FuNGI

M2SHD1

Protein Details

Accession

M2SHD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-57	TGERVKKAFTLHRSRHRRTRSAEILL	Hydrophilic
1226-1255	EMDAKRAKTKAARERRQERIQQKRQAQLGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1123-1151	RARARELNAARRIGRHRGFGKRKGTKDAR
1203-1244	KRALVEHIHKAKAEKARERVIKEEMDAKRAKTKAARERRQER

Subcellular Location(s)

plas 22, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035970 60S_ribosomal_L19/L19e_sf IPR000196 Ribosomal_L19/L19e IPR023638 Ribosomal_L19/L19e_CS IPR015972 Ribosomal_L19/L19e_dom1 IPR033935 Ribosomal_L19_euka
Gene Ontology	GO:0022625 C:cytosolic large ribosomal subunit GO:0016020 C:membrane GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
KEGG	bsc:COCSADRAFT_85440 -
Pfam	View protein in Pfam PF13515 FUSC_2 PF01280 Ribosomal_L19e
PROSITE	View protein in PROSITE PS00526 RIBOSOMAL_L19E
CDD	cd01417 Ribosomal_L19e_E

Amino Acid Sequences

MLTMESETSQSPAQRRFMRPSMRSATMIQPRTGERVKKAFTLHRSRHRRTRSAEILLAPGQFETERYREMSRKELLVEMIKYKFRQGYAYATSQTGIGILKCSLAYVLGSLATFVPFIAALLGRNDGKHIVATITVYFHPARSAGSMLEAVMLAFAAFLYAAVISFSSMAVSAYFGNNDLLVVGHVIVLIVFCGGGLGLVGWTKQRLGNPLVNVACSLTSLALITILTKEGAVQAATFSYVKIWQVLKMVIMGCGASTAVSLLVKPTSARSEFRDTFIKSTDAMAEMLNGIALSFLSGSEQDLKSDSYVKASDRLQTTFKALLKNLGEAKFEHYALGTEAEYKINARLVKCVETLMQSLGGLRSAAETQFTLLAQPAPGEAASQPMPTNGTVTSSIFSEQAMSQSPPQLISPTLRHSDRRGSILASIDELPESSEASAICSAAESDDESNPVNQMLARSINLSKSNLTPADIFSVFIAQLGPPMKSLAYTLREVLSELPFGPGPEYNMAINEHFRHSLVDAKALFADARREALSGIYTNKIPTRTSSAAVAADFEEVAASCGYFSSSLIDFAEDMVGFLDILEELKSNVNRYPRQRTYNWLKFWKTRHKKSHSGDDSEVANFMQETDPQTVGGSREIHNPIYRKSTRGDPYKSENEQPLSYRIWTSLAVFRRDDLKYAVKVGIGAVLWAMWSFIQSTRGYYSRWRGEWGLLSYMLVCSMTIGASNTTGYQRFAGTCLGALLAIAAWIAADEHALLLGFFGWLISLFCFYIIVGKGKGPMGRFILLTYNLSALYAYSLSVKDDDDDDDEGGISPEIWEIVIHRVVAVMVGCLWGIIVTRVIWPISARRKLKKGTSLLWLKMGLIWKRGPLKTVLESNEHTSRTQSFMSEREEIELRRYLSHLETLRVAAAAEFELRGPFPNKSFQIILGATSRLLDSFHAMNVVILRELKASDGEKEALRYTKKEWTELSWRISHLFSVMASSMKLAYPLNDVLPNIEHTRDRLLARVFEFRQQDLGKTIATDEDYELLYAYALVTGQLAHDLNVIGQEIEKLYGVLSEEDLKLQVNLRTQKRLAASVVGCGKRKIWLDPNEVSEIANANSRQTVRKLVQDGLIIRKPVTMHSRARARELNAARRIGRHRGFGKRKGTKDARMPRYAITFQIVWMRRLRVLRRLLVKYRAAGKIDKHLYHELYLLSKGNTFKHKRALVEHIHKAKAEKARERVIKEEMDAKRAKTKAARERRQERIQQKRQAQLGDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.51
3	0.58
4	0.64
5	0.7
6	0.66
7	0.7
8	0.68
9	0.64
10	0.61
11	0.56
12	0.56
13	0.55
14	0.56
15	0.48
16	0.45
17	0.43
18	0.47
19	0.51
20	0.48
21	0.46
22	0.51
23	0.53
24	0.54
25	0.58
26	0.6
27	0.62
28	0.67
29	0.69
30	0.71
31	0.78
32	0.82
33	0.86
34	0.87
35	0.86
36	0.82
37	0.83
38	0.81
39	0.78
40	0.74
41	0.66
42	0.61
43	0.54
44	0.47
45	0.37
46	0.27
47	0.21
48	0.16
49	0.16
50	0.17
51	0.17
52	0.19
53	0.22
54	0.28
55	0.33
56	0.36
57	0.42
58	0.41
59	0.41
60	0.41
61	0.4
62	0.38
63	0.39
64	0.38
65	0.36
66	0.36
67	0.38
68	0.36
69	0.39
70	0.39
71	0.34
72	0.35
73	0.33
74	0.36
75	0.38
76	0.42
77	0.38
78	0.35
79	0.34
80	0.3
81	0.26
82	0.19
83	0.15
84	0.11
85	0.11
86	0.1
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.09
109	0.13
110	0.13
111	0.13
112	0.15
113	0.15
114	0.15
115	0.14
116	0.14
117	0.11
118	0.11
119	0.13
120	0.12
121	0.14
122	0.13
123	0.16
124	0.15
125	0.15
126	0.15
127	0.14
128	0.15
129	0.14
130	0.15
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.09
138	0.07
139	0.07
