Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SWG4

Protein Details
Accession M2SWG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-53IDSLAGKQQAPKRQRKTKEAIKKELEQEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-42KRQRKTK
546-594GGGRGGSSARGGQNQRGRGQQGGGRGGAPRGGGPPAARGRGNIARTGRG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG bsc:COCSADRAFT_97802  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEALSGQLEELRLNSSKLNEDEGWIDSLAGKQQAPKRQRKTKEAIKKELEQEFLTPSRSFNTQWLNRFQQRWDAPTNYRSLFQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAIAAIEDEAIQQQETAQGKKTGGLDRVINFSAEGGLLEIPPGFTRGLDFRKKPATDSNVAQEVEDTLGQASAPADETKADEEADTDNLGANGLDVPEDGQDPGEEEIDALLPVEFPALAPHGPLAMGTARKGGREWAHMVDINRDITNFRELVPEMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQTFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKGMHKIVTADKKFIDSGWKDANDILSGKDKVKAPATNDSQAGRGGGGRGGSSARGGQNQRGRGQQGGGRGGAPRGGGPPAARGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQHLRIKDLLPACIFVFSKKRCEENAEALSNIDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLSREDRELPQIKRLRELLGRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIICAPGADEAPPAARLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHQGKVKLSEAELEKIKREPCDICDIDLEACHQSCEDYKRLTNEMHLSLLINPVGRRVFSKNRLIVYKKDNKRTAGMLMQDGTSRGNEPTVKVLEVAQHQDRKPDDLLPYLGPFAKFYRKLPNNPGDLILKTAFVPLNDIECFTKTTIDVPDSVQNLNRKKDTLKLAQDQFLPLCGSWDYEDWDEYDYSRINSLKFRELEEARKKEGLNAVSKECLRCPNFLKHFAMEHDQWLIKENIHALRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLGFVDEGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTDVEPTLTASLERGVAKIIQISEKVNEIQTKHQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLFQKMGTCQELIKRDICNCASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.25
4 0.26
5 0.32
6 0.28
7 0.29
8 0.3
9 0.29
10 0.28
11 0.22
12 0.21
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.22
19 0.29
20 0.38
21 0.47
22 0.57
23 0.64
24 0.72
25 0.8
26 0.83
27 0.86
28 0.88
29 0.89
30 0.89
31 0.88
32 0.85
33 0.84
34 0.82
35 0.77
36 0.7
37 0.6
38 0.52
39 0.48
40 0.43
41 0.38
42 0.31
43 0.26
44 0.25
45 0.26
46 0.26
47 0.27
48 0.35
49 0.39
50 0.45
51 0.52
52 0.58
53 0.63
54 0.65
55 0.61
56 0.6
57 0.58
58 0.58
59 0.56
60 0.54
61 0.52
62 0.54
63 0.57
64 0.49
65 0.45
66 0.41
67 0.37
68 0.32
69 0.29
70 0.33
71 0.3
72 0.35
73 0.36
74 0.37
75 0.36
76 0.39
77 0.38
78 0.37
79 0.38
80 0.37
81 0.37
82 0.38
83 0.39
84 0.39
85 0.39
86 0.35
87 0.34
88 0.3
89 0.29
90 0.31
91 0.27
92 0.24
93 0.23
94 0.21
95 0.17
96 0.19
97 0.2
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.21
110 0.26
111 0.29
112 0.35
113 0.4
114 0.45
115 0.51
116 0.59
117 0.6
118 0.59
119 0.59
120 0.58
121 0.54
122 0.5
123 0.46
124 0.37
125 0.32
126 0.27
127 0.24
128 0.18
129 0.14
130 0.14
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.13
155 0.16
156 0.17
157 0.2
158 0.23
159 0.23
160 0.27
161 0.32
162 0.31
163 0.31
164 0.33
165 0.33
