FuNGI

M2SVV8

Protein Details

Accession

M2SVV8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-59	QQPQPSQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQ	Hydrophilic
517-536	SGNHKPGEPKSKKRPGSPNL	Basic
538-564	EASGNESSRKKHKKKHHDKLADGSRKS	Basic
578-602	SEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-56	RRRRPRPQADVLRKPRR
185-186	RK
199-208	GMKKPPAFHK
520-561	HKPGEPKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHDKLADGS
584-597	GKKRKKEKKEKNRI

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	bsc:COCSADRAFT_39674 -

Amino Acid Sequences

MNGAMNRSQPPTAAPVAPVASNGQQPLQQPQPSQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQNITKPMVSLSQMNEARKPPPGPAADGTHSKDALRQEYLDQGATVFPLIVSRKDLKELRHHVMRLQSKSHVDITDEKQFTPPIKLHRRDPRAPPSGIGSHYEEEDTKEDLEEIKERERIEQQKEERRKVREENQAKIAPTGMKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDYENKQTWVGTYESELSETHVMLSATRPGDPNTAIQMAPMERWYRFNVKGKIKPTNDDVDKILAKVESGGPRFFAELERRQAQRMKAEDEARMFSGVRTRVGGGADDEGRIKRERFDDDTIGFVKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDEQLIAQKEEEERRAAEETRAMEKITRKTLAKREKQYDYLDSDPENPYLTESESDTDSETERQQAKEEAEKKAAEQNGKAPEAGNVPSGASTKGSNTPSGNHKPGEPKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHDKLADGSRKSTLGNLKGAGSGSDSEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGSPAGTPGASRAGSPAANGSRAGSPSAGPSKPSLPSAKEIYESLPPQGMNIQNLILKFKGRVDKSNTQVFIKLVKAVSRFDKAKSWLTPLEKLPSDEHINAFMSAANAPKPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.25
4	0.25
5	0.23
6	0.21
7	0.2
8	0.21
9	0.22
10	0.2
11	0.21
12	0.23
13	0.29
14	0.34
15	0.35
16	0.34
17	0.4
18	0.49
19	0.51
20	0.52
21	0.51
22	0.53
23	0.59
24	0.68
25	0.71
26	0.71
27	0.76
28	0.84
29	0.88
30	0.89
31	0.9
32	0.88
33	0.88
34	0.9
35	0.91
36	0.91
37	0.92
38	0.92
39	0.85
40	0.82
41	0.79
42	0.79
43	0.74
44	0.74
45	0.74
46	0.74
47	0.78
48	0.77
49	0.71
50	0.6
51	0.55
52	0.48
53	0.38
54	0.31
55	0.26
56	0.31
57	0.33
58	0.35
59	0.38
60	0.38
61	0.38
62	0.41
63	0.39
64	0.33
65	0.36
66	0.36
67	0.37
68	0.38
69	0.42
70	0.4
71	0.44
72	0.45
73	0.41
74	0.39
75	0.34
76	0.33
77	0.32
78	0.33
79	0.29
80	0.27
81	0.25
82	0.3
83	0.31
84	0.28
85	0.23
86	0.19
87	0.16
88	0.15
89	0.13
90	0.08
91	0.06
92	0.09
93	0.11
94	0.12
95	0.17
96	0.21
97	0.22
98	0.3
99	0.34
100	0.35
101	0.44
102	0.5
103	0.53
104	0.56
105	0.55
106	0.52
107	0.57
108	0.6
109	0.54
110	0.51
111	0.49
112	0.44
113	0.47
114	0.47
115	0.38
116	0.33
117	0.35
118	0.37
119	0.41
120	0.39
121	0.36
122	0.34
123	0.36
124	0.34
125	0.33
126	0.31
127	0.32
128	0.42
129	0.46
130	0.54
131	0.62
132	0.69
133	0.71
134	0.77
135	0.76
136	0.73
137	0.69
138	0.61
139	0.56
140	0.52
141	0.46
142	0.4
143	0.33
144	0.27
145	0.26
146	0.26
147	0.21
148	0.2
149	0.2
150	0.18
151	0.14
152	0.13
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.2
159	0.23
160	0.23
161	0.26
162	0.33
163	0.38
164	0.41
165	0.47
166	0.52
167	0.59
168	0.68
169	0.73
170	0.72
171	0.7
172	0.71
173	0.7
174	0.71
175	0.72
176	0.69
177	0.66
178	0.66
179	0.65
180	0.58
181	0.5
182	0.43
183	0.37
184	0.32
185	0.34
186	0.3
187	0.34
188	0.34
189	0.38
190	0.46
191	0.52
192	0.55
193	0.53
194	0.6
195	0.62
196	0.71
197	0.78
198	0.76
199	0.74
200	0.78
201	0.77
202	0.72
203	0.68
204	0.64
205	0.59
206	0.63
207	0.62
208	0.61
209	0.58
210	0.57
211	0.57
212	0.6
213	0.61
214	0.56
215	0.52
216	0.52
217	0.54
218	0.51
219	0.48
220	0.42
221	0.35
222	0.3
223	0.26
224	0.2
225	0.17
226	0.18
227	0.21
228	0.28
229	0.27
230	0.27
231	0.26
232	0.26
233	0.25
234	0.24
235	0.18
236	0.09
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.12
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.13
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.15
259	0.16
260	0.15
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.12