140	0.04
141	0.04
142	0.03
143	0.03
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.03
179	0.02
180	0.03
181	0.02
182	0.02
183	0.02
184	0.03
185	0.03
186	0.04
187	0.05
188	0.06
189	0.07
190	0.09
191	0.11
192	0.14
193	0.19
194	0.24
195	0.29
196	0.3
197	0.37
198	0.36
199	0.34
200	0.31
201	0.27
202	0.21
203	0.16
204	0.15
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.1
229	0.14
230	0.15
231	0.15
232	0.18
233	0.18
234	0.17
235	0.19
236	0.18
237	0.15
238	0.14
239	0.12
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.1
254	0.15
255	0.18
256	0.21
257	0.25
258	0.34
259	0.36
260	0.39
261	0.43
262	0.39
263	0.39
264	0.39
265	0.35
266	0.26
267	0.25
268	0.23
269	0.17
270	0.16
271	0.13
272	0.11
273	0.1
274	0.09
275	0.07
276	0.06
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.06
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.14
291	0.15
292	0.19
293	0.18
294	0.16
295	0.18
296	0.18
297	0.21
298	0.22
299	0.27
300	0.26
301	0.28
302	0.27
303	0.26
304	0.29
305	0.3
306	0.31
307	0.3
308	0.27
309	0.31
310	0.3
311	0.33
312	0.35
313	0.31
314	0.3
315	0.26
316	0.3
317	0.27
318	0.26
319	0.21
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.15
324	0.11
325	0.09
326	0.1
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.13
332	0.16
333	0.15
334	0.19
335	0.21
336	0.23
337	0.23
338	0.23
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.16
343	0.14
344	0.11
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.08
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.06
368	0.08
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.1
373	0.12
374	0.11
375	0.12
376	0.09
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.12
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.11
389	0.12
390	0.12
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.15
395	0.14
396	0.14
397	0.16
398	0.18
399	0.19
400	0.24
401	0.25
402	0.27
403	0.3
404	0.37
405	0.36
406	0.36
407	0.33
408	0.29
409	0.29
410	0.29
411	0.26
412	0.19
413	0.17
414	0.14
415	0.13
416	0.11
417	0.1
418	0.07
419	0.07
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.06
431	0.05
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.09
445	0.11
446	0.12
447	0.15
448	0.17
449	0.17
450	0.17
451	0.17
452	0.2
453	0.18
454	0.19
455	0.16
456	0.15
457	0.18
458	0.16
459	0.15
460	0.11
461	0.12
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.05
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.12
475	0.14
476	0.15
477	0.15
478	0.15
479	0.16
480	0.16
481	0.17
482	0.13
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.09
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.12
498	0.12
499	0.13
500	0.12
501	0.13
502	0.12
503	0.12
504	0.18
505	0.16
506	0.19
507	0.17
508	0.17
509	0.17
510	0.17
511	0.16
512	0.1
513	0.12
514	0.08
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.11
526	0.13
527	0.14
528	0.13
529	0.14
530	0.2
531	0.2
532	0.21
533	0.21
534	0.2
535	0.2
536	0.19
537	0.18
538	0.11
539	0.09
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.04
544	0.05
545	0.04
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.05
561	0.05
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.04
572	0.07
573	0.07
574	0.09
575	0.11
576	0.17
577	0.22
578	0.28
579	0.37
580	0.41
581	0.46
582	0.46
