958 0.35
959 0.31
960 0.29
961 0.33
962 0.32
963 0.28
964 0.24
965 0.23
966 0.21
967 0.18
968 0.17
969 0.11
970 0.1
971 0.07
972 0.08
973 0.08
974 0.09
975 0.09
976 0.12
977 0.12
978 0.12
979 0.12
980 0.21
981 0.25
982 0.26
983 0.27
984 0.28
985 0.29
986 0.31
987 0.31
988 0.22
989 0.2
990 0.19
991 0.18
992 0.17
993 0.16
994 0.14
995 0.14
996 0.14
997 0.12
998 0.12
999 0.13
1000 0.09
1001 0.09
1002 0.1
1003 0.1
1004 0.1
1005 0.11
1006 0.11
1007 0.11
1008 0.12
1009 0.15
1010 0.14
1011 0.13
1012 0.17
1013 0.18
1014 0.19
1015 0.18
1016 0.2
1017 0.17
1018 0.19
1019 0.24
1020 0.2
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.2
1024 0.19
1025 0.21
1026 0.2
1027 0.22
1028 0.24
1029 0.23
1030 0.23
1031 0.22
1032 0.22
1033 0.22
1034 0.2
1035 0.13
1036 0.1
1037 0.11
1038 0.12
1039 0.12
1040 0.11
1041 0.16
1042 0.19
1043 0.22
1044 0.27
1045 0.31
1046 0.39
1047 0.44
1048 0.49
1049 0.5
1050 0.57
1051 0.6
1052 0.6
1053 0.63
1054 0.58
1055 0.54
1056 0.51
1057 0.46
1058 0.37
1059 0.33
1060 0.28
1061 0.2
1062 0.17
1063 0.16
1064 0.17
1065 0.19
1066 0.24
1067 0.31
1068 0.37
1069 0.42
1070 0.49
1071 0.56
1072 0.63
1073 0.71
1074 0.75
1075 0.76
1076 0.78
1077 0.79
1078 0.71
1079 0.65
1080 0.55
1081 0.43
1082 0.33
1083 0.24
1084 0.16
1085 0.09
1086 0.09
1087 0.08
1088 0.1
1089 0.13
1090 0.14
1091 0.14
1092 0.15
1093 0.16
1094 0.16
1095 0.16
1096 0.22
1097 0.2
1098 0.22
1099 0.23
1100 0.22
1101 0.23
1102 0.22
1103 0.21
1104 0.15
1105 0.13
1106 0.11
1107 0.1
1108 0.11
1109 0.1
1110 0.1
1111 0.09
1112 0.08
1113 0.09
1114 0.11
1115 0.12
1116 0.16
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.2
1120 0.22
1121 0.23
1122 0.23
1123 0.23
1124 0.21
1125 0.23
1126 0.22
1127 0.2
1128 0.19
1129 0.17
1130 0.15
1131 0.14
1132 0.13
1133 0.11
1134 0.12
1135 0.11
1136 0.11
1137 0.11
1138 0.13
1139 0.14
1140 0.14
1141 0.14
1142 0.15
1143 0.15
1144 0.17
1145 0.2
1146 0.24
1147 0.24
1148 0.25
1149 0.29
1150 0.3
1151 0.34
1152 0.35
1153 0.35