166 0.33
167 0.37
168 0.34
169 0.29
170 0.23
171 0.2
172 0.17
173 0.13
174 0.11
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.1
186 0.16
187 0.24
188 0.32
189 0.34
190 0.39
191 0.48
192 0.49
193 0.5
194 0.53
195 0.52
196 0.49
197 0.51
198 0.5
199 0.47
200 0.47
201 0.43
202 0.34
203 0.28
204 0.24
205 0.2
206 0.13
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.18
273 0.22
274 0.22
275 0.26
276 0.29
277 0.26
278 0.29
279 0.32
280 0.32
281 0.3
282 0.3
283 0.27
284 0.24
285 0.21
286 0.18
287 0.17
288 0.2
289 0.16
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.19
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.21
298 0.21
299 0.18
300 0.19
301 0.17
302 0.16
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.18
352 0.19
353 0.21
354 0.23
355 0.26
356 0.26
357 0.3
358 0.38
359 0.38
360 0.47
361 0.47
362 0.52
363 0.53
364 0.54
365 0.61
366 0.52
367 0.46
368 0.43
369 0.43
370 0.37
371 0.33
372 0.32
373 0.2
374 0.19
375 0.17
376 0.1
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.08
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.16
461 0.22
462 0.26
463 0.29
464 0.34
465 0.37
466 0.4
467 0.45
468 0.41
469 0.41
470 0.46
471 0.52
472 0.51
473 0.51
474 0.49
475 0.45
476 0.46
477 0.4
478 0.33
479 0.31
480 0.35
481 0.33
482 0.33
483 0.34
484 0.3
485 0.3
486 0.29
487 0.22
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.14
492 0.14
493 0.15
494 0.19
495 0.28
496 0.27
497 0.26
498 0.25
499 0.26
500 0.25
501 0.25
502 0.27
503 0.18
504 0.22
505 0.25
506 0.25
507 0.24
508 0.24
509 0.25
510 0.18
511 0.17
512 0.14
513 0.13
514 0.14
515 0.15
516 0.18
517 0.19
518 0.2
519 0.24
520 0.26
521 0.24
522 0.32
523 0.35
524 0.34
525 0.34
526 0.32
527 0.29
528 0.26
529 0.23
530 0.14
531 0.11
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.06
539 0.07
540 0.09
541 0.09
542 0.14
543 0.15
544 0.2
545 0.25
546 0.29
547 0.31
548 0.31
549 0.32
550 0.28
551 0.28
552 0.24
553 0.24
554 0.22
555 0.2
556 0.17
557 0.16
558 0.15
559 0.15
560 0.13
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.13
567 0.15
568 0.17
569 0.16
570 0.16
571 0.2
572 0.25
573 0.26
574 0.24
575 0.23
576 0.23
577 0.23
578 0.25
579 0.21
580 0.18
581 0.18
582 0.14
583 0.14
584 0.13
585 0.15
586 0.19
587 0.19
588 0.18
589 0.18
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.17
594 0.11
595 0.11
596 0.14
597 0.15
598 0.14
599 0.17
600 0.17
601 0.18
602 0.18
603 0.17
604 0.17
605 0.16
606 0.17
607 0.13
608 0.14
609 0.13
610 0.15
611 0.14
612 0.12
613 0.18
614 0.18
615 0.24
616 0.25
617 0.28
618 0.26
619 0.32
620 0.34
621 0.34
622 0.38
623 0.32
624 0.3
625 0.28
626 0.27
627 0.21
628 0.17
629 0.1
630 0.05
631 0.04
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.08
638 0.1
639 0.11
640 0.09
641 0.1
642 0.11
643 0.14
644 0.15
645 0.12
646 0.11
647 0.12
648 0.14
649 0.13
650 0.15
651 0.14
652 0.18
