Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SXE0

Protein Details
Accession M2SXE0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-270EDVDHNHRPKRRKVDKNDPQTHDYBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_110326  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVAYPDSASDDEGTEHDKTLVHPVQPAHPPTKPAAAAAAKPKPNPSNALPPLPPAFHDLYAVNARVSTSDNPDLHGGRRRAVPHIQGNWPSHVYLEWIPTQRESIALLNLIQHVKTVFELENTKRVKKLPVPEDITPSLQSDLGVPLPLHVSLSRTLQIKTEDRETFLDTLGASLRRCAVPAFNFEFQGLKWVPNFERNRWFLVLAIKRPENDELNTLLHACNQAAKNTGHPALYTSGAGDGPMEDVDHNHRPKRRKVDKNDPQTHDYSPYFHVSIAWNLTEPDAEWTALIERIDATEYIQTPGAMLDAVKVRIGNAVHNIPLAAKRPGLGKSGRAGLGLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.24
9 0.27
10 0.25
11 0.28
12 0.29
13 0.35
14 0.41
15 0.45
16 0.41
17 0.39
18 0.41
19 0.4
20 0.45
21 0.38
22 0.32
23 0.34
24 0.32
25 0.34
26 0.4
27 0.45
28 0.43
29 0.44
30 0.51
31 0.48
32 0.48
33 0.49
34 0.45
35 0.48
36 0.49
37 0.53
38 0.46
39 0.46
40 0.46
41 0.41
42 0.36
43 0.31
44 0.29
45 0.23
46 0.24
47 0.2
48 0.21
49 0.24
50 0.24
51 0.19
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.18
56 0.16
57 0.18
58 0.25
59 0.25
60 0.26
61 0.29
62 0.3
63 0.31
64 0.37
65 0.32
66 0.28
67 0.33
68 0.33
69 0.35
70 0.39
71 0.43
72 0.42
73 0.46
74 0.49
75 0.51
76 0.51
77 0.49
78 0.45
79 0.37
80 0.3
81 0.24
82 0.21
83 0.17
84 0.17
85 0.19
86 0.2
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.08
107 0.1
108 0.16
109 0.17
110 0.25
111 0.27
112 0.28
113 0.28
114 0.29
115 0.32
116 0.33
117 0.41
118 0.39
119 0.44
120 0.48
121 0.48
122 0.51
123 0.47
124 0.43
125 0.34
126 0.3
127 0.22
128 0.17
129 0.15
130 0.1
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.19
148 0.2
149 0.21
150 0.26
151 0.23
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.22
156 0.19
157 0.17
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.16
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.17
177 0.21
178 0.16
179 0.13
180 0.12
181 0.15
182 0.16
183 0.24
184 0.28
185 0.26
186 0.34
187 0.35
188 0.38
189 0.36
190 0.35
191 0.28
192 0.33
193 0.33
194 0.28
195 0.31
196 0.29
197 0.28
198 0.3
199 0.31
200 0.26
201 0.22
202 0.21
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.1
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.17
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.24
219 0.19
220 0.18
221 0.19
222 0.17
223 0.18
224 0.15
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.12
237 0.2
238 0.24
239 0.29
240 0.35
241 0.42
242 0.51
243 0.62
244 0.67
245 0.7
246 0.76
247 0.82
248 0.86
249 0.9
250 0.91
251 0.85
252 0.79
253 0.72
254 0.63
255 0.58
256 0.49
257 0.4
258 0.33
259 0.32
260 0.27
261 0.24
262 0.24
263 0.2
264 0.22
265 0.22
266 0.19
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.08
295 0.07
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.21
306 0.23
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.24
312 0.24
313 0.21
314 0.19
315 0.2
316 0.24
317 0.26
318 0.3
319 0.3
320 0.3
321 0.33
322 0.38
323 0.38