Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2RTF6

Protein Details
Accession M2RTF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-312QDAGEKPKRRKGRLEFSQHTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-304KPKRRKGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_279574  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MATRKRNEYLDVEESEDDERGYDSEEESRARMLPASKRQKTDHDSEAEEDQEDDNEDAESQGDNDNAEDEEEDEPEPFASKSAELAHLEKLAASLPSELRLQSTKLGKVLPQSSLKKDKSGVIYLSRVPPFMKPAVLRSLLQPYGAVGRIFLTPESSTARTQRLRNGGTRRKLFLDGWVEFLHKRDAKFVAENLNAQTMGGKKRGRWHDEVWNIRYLSGVKWHNLVEQIQNENAERAARLRFEIAQGKKENKAFLENVERGKVVSGIEATRRKRGEDLDTDQNAPETTDVVQDAGEKPKRRKGRLEFSQHTATSKAMKKPEPGQDVNRVLSSMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.27
4 0.19
5 0.14
6 0.13
7 0.09
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.19
17 0.19
18 0.21
19 0.22
20 0.29
21 0.38
22 0.49
23 0.53
24 0.58
25 0.61
26 0.67
27 0.68
28 0.65
29 0.62
30 0.56
31 0.53
32 0.5
33 0.48
34 0.39
35 0.34
36 0.28
37 0.21
38 0.16
39 0.15
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.14
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.18
90 0.21
91 0.21
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.27
96 0.28
97 0.27
98 0.31
99 0.33
100 0.38
101 0.47
102 0.46
103 0.43
104 0.42
105 0.42
106 0.38
107 0.38
108 0.34
109 0.28
110 0.29
111 0.29
112 0.33
113 0.29
114 0.26
115 0.23
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.16
121 0.18
122 0.22
123 0.23
124 0.23
125 0.21
126 0.25
127 0.22
128 0.21
129 0.18
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.13
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.16
146 0.22
147 0.24
148 0.26
149 0.3
150 0.34
151 0.34
152 0.39
153 0.47
154 0.5
155 0.53
156 0.54
157 0.5
158 0.46
159 0.46
160 0.4
161 0.35
162 0.33
163 0.26
164 0.26
165 0.25
166 0.24
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.2
174 0.21
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.21
181 0.2
182 0.18
183 0.16
184 0.16
185 0.12
186 0.13
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.29
191 0.37
192 0.41
193 0.44
194 0.46
195 0.5
196 0.57
197 0.62
198 0.56
199 0.53
200 0.47
201 0.42
202 0.38
203 0.29
204 0.22
205 0.22
206 0.22
207 0.18
208 0.2
209 0.21
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.2
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.18
230 0.26
231 0.27
232 0.32
233 0.36
234 0.38
235 0.42
236 0.43
237 0.42
238 0.35
239 0.37
240 0.31
241 0.32
242 0.37
243 0.35
244 0.36
245 0.35
246 0.33
247 0.28
248 0.27
249 0.23
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.2
255 0.27
256 0.29
257 0.36
258 0.37
259 0.37
260 0.39
261 0.42
262 0.42
263 0.43
264 0.47
265 0.49
266 0.51
267 0.5
268 0.46
269 0.42
270 0.34
271 0.27
272 0.2
273 0.12
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.14
281 0.22
282 0.28
283 0.33
284 0.39
285 0.48
286 0.58
287 0.62
288 0.7
289 0.71
290 0.75
291 0.79
292 0.84
293 0.8
294 0.77
295 0.79
296 0.69
297 0.61
298 0.51
299 0.43
300 0.41
301 0.42
302 0.42
303 0.42
304 0.46
305 0.51
306 0.58
307 0.66
308 0.66
309 0.65
310 0.65
311 0.67
312 0.68
313 0.64
314 0.56