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.29
657 0.35
658 0.34
659 0.4
660 0.4
661 0.38
662 0.39
663 0.39
664 0.33
665 0.29
666 0.3
667 0.25
668 0.23
669 0.22
670 0.19
671 0.18
672 0.15
673 0.13
674 0.11
675 0.07
676 0.05
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.06
694 0.08
695 0.06
696 0.07
697 0.06
698 0.06
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.08
706 0.07
707 0.06
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.1
718 0.12
719 0.18
720 0.19
721 0.23
722 0.24
723 0.25
724 0.3
725 0.34
726 0.37
727 0.39
728 0.4
729 0.37
730 0.41
731 0.4
732 0.35
733 0.3
734 0.25
735 0.18
736 0.15
737 0.15
738 0.09
739 0.1
740 0.09
741 0.08
742 0.09
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.11
751 0.09
752 0.1
753 0.08
754 0.07
755 0.07
756 0.06
757 0.05
758 0.04
759 0.04
760 0.03
761 0.04
762 0.04
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.08
770 0.08
771 0.1
772 0.13
773 0.13
774 0.14
775 0.17
776 0.18
777 0.19
778 0.19
779 0.2
780 0.19
781 0.21
782 0.2
783 0.2
784 0.24
785 0.29
786 0.32
787 0.37
788 0.36
789 0.38
790 0.38
791 0.36
792 0.32
793 0.25
794 0.22
795 0.15
796 0.13
797 0.09
798 0.07
799 0.06
800 0.05
801 0.06
802 0.06
803 0.07
804 0.09
805 0.11
806 0.13
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.18
812 0.17
813 0.2
814 0.19
815 0.2
816 0.21
817 0.2
818 0.19
819 0.17
820 0.17
821 0.14
822 0.14
823 0.13
824 0.13
825 0.15
826 0.15
827 0.16
828 0.18
829 0.18
830 0.15
831 0.2
832 0.2
833 0.22
834 0.26
835 0.24
836 0.23
837 0.26
838 0.28
839 0.24
840 0.25
841 0.23
842 0.22
843 0.3
844 0.29
845 0.27
846 0.26
847 0.26
848 0.22
849 0.21
850 0.19
851 0.12
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.08
856 0.12
857 0.16
858 0.18
859 0.2
860 0.22
861 0.26
862 0.28
863 0.28
864 0.29
865 0.29
866 0.27
867 0.24
868 0.22
869 0.19
870 0.17
871 0.18
872 0.15
873 0.12
874 0.1
875 0.12
876 0.13
877 0.12
878 0.14
879 0.19
880 0.28
881 0.33
882 0.42
883 0.43
884 0.47
885 0.53
886 0.54
887 0.53
888 0.54
889 0.58
890 0.58
891 0.63
892 0.64
893 0.6
894 0.59
895 0.56
896 0.5
897 0.44
898 0.38
899 0.31
900 0.27
901 0.24
902 0.22
903 0.2
904 0.16
905 0.12
906 0.11
907 0.09
908 0.12
909 0.12
910 0.13
911 0.17
912 0.18
913 0.18
914 0.17
915 0.18
916 0.18
917 0.2
918 0.24
919 0.25
920 0.3
921 0.3
922 0.35
923 0.35
924 0.35
925 0.34
926 0.33
927 0.29
928 0.26
929 0.28
930 0.24
931 0.24
932 0.21
933 0.22
934 0.18
935 0.17
936 0.17
937 0.23
938 0.24
939 0.26
940 0.35
941 0.4
942 0.47
943 0.55
944 0.59
945 0.55
946 0.54
947 0.54
948 0.46
949 0.39
950 0.36
951 0.27
952 0.2
953 0.16
954 0.18
955 0.16
956 0.13
957 0.15
958 0.12
959 0.15
960 0.15
961 0.16
962 0.14
963 0.15
964 0.17
965 0.14
966 0.15
967 0.12
968 0.15
969 0.16
970 0.16
971 0.16
972 0.17
973 0.21
974 0.22
975 0.23
976 0.24
977 0.29
978 0.33
979 0.38
980 0.37
981 0.34
982 0.35
983 0.41
984 0.45
985 0.46