583	0.52
584	0.56
585	0.6
586	0.6
587	0.57
588	0.55
589	0.55
590	0.61
591	0.64
592	0.64
593	0.65
594	0.69
595	0.7
596	0.76
597	0.75
598	0.79
599	0.72
600	0.68
601	0.59
602	0.5
603	0.44
604	0.34
605	0.3
606	0.19
607	0.14
608	0.08
609	0.08
610	0.06
611	0.05
612	0.07
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.12
620	0.11
621	0.1
622	0.16
623	0.17
624	0.19
625	0.21
626	0.22
627	0.21
628	0.28
629	0.28
630	0.24
631	0.25
632	0.32
633	0.36
634	0.42
635	0.44
636	0.39
637	0.45
638	0.51
639	0.51
640	0.45
641	0.41
642	0.36
643	0.33
644	0.31
645	0.27
646	0.21
647	0.2
648	0.17
649	0.14
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.15
654	0.18
655	0.2
656	0.2
657	0.2
658	0.23
659	0.23
660	0.23
661	0.21
662	0.21
663	0.19
664	0.21
665	0.21
666	0.16
667	0.15
668	0.14
669	0.12
670	0.08
671	0.07
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.02
678	0.03
679	0.04
680	0.05
681	0.08
682	0.09
683	0.1
684	0.13
685	0.14
686	0.15
687	0.19
688	0.25
689	0.27
690	0.27
691	0.29
692	0.27
693	0.27
694	0.3
695	0.28
696	0.22
697	0.17
698	0.16
699	0.14
700	0.13
701	0.11
702	0.07
703	0.05
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.05
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.08
715	0.08
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.1
721	0.08
722	0.08
723	0.07
724	0.07
725	0.06
726	0.05
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.02
731	0.02
732	0.02
733	0.02
734	0.02
735	0.02
736	0.02
737	0.02
738	0.02
739	0.02
740	0.03
741	0.02
742	0.02
743	0.03
744	0.02
745	0.02
746	0.02
747	0.02
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.05
755	0.05
756	0.08
757	0.09
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.12
762	0.14
763	0.16
764	0.14
765	0.16
766	0.17
767	0.17
768	0.17
769	0.16
770	0.17
771	0.16
772	0.17
773	0.14
774	0.12
775	0.1
776	0.1
777	0.09
778	0.06
779	0.06
780	0.05
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.08
786	0.08
787	0.07
788	0.08
789	0.09
790	0.1
791	0.11
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.07
798	0.05
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.03
804	0.04
805	0.07
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.08
811	0.09
812	0.07
813	0.05
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.04
818	0.04
819	0.03
820	0.03
821	0.04
822	0.04
823	0.05
824	0.06
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.08
829	0.15
830	0.24
831	0.32
832	0.37
833	0.42
834	0.49
835	0.54
836	0.6
837	0.61
838	0.58
839	0.54
840	0.57
841	0.58
842	0.52
843	0.49
844	0.42
845	0.34
846	0.3
847	0.32
848	0.25
849	0.22
850	0.22
851	0.24
852	0.3
853	0.31
854	0.3
855	0.27
856	0.3
857	0.3
858	0.35
859	0.33
860	0.3
861	0.32
862	0.35
863	0.37
864	0.34
865	0.3
866	0.26
867	0.25
868	0.24
869	0.23
870	0.19
871	0.17
872	0.19
873	0.24
874	0.25
875	0.23
876	0.23
877	0.25
878	0.24
879	0.25
880	0.25
881	0.22
882	0.2
883	0.2
884	0.19
885	0.18
886	0.24
887	0.22
888	0.2
889	0.2
890	0.19
891	0.19
892	0.17
893	0.16
894	0.09
895	0.08
896	0.07
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.06
901	0.07
902	0.09
903	0.11
904	0.13
905	0.14
906	0.21
907	0.22
908	0.25
909	0.26
910	0.23
911	0.26
912	0.24
913	0.24
914	0.19
915	0.18
916	0.15
917	0.14
918	0.14
919	0.09
920	0.09
921	0.08
922	0.09
