Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SHS7

Protein Details
Accession M2SHS7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-91SANNRRPPDRGRKPPVANQFAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008467  Dynein1_light_intermed_chain  
IPR022780  Dynein_light_int_chain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005868  C:cytoplasmic dynein complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0007018  P:microtubule-based movement  
KEGG bsc:COCSADRAFT_113603  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05783  DLIC  
Amino Acid Sequences MASARRIPNFPTRTPGSNDRPVTADADREEIWKPMLDNISSGKRLPEKSLLVLGGTPETQRDFLESVSTDSANNRRPPDRGRKPPVANQFALGYTYQDVLDTDHEDTLARLSLYLLANPSPSFTPLIKPYLNPRTLPHMLIVILLDWNHPWLWIRQLRDWIRVLRSLIVSLDDASKVVLEENIQTLQDKGRNLAAEGSSLESVKVPLGPGEWDEPLGIPLCIVCQNADKIETLEKERGWKEEEFDFILQYMRTILLKHGSSLVYTMPTAPGSLQTLIHSTLGIKSLLKQEQLRHNVTDRDRVLVPPNWDSWAKIRILREGFDVEGISEKWSVDIDIPNHMRPTNGQAPAPIEGEEQTNGETTPTPAPDEEDQGPTATSIYEETIRNPESDYALSSLSKQANGLEVSSKDPQAFLTEQVNVLEHLRREDESEAALKAARKEQEPVSRAWADDASGVVEEHIGPVQFNMGGIQVNADEMVKRLQDRQANRTDDPETPPPKTQDTNINDNEKLRSFFSSLVNKTPSSTPRGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.58
4 0.61
5 0.6
6 0.54
7 0.52
8 0.49
9 0.46
10 0.38
11 0.35
12 0.26
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.26
17 0.23
18 0.23
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.23
24 0.24
25 0.28
26 0.34
27 0.33
28 0.33
29 0.33
30 0.35
31 0.37
32 0.4
33 0.42
34 0.39
35 0.4
36 0.44
37 0.38
38 0.32
39 0.31
40 0.27
41 0.21
42 0.18
43 0.15
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.19
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.18
57 0.21
58 0.28
59 0.31
60 0.36
61 0.39
62 0.4
63 0.44
64 0.53
65 0.59
66 0.63
67 0.67
68 0.7
69 0.74
70 0.78
71 0.82
72 0.83
73 0.79
74 0.69
75 0.6
76 0.53
77 0.43
78 0.38
79 0.29
80 0.2
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.08
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.18
112 0.2
113 0.26
114 0.25
115 0.26
116 0.34
117 0.4
118 0.42
119 0.39
120 0.38
121 0.41
122 0.42
123 0.42
124 0.33
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.19
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.06
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.17
140 0.21
141 0.25
142 0.28
143 0.37
144 0.4
145 0.44
146 0.46
147 0.42
148 0.41
149 0.4
150 0.37
151 0.31
152 0.28
153 0.24
154 0.2
155 0.17
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.18
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.22
223 0.22
224 0.23
225 0.23
226 0.22
227 0.22
228 0.21
229 0.22
230 0.19
231 0.18
232 0.17
233 0.13
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.14
273 0.16
274 0.19
275 0.2
276 0.24
277 0.33
278 0.39
279 0.39
280 0.35
281 0.36
282 0.4
283 0.39
284 0.41
285 0.33
286 0.3
287 0.28
288 0.28
289 0.3
290 0.27
291 0.28
292 0.23
293 0.23
294 0.22
295 0.22
296 0.22
297 0.2
298 0.21
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.25
303 0.26
304 0.25
305 0.24
306 0.22
307 0.2
308 0.18
309 0.16
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.11
322 0.18
323 0.2
324 0.21
325 0.22
326 0.22
327 0.2
328 0.18
329 0.25
330 0.25
331 0.25
332 0.24
333 0.25
334 0.26
335 0.28
336 0.28
337 0.21
338 0.14
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.15
354 0.16
355 0.2
356 0.2
357 0.19
358 0.19
359 0.18
360 0.18
361 0.15
362 0.14
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.07
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.19
374 0.19
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.15
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.15
391 0.15
392 0.19
393 0.21
394 0.22
395 0.18
396 0.18
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.18
402 0.18
403 0.18
404 0.19
405 0.19
406 0.15
407 0.16
408 0.17
409 0.14
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.19
414 0.2
415 0.19
416 0.18
417 0.19
418 0.17
419 0.15
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.27
427 0.34
428 0.41
429 0.41
430 0.41
431 0.42
432 0.41
433 0.39
434 0.37
435 0.3
436 0.22
437 0.2
438 0.18
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.11
465 0.13
466 0.14
467 0.18
468 0.25
469 0.32
470 0.38
471 0.45
472 0.51
473 0.55
474 0.55
475 0.56
476 0.53
477 0.49
478 0.5
479 0.51
480 0.48
481 0.46
482 0.5
483 0.49
484 0.52
485 0.51
486 0.48
487 0.49
488 0.49
489 0.55
490 0.56
491 0.58
492 0.54
493 0.54
494 0.54
495 0.48
496 0.44
497 0.36
498 0.33
499 0.29
500 0.31
501 0.36
502 0.41
503 0.41
504 0.46
505 0.47
506 0.44
507 0.45
508 0.47
509 0.44