986 0.49
987 0.52
988 0.54
989 0.56
990 0.55
991 0.5
992 0.43
993 0.35
994 0.28
995 0.19
996 0.17
997 0.13
998 0.13
999 0.12
1000 0.13
1001 0.15
1002 0.14
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.16
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.15
1009 0.13
1010 0.13
1011 0.16
1012 0.17
1013 0.17
1014 0.22
1015 0.25
1016 0.3
1017 0.3
1018 0.32
1019 0.36
1020 0.39
1021 0.47
1022 0.52
1023 0.53
1024 0.49
1025 0.52
1026 0.49
1027 0.46
1028 0.49
1029 0.44
1030 0.41
1031 0.4
1032 0.39
1033 0.4
1034 0.42
1035 0.39
1036 0.35
1037 0.39
1038 0.34
1039 0.35
1040 0.38
1041 0.44
1042 0.48
1043 0.53
1044 0.54
1045 0.48
1046 0.48
1047 0.47
1048 0.47
1049 0.38
1050 0.33
1051 0.31
1052 0.29
1053 0.26
1054 0.27
1055 0.24
1056 0.19
1057 0.19
1058 0.22
1059 0.23
1060 0.23
1061 0.24
1062 0.21
1063 0.23
1064 0.23
1065 0.24
1066 0.22
1067 0.2
1068 0.22
1069 0.21
1070 0.23
1071 0.2
1072 0.2
1073 0.18
1074 0.16
1075 0.16
1076 0.19
1077 0.23
1078 0.21
1079 0.23
1080 0.24
1081 0.26
1082 0.25
1083 0.26
1084 0.24
1085 0.2
1086 0.23
1087 0.21
1088 0.21
1089 0.19
1090 0.18
1091 0.15
1092 0.14
1093 0.14
1094 0.13
1095 0.13
1096 0.13
1097 0.14
1098 0.16
1099 0.18
1100 0.19
1101 0.2
1102 0.22
1103 0.22
1104 0.23
1105 0.25
1106 0.25
1107 0.24
1108 0.22
1109 0.22
1110 0.17
1111 0.17
1112 0.16
1113 0.13
1114 0.11
1115 0.09
1116 0.07
1117 0.07
1118 0.07
1119 0.06
1120 0.05
1121 0.04
1122 0.04
1123 0.05
1124 0.04
1125 0.04
1126 0.05
1127 0.06
1128 0.06
1129 0.06
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.06
1133 0.06
1134 0.06
1135 0.04
1136 0.04
1137 0.05
1138 0.05
1139 0.05
1140 0.06
1141 0.05
1142 0.08
1143 0.08
1144 0.12
1145 0.14
1146 0.15
1147 0.15
1148 0.16
1149 0.18
1150 0.18
1151 0.18
1152 0.15
1153 0.13
1154 0.13
1155 0.16
1156 0.15
1157 0.13
1158 0.13
1159 0.13
1160 0.14
1161 0.17
1162 0.17
1163 0.17
1164 0.19
1165 0.21
1166 0.21
1167 0.23
1168 0.24
1169 0.24
1170 0.27
1171 0.26
1172 0.32
1173 0.38
1174 0.39
1175 0.37
1176 0.36
1177 0.36
1178 0.32
1179 0.35
1180 0.31
1181 0.25
1182 0.22
1183 0.22
1184 0.21
1185 0.19
1186 0.19
1187 0.14
1188 0.14
1189 0.15
1190 0.17
1191 0.17
1192 0.19
1193 0.18
1194 0.19
1195 0.25
1196 0.23
1197 0.24
1198 0.23
1199 0.26
1200 0.23
1201 0.23
1202 0.22
1203 0.16
1204 0.14
1205 0.1
1206 0.11
1207 0.17
1208 0.22
1209 0.23
1210 0.26
1211 0.26
1212 0.28
1213 0.28
1214 0.28
1215 0.21
1216 0.17
1217 0.16
1218 0.13
1219 0.14
1220 0.12
1221 0.11
1222 0.12
1223 0.1
1224 0.09
1225 0.1
1226 0.1
1227 0.11
1228 0.16
1229 0.17
1230 0.19
1231 0.24
1232 0.29
1233 0.35
1234 0.38
1235 0.38
1236 0.36
1237 0.39
1238 0.43
1239 0.44
1240 0.42
1241 0.37
1242 0.36
1243 0.38
1244 0.4
1245 0.36
1246 0.28
1247 0.26
1248 0.29
1249 0.27
1250 0.26
1251 0.24
1252 0.24
1253 0.3
1254 0.31
1255 0.29
1256 0.26
1257 0.34
1258 0.39
1259 0.4
1260 0.39
1261 0.37
1262 0.37
1263 0.44
1264 0.43
1265 0.39