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.14
269	0.17
270	0.21
271	0.26
272	0.35
273	0.41
274	0.47
275	0.53
276	0.56
277	0.62
278	0.58
279	0.55
280	0.51
281	0.51
282	0.44
283	0.4
284	0.35
285	0.3
286	0.28
287	0.25
288	0.22
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.15
301	0.16
302	0.2
303	0.25
304	0.29
305	0.29
306	0.31
307	0.35
308	0.34
309	0.35
310	0.33
311	0.32
312	0.32
313	0.33
314	0.33
315	0.31
316	0.29
317	0.23
318	0.21
319	0.18
320	0.13
321	0.16
322	0.14
323	0.13
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.1
334	0.09
335	0.1
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.15
340	0.18
341	0.22
342	0.26
343	0.27
344	0.26
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.2
349	0.15
350	0.12
351	0.09
352	0.1
353	0.08
354	0.09
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.02
378	0.02
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.1
389	0.14
390	0.14
391	0.16
392	0.23
393	0.25
394	0.25
395	0.25
396	0.26
397	0.24
398	0.28
399	0.29
400	0.24
401	0.22
402	0.22
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.12
407	0.09
408	0.14
409	0.15
410	0.17
411	0.16
412	0.17
413	0.19
414	0.21
415	0.23
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.19
420	0.18
421	0.17
422	0.17
423	0.18
424	0.2
425	0.2
426	0.18
427	0.19
428	0.24
429	0.27
430	0.29
431	0.3
432	0.29
433	0.35
434	0.45
435	0.52
436	0.56
437	0.6
438	0.62
439	0.63
440	0.66
441	0.63
442	0.58
443	0.53
444	0.46
445	0.39
446	0.33
447	0.31
448	0.28
449	0.24
450	0.21
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.13
455	0.11
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.17
466	0.19
467	0.19
468	0.2
469	0.22
470	0.24
471	0.3
472	0.34
473	0.32
474	0.33
475	0.33
476	0.33
477	0.35
478	0.37
479	0.3
480	0.27
481	0.3
482	0.31
483	0.32
484	0.31
485	0.25
486	0.23
487	0.23
488	0.23
489	0.18
490	0.12
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.11
498	0.17
499	0.18
500	0.2
501	0.21
502	0.24
503	0.32
504	0.38
505	0.4
506	0.35
507	0.37
508	0.42
509	0.48
510	0.55
511	0.55
512	0.58
513	0.65
514	0.74
515	0.76
516	0.76
517	0.8
518	0.77
519	0.79
520	0.75
521	0.71
522	0.63
523	0.59
524	0.5
525	0.4
526	0.39
527	0.31
528	0.26
529	0.24
530	0.25
531	0.28
532	0.38
533	0.49
534	0.51
535	0.57
536	0.68
537	0.74
538	0.83
539	0.9
540	0.91
541	0.9
542	0.87
543	0.88
544	0.88
545	0.85
546	0.75
547	0.66
548	0.56
549	0.47
550	0.42
551	0.37
552	0.33
553	0.28
554	0.31
555	0.3
556	0.28
557	0.29
558	0.29
559	0.23
560	0.18
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.12
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.16
569	0.21
570	0.28
571	0.32
572	0.38
573	0.48
574	0.57
575	0.67
576	0.73
577	0.79
578	0.82
579	0.87
580	0.93
581	0.92
582	0.92
583	0.84
584	0.77
585	0.7
586	0.63
587	0.55
588	0.45
589	0.35
590	0.26
591	0.23
592	0.19
593	0.13
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.21
603	0.19
604	0.2
605	0.2
606	0.2
607	0.21
608	0.21
609	0.22
610	0.17
611	0.15
612	0.2
613	0.27
614	0.25
615	0.24
616	0.26
617	0.28
618	0.3
619	0.34
620	0.33
621	0.3
622	0.35
623	0.38
624	0.38
625	0.36
626	0.35
627	0.32
628	0.34
629	0.32
630	0.29
631	0.27
632	0.24
633	0.23
634	0.28
635	0.29
636	0.23
637	0.23
638	0.23
639	0.22
640	0.23
641	0.25
642	0.2
643	0.19
644	0.19
645	0.24
646	0.31
647	0.33
648	0.41
649	0.47
650	0.55
651	0.59
652	0.67
653	0.63
654	0.56
655	0.55
656	0.49
657	0.44
658	0.36
659	0.35
660	0.28
661	0.3
662	0.3
663	0.32
664	0.36
665	0.4
666	0.4
667	0.39
668	0.44
669	0.44
670	0.5
671	0.49
672	0.5
673	0.49
674	0.52
675	0.55
676	0.52
677	0.56
678	0.5
679	0.49
680	0.45
681	0.44
682	0.45
683	0.42
684	0.39
685	0.34
686	0.33
687	0.3
688	0.28
689	0.22
690	0.17
691	0.16
692	0.17

M2SVV8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer