Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IIH8

Protein Details
Accession R0IIH8    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34ATIARNKKIKKARIEAMRIAHydrophilic
427-446ATAKAIREEEKRSKRGKKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-26RNKKIKKA
431-446AIREEEKRSKRGKKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MTTVKGNFVAEKKDATIARNKKIKKARIEAMRIASDELLAKARAAFENSQEYEGVVVEPMLSYESCDAASLPWCLKEQAREVPPMDVLNEEIDRFYAYAKPNEFEQTARQHVIQQVRALVRKALKKCDVEVFGSERNGIPFATSDIDLRLLWPSQVSRPSMARLPPTKRERGKGMAQLGWLYNGSLKHNRDYLLTSLRHARYPLVAAQDRQSGLDVQIVLSNDTSVSRDYMQRYMQEIPYLRSLYYVVKTIFDIRGLSDVFRGGFGSYSIFMMLVASLKHAPHQRQDAAGGLLNFLKFYSDFDAKAHGISIEPVELFDKVQHPVITNPVKISFKNGTAKPLPSYMLCLRDPADETNDLGRKGIAIKHVQTTFNALYTQLVMDLKTNTRASLLASLVGPVYMLNIERRKKLQDYGWRLQNSKHASLAATAKAIREEEKRSKRGKKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.4
4 0.43
5 0.51
6 0.57
7 0.59
8 0.62
9 0.7
10 0.74
11 0.74
12 0.75
13 0.75
14 0.76
15 0.81
16 0.78
17 0.75
18 0.69
19 0.6
20 0.52
21 0.43
22 0.34
23 0.27
24 0.21
25 0.18
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.16
30 0.16
31 0.19
32 0.2
33 0.21
34 0.29
35 0.3
36 0.31
37 0.28
38 0.26
39 0.22
40 0.21
41 0.17
42 0.09
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.16
61 0.18
62 0.2
63 0.23
64 0.26
65 0.33
66 0.35
67 0.38
68 0.39
69 0.38
70 0.37
71 0.33
72 0.28
73 0.2
74 0.17
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.15
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.25
89 0.29
90 0.29
91 0.25
92 0.28
93 0.29
94 0.31
95 0.32
96 0.31
97 0.3
98 0.35
99 0.39
100 0.36
101 0.31
102 0.32
103 0.34
104 0.36
105 0.33
106 0.33
107 0.32
108 0.37
109 0.4
110 0.43
111 0.45
112 0.45
113 0.47
114 0.49
115 0.46
116 0.4
117 0.39
118 0.35
119 0.31
120 0.29
121 0.27
122 0.21
123 0.19
124 0.18
125 0.14
126 0.1
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.13
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.23
147 0.25
148 0.27
149 0.3
150 0.33
151 0.37
152 0.44
153 0.49
154 0.56
155 0.56
156 0.58
157 0.57
158 0.55
159 0.56
160 0.53
161 0.51
162 0.43
163 0.39
164 0.36
165 0.31
166 0.26
167 0.2
168 0.13
169 0.11
170 0.1
171 0.13
172 0.18
173 0.19
174 0.21
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.24
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.22
183 0.28
184 0.28
185 0.28
186 0.26
187 0.24
188 0.18
189 0.19
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.2
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.18
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.1
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.22
224 0.21
225 0.19
226 0.22
227 0.21
228 0.18
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.11
267 0.16
268 0.19
269 0.23
270 0.29
271 0.29
272 0.29
273 0.3
274 0.28
275 0.24
276 0.24
277 0.19
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.06
285 0.08
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.19
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.16
311 0.25
312 0.27
313 0.26
314 0.26
315 0.28
316 0.3
317 0.28
318 0.33
319 0.28
320 0.3
321 0.37
322 0.36
323 0.39
324 0.41
325 0.43
326 0.39
327 0.38
328 0.33
329 0.25
330 0.31
331 0.27
332 0.29
333 0.27
334 0.26
335 0.25
336 0.26
337 0.28
338 0.24
339 0.24
340 0.2
341 0.22
342 0.27
343 0.29
344 0.26
345 0.24
346 0.22
347 0.18
348 0.2
349 0.22
350 0.21
351 0.23
352 0.26
353 0.32
354 0.36
355 0.36
356 0.34
357 0.38
358 0.33
359 0.29
360 0.26
361 0.2
362 0.17
363 0.17
364 0.16
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.12
369 0.15
370 0.16
371 0.21
372 0.22
373 0.2
374 0.2
375 0.2
376 0.2
377 0.22
378 0.2
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.14
384 0.12
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.08
389 0.14
390 0.22
391 0.27
392 0.32
393 0.37
394 0.42
395 0.45
396 0.5
397 0.52
398 0.56
399 0.61
400 0.65
401 0.71
402 0.69
403 0.67
404 0.64
405 0.63
406 0.6
407 0.53
408 0.46
409 0.39
410 0.34
411 0.37
412 0.39
413 0.32
414 0.28
415 0.26
416 0.25
417 0.26
418 0.27
419 0.27
420 0.28
421 0.35
422 0.42
423 0.51
424 0.59
425 0.66
426 0.75