FuNGI

M2S5L4

Protein Details

Accession

M2S5L4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
370-394	LTFPANPPQKPRRQRKDGKEWAERE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
379-400	KPRRQRKDGKEWAEREEPTGRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	bsc:COCSADRAFT_94178 -
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDITKFVTAYRESAFLIGDYNTYRDQLARRLRIVNKKLGRATPKNAKYAAKAPVTTEEIQKNSEALHLLLLNSERAWAQAMAMKASHSEDNADKNITGSTRKHIISRLHKAVVYANQVVQLVSDTSASGASDTDVLEARAYAYVMAGAQEFEKQAEGTKSKNASPERWALCLKNYSAARVIYSALFKATKKDLFKEVLAGTTDPSIRYAAYQSRIPRTVGVPSVAIKYFPQDDANLVEAVQKLDSAALEEEKAAASHSQVTWRGRAANVVDAAIGQALASVDTASLVLDETATSSTSPKDRANAYDDILIASQDAVDATRRAIEELEKEGVDEGDSRMQDLRVTNLAVNYDLISWRVGRNRVLIGKDDGLTFPANPPQKPRRQRKDGKEWAEREEPTGRKLARLRERTALYDAILQSIDSVKDLRGAARDTDFIAELDGQRAYFQALKCLNLSHSYAFLSTPKQALALCSRALGLASQAASAPRSESPSTTKAPKLQVTEEQAQTLKKALENLNSHYRGVVALSQLSANSETASKPGLANAAPVVERLNEYPSSGSVDLKNLVTWPPKLKPVPVKPLFLDVAWNYIEYPGRIPPVQQAEAQKAPVEEKKEEKAPAKKGWFSFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.16
3	0.16
4	0.13
5	0.14
6	0.13
7	0.16
8	0.16
9	0.16
10	0.17
11	0.19
12	0.22
13	0.29
14	0.38
15	0.41
16	0.45
17	0.53
18	0.61
19	0.68
20	0.71
21	0.72
22	0.69
23	0.71
24	0.73
25	0.72
26	0.74
27	0.71
28	0.74
29	0.74
30	0.73
31	0.71
32	0.7
33	0.65
34	0.61
35	0.6
36	0.58
37	0.53
38	0.48
39	0.44
40	0.45
41	0.47
42	0.44
43	0.43
44	0.41
45	0.37
46	0.38
47	0.36
48	0.3
49	0.25
50	0.25
51	0.2
52	0.14
53	0.15
54	0.14
55	0.13
56	0.15
57	0.15
58	0.14
59	0.12
60	0.13
61	0.1
62	0.1
63	0.13
64	0.1
65	0.1
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.15
70	0.14
71	0.13
72	0.16
73	0.16
74	0.13
75	0.16
76	0.18
77	0.23
78	0.25
79	0.25
80	0.22
81	0.22
82	0.23
83	0.22
84	0.24
85	0.21
86	0.24
87	0.29
88	0.3
89	0.32
90	0.37
91	0.45
92	0.5
93	0.57
94	0.59
95	0.55
96	0.55
97	0.53
98	0.52
99	0.48
100	0.43
101	0.35
102	0.29
103	0.28
104	0.27
105	0.26
106	0.21
107	0.16
108	0.11
109	0.09
110	0.09
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.05
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.11
142	0.15
143	0.17
144	0.18
145	0.24
146	0.26
147	0.28
148	0.35
149	0.36
150	0.34
151	0.38
152	0.44
153	0.4
154	0.42
155	0.42
156	0.36
157	0.37
158	0.37
159	0.33
160	0.31
161	0.29
162	0.28
163	0.29
164	0.27
165	0.24
166	0.2
167	0.21
168	0.15
169	0.16
170	0.14
171	0.12
172	0.14
173	0.14
174	0.17
175	0.21
176	0.25
177	0.26
178	0.29
179	0.33
180	0.34
181	0.34
182	0.34
183	0.3
184	0.26
185	0.25
186	0.22
187	0.17
188	0.16
189	0.16
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.1
195	0.13
196	0.15
197	0.17
198	0.21
199	0.24
200	0.29
201	0.31
202	0.31
203	0.3
204	0.27
205	0.28
206	0.25
207	0.22
208	0.17
209	0.17
210	0.19
211	0.17
212	0.16
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.11
219	0.12
220	0.14
221	0.15
222	0.13
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.1
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.08
245	0.11
246	0.16
247	0.17
248	0.18
249	0.19
250	0.2
251	0.18
252	0.2
253	0.18
254	0.16
255	0.15
256	0.14
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.08
261	0.07
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.07
283	0.08
284	0.11
285	0.11
286	0.14
287	0.15
288	0.17
289	0.21
290	0.22
291	0.21
292	0.2
293	0.19
294	0.17
295	0.15
296	0.13
297	0.08
298	0.06
299	0.05
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.12
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.11
328	0.12
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.13
344	0.15
345	0.15
346	0.18
347	0.21
348	0.24
349	0.24
350	0.24
351	0.23
352	0.22
353	0.22
354	0.2
355	0.16
356	0.14
357	0.14
358	0.12
359	0.1
360	0.14
361	0.17
362	0.17
363	0.25
364	0.32
365	0.41
366	0.51
367	0.61
368	0.66
369	0.73
370	0.83
371	0.85
372	0.88
373	0.88
374	0.87
375	0.85
376	0.77
377	0.72
378	0.68
379	0.58
380	0.5
381	0.47
382	0.4
383	0.32
384	0.36
385	0.3
386	0.29
387	0.33
388	0.39
389	0.42
390	0.47
391	0.49
392	0.49
393	0.51
394	0.49
395	0.48
396	0.39
397	0.3
398	0.28
399	0.25
400	0.19
401	0.17
402	0.14
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.07
407	0.08
408	0.07
409	0.1
410	0.11
411	0.12
412	0.13
413	0.15
414	0.16
415	0.17
416	0.17
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.12
421	0.11
422	0.11
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.09
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.12
431	0.11
432	0.17
433	0.19
434	0.2
435	0.21
436	0.22
437	0.22
438	0.21
439	0.23
440	0.16
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.16
453	0.19
454	0.19
455	0.18
456	0.17
457	0.17
458	0.16
459	0.16
460	0.13
461	0.09
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.11
470	0.1
471	0.15
472	0.15
473	0.17
474	0.22
475	0.27
476	0.31
477	0.34
478	0.37
479	0.38
480	0.43
481	0.46
482	0.44
483	0.44
484	0.46
485	0.48
486	0.51
487	0.46
488	0.42
489	0.39
490	0.35
491	0.32
492	0.28
493	0.23
494	0.17
495	0.22
496	0.24
497	0.3
498	0.33
499	0.38
500	0.45
501	0.45
502	0.44
503	0.38
504	0.35
505	0.27
506	0.24
507	0.21
508	0.12
509	0.11
510	0.12
511	0.12
512	0.12
513	0.13
514	0.13
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.11
520	0.13
521	0.12
522	0.11
523	0.12
524	0.14
525	0.13
526	0.14
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.16
536	0.14
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.21
541	0.2
542	0.21
543	0.19
544	0.21
545	0.23
546	0.22
547	0.22
548	0.17
549	0.22
550	0.24
551	0.27
552	0.3
553	0.32
554	0.4
555	0.42
556	0.49
557	0.55
558	0.6
559	0.67
560	0.65
561	0.66
562	0.6
563	0.63
564	0.56
565	0.46
566	0.42
567	0.32
568	0.3
569	0.25
570	0.24
571	0.18
572	0.19
573	0.21
574	0.16
575	0.18
576	0.18
577	0.22
578	0.22
579	0.23
580	0.28
581	0.34
582	0.35
583	0.38
584	0.39
585	0.42
586	0.45
587	0.45
588	0.4
589	0.33
590	0.36
591	0.37
592	0.37
593	0.35
594	0.37
595	0.43
596	0.47
597	0.52
598	0.56
599	0.6
600	0.62
601	0.66
602	0.69
603	0.7
604	0.65

M2S5L4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer