Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SHC5

Protein Details
Accession M2SHC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-184VYEARVMKKRHKHKPARLRRADAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-199KGAKRRRGGAHEVYEARVMKKRHKHKPARLRRADAGGFQRHDPAAKKRQRA
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5, extr 5, plas 2, golg 2, mito 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
KEGG bsc:COCSADRAFT_121814  -  
Amino Acid Sequences MRRFETLNPETKDLVLCLLPALATSFGVADPVDIIPQDIRMRAWDCERRDHIKEETENDPRNWGVQFIKDLMAISRLKKGDLATFQADLYAKCALHEPKHPWCRLNDIRELKDEYEHPERKNQVEVVEPSSSSSTDSYFEELVELDEAKGAKRRRGGAHEVYEARVMKKRHKHKPARLRRADAGGFQRHDPAAKKRQRASNTPNDARRMANRGNRPVLTDEDDDDGDISSVRSAHTRSLLAHPAPAFSLSPGPRASSTCEVDASNESLAVQKLQAELDVAEAELKAARLKYQYIQAKEQAEARQMHGDGGALGDAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.19
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.07
14 0.08
15 0.08
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.12
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.18
28 0.21
29 0.23
30 0.31
31 0.35
32 0.36
33 0.45
34 0.51
35 0.53
36 0.55
37 0.57
38 0.53
39 0.53
40 0.54
41 0.49
42 0.5
43 0.52
44 0.52
45 0.47
46 0.46
47 0.37
48 0.36
49 0.31
50 0.27
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.22
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.24
67 0.24
68 0.26
69 0.29
70 0.25
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.12
79 0.11
80 0.17
81 0.18
82 0.21
83 0.27
84 0.32
85 0.39
86 0.48
87 0.5
88 0.47
89 0.46
90 0.52
91 0.53
92 0.52
93 0.51
94 0.49
95 0.49
96 0.51
97 0.52
98 0.43
99 0.38
100 0.34
101 0.3
102 0.33
103 0.35
104 0.33
105 0.37
106 0.39
107 0.38
108 0.4
109 0.35
110 0.27
111 0.27
112 0.28
113 0.25
114 0.23
115 0.21
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.12
137 0.13
138 0.16
139 0.19
140 0.24
141 0.26
142 0.32
143 0.38
144 0.39
145 0.42
146 0.43
147 0.4
148 0.36
149 0.35
150 0.3
151 0.25
152 0.23
153 0.21
154 0.24
155 0.33
156 0.42
157 0.49
158 0.6
159 0.69
160 0.74
161 0.84
162 0.88
163 0.9
164 0.87
165 0.82
166 0.74
167 0.69
168 0.6
169 0.53
170 0.49
171 0.42
172 0.37
173 0.32
174 0.31
175 0.25
176 0.27
177 0.26
178 0.27
179 0.32
180 0.38
181 0.44
182 0.49
183 0.57
184 0.59
185 0.65
186 0.65
187 0.65
188 0.68
189 0.68
190 0.67
191 0.62
192 0.59
193 0.52
194 0.47
195 0.43
196 0.4
197 0.4
198 0.43
199 0.46
200 0.5
201 0.48
202 0.47
203 0.43
204 0.4
205 0.37
206 0.31
207 0.26
208 0.22
209 0.22
210 0.19
211 0.17
212 0.14
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.22
226 0.28
227 0.26
228 0.29
229 0.26
230 0.24
231 0.23
232 0.22
233 0.17
234 0.12
235 0.19
236 0.16
237 0.19
238 0.19
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.27
243 0.27
244 0.29
245 0.27
246 0.28
247 0.26
248 0.26
249 0.27
250 0.23
251 0.17
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.13
275 0.15
276 0.18
277 0.21
278 0.3
279 0.38
280 0.41
281 0.46
282 0.49
283 0.5
284 0.49
285 0.51
286 0.45
287 0.44
288 0.4
289 0.38
290 0.38
291 0.35
292 0.34
293 0.29
294 0.25
295 0.18
296 0.17