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.09
927	0.1
928	0.11
929	0.11
930	0.09
931	0.08
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.11
937	0.11
938	0.12
939	0.15
940	0.16
941	0.16
942	0.18
943	0.2
944	0.23
945	0.24
946	0.24
947	0.25
948	0.31
949	0.32
950	0.34
951	0.34
952	0.34
953	0.41
954	0.45
955	0.46
956	0.41
957	0.4
958	0.38
959	0.37
960	0.31
961	0.22
962	0.17
963	0.12
964	0.11
965	0.11
966	0.09
967	0.09
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.1
972	0.08
973	0.09
974	0.12
975	0.13
976	0.15
977	0.15
978	0.15
979	0.16
980	0.17
981	0.19
982	0.17
983	0.18
984	0.17
985	0.17
986	0.21
987	0.24
988	0.23
989	0.25
990	0.26
991	0.28
992	0.3
993	0.37
994	0.33
995	0.36
996	0.38
997	0.33
998	0.37
999	0.34
1000	0.33
1001	0.27
1002	0.27
1003	0.21
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.13
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.11
1013	0.11
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.07
1017	0.06
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.04
1021	0.04
1022	0.04
1023	0.04
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.08
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.06
1040	0.07
1041	0.08
1042	0.08
1043	0.09
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.13
1048	0.12
1049	0.12
1050	0.14
1051	0.16
1052	0.21
1053	0.29
1054	0.33
1055	0.4
1056	0.4
1057	0.44
1058	0.44
1059	0.44
1060	0.39
1061	0.37
1062	0.33
1063	0.32
1064	0.4
1065	0.39
1066	0.38
1067	0.35
1068	0.35
1069	0.33
1070	0.35
1071	0.36
1072	0.37
1073	0.41
1074	0.47
1075	0.51
1076	0.54
1077	0.52
1078	0.5
1079	0.43
1080	0.34
1081	0.28
1082	0.21
1083	0.22
1084	0.18
1085	0.15
1086	0.19
1087	0.21
1088	0.23
1089	0.24
1090	0.32
1091	0.3
1092	0.37
1093	0.39
1094	0.38
1095	0.4
1096	0.41
1097	0.42
1098	0.42
1099	0.43
1100	0.37
1101	0.33
1102	0.33
1103	0.3
1104	0.31
1105	0.35
1106	0.34
1107	0.36
1108	0.44
1109	0.52
1110	0.52
1111	0.59
1112	0.58
1113	0.54
1114	0.57
1115	0.58
1116	0.6
1117	0.57
1118	0.6
1119	0.55
1120	0.56
1121	0.59
1122	0.59
1123	0.55
1124	0.54
1125	0.55
1126	0.61
1127	0.69
1128	0.71
1129	0.76
1130	0.76
1131	0.77
1132	0.79
1133	0.79
1134	0.76
1135	0.78
1136	0.8
1137	0.78
1138	0.74
1139	0.71
1140	0.64
1141	0.63
1142	0.56
1143	0.48
1144	0.41
1145	0.33
1146	0.28
1147	0.35
1148	0.34
1149	0.3
1150	0.33
1151	0.34
1152	0.35
1153	0.42
1154	0.46
1155	0.45
1156	0.51
1157	0.55
1158	0.6
1159	0.65
1160	0.67
1161	0.68
1162	0.67
1163	0.63
1164	0.63
1165	0.61
1166	0.55
1167	0.52
1168	0.48
1169	0.51
1170	0.55
1171	0.51
1172	0.49
1173	0.5
1174	0.49
1175	0.46
1176	0.44
1177	0.36
1178	0.3
1179	0.3
1180	0.27
1181	0.21
1182	0.23
1183	0.24
1184	0.28
1185	0.37
1186	0.41
1187	0.44
1188	0.52
1189	0.56
1190	0.57
1191	0.6
1192	0.63
1193	0.64
1194	0.67
1195	0.7
1196	0.68
1197	0.66
1198	0.63
1199	0.59
1200	0.57
1201	0.55
1202	0.55
1203	0.54
1204	0.54
1205	0.61
1206	0.67
1207	0.69
1208	0.67
1209	0.65
1210	0.58
1211	0.52
1212	0.54
1213	0.46
1214	0.47
1215	0.46
1216	0.44
1217	0.46
1218	0.44
1219	0.48
1220	0.46
1221	0.54
1222	0.57
1223	0.65
1224	0.72
1225	0.74
1226	0.82
1227	0.86
1228	0.88
1229	0.88
1230	0.88
1231	0.88
1232	0.88
1233	0.88
1234	0.87
1235	0.85
1236	0.81
1237	0.75

M2SHD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer