Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D2H5

Protein Details
Accession B0D2H5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
493-524DIPCMCKSCRDNPPVPRRRRCNCSGPQCNPENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
452-455SKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, cyto 5, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_315480  -  
lbc:LACBIDRAFT_315481  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18785  SF2_C  
Amino Acid Sequences MSDSPFLQASTNPAAHAQLGANTDSDPTLYDTPDGHALVRGLLKALPYDPHDYIISGICPILDGRDLLATLVTGGGKTGYFVMLMIVISAIAKDPSCAGSRKTFPKDPAMVIICPTKALQETMSASIIELGLSTLVINGDTYLSALQVQRDLWKEACQKFTMILLSPEELSSAGFSSLLDNPEFSAHLCGLGMDEAHLIYWWGRSFRPMFQQIGLVRARMPLRNGHRIPVVAVTATLRVGEPMACICKVLGLIPGKYHFLRRSNVRNDIQLIFRELQSGLGGYNFPELDWLLGEHDNTIVFCKTISLGFKVACYLWAKASHLPDRSKHIRMFNSLNWQSYNSDTLGFLNNNNQQSSITIATDTLSVGWDSKFTRNAVILGEPNDIDEFLQKIGRIGRNRAAVPSPRAFLYYSRGALASARAVVDSVDKSGSTNRHSTDMQNGDSTGDTAKKSKRKAPIKDGSESLMDITMACLLLAQCISKAIDEPYDNPIDDIPCMCKSCRDNPPVPRRRRCNCSGPQCNPENTPGSSVARLAKNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.23
4 0.18
5 0.15
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.13
13 0.11
14 0.13
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.18
20 0.22
21 0.22
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.19
35 0.24
36 0.24
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.23
42 0.19
43 0.14
44 0.13
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.1
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.24
87 0.32
88 0.41
89 0.47
90 0.51
91 0.52
92 0.58
93 0.59
94 0.53
95 0.53
96 0.48
97 0.4
98 0.37
99 0.36
100 0.27
101 0.24
102 0.22
103 0.17
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.1
116 0.07
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.14
137 0.17
138 0.19
139 0.19
140 0.25
141 0.33
142 0.35
143 0.38
144 0.35
145 0.33
146 0.31
147 0.32
148 0.26
149 0.19
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.12
192 0.15
193 0.18
194 0.25
195 0.27
196 0.27
197 0.26
198 0.32
199 0.28
200 0.31
201 0.28
202 0.21
203 0.18
204 0.2
205 0.21
206 0.17
207 0.19
208 0.21
209 0.26
210 0.36
211 0.36
212 0.35
213 0.34
214 0.33
215 0.32
216 0.27
217 0.21
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.19
245 0.18
246 0.21
247 0.24
248 0.29
249 0.38
250 0.41
251 0.48
252 0.46
253 0.44
254 0.43
255 0.41
256 0.36
257 0.27
258 0.25
259 0.18
260 0.16
261 0.16
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.23
307 0.26
308 0.3
309 0.32
310 0.32
311 0.38
312 0.42
313 0.43
314 0.43
315 0.44
316 0.42
317 0.44
318 0.47
319 0.42
320 0.47
321 0.44
322 0.41
323 0.35
324 0.34
325 0.3
326 0.27
327 0.25
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.13
335 0.17
336 0.22
337 0.23
338 0.23
339 0.22
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.17
344 0.12
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.14
358 0.17
359 0.17
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.18
366 0.17
367 0.18
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.1
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.17
380 0.23
381 0.26
382 0.3
383 0.35
384 0.39
385 0.4
386 0.41
387 0.4
388 0.39
389 0.42
390 0.4
391 0.35
392 0.3
393 0.31
394 0.29
395 0.26
396 0.26
397 0.25
398 0.22
399 0.22
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.2
404 0.15
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.16
417 0.2
418 0.21
419 0.26
420 0.26
421 0.3
422 0.31
423 0.32
424 0.37
425 0.37
426 0.35
427 0.31
428 0.3
429 0.27
430 0.25
431 0.24
432 0.17
433 0.15
434 0.14
435 0.19
436 0.27
437 0.33
438 0.39
439 0.46
440 0.54
441 0.62
442 0.7
443 0.75
444 0.77
445 0.76
446 0.75
447 0.7
448 0.62
449 0.54
450 0.44
451 0.34
452 0.24
453 0.18
454 0.12
455 0.11
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.1
466 0.11
467 0.1
468 0.12
469 0.12
470 0.17
471 0.19
472 0.21
473 0.25
474 0.27
475 0.27
476 0.26
477 0.26
478 0.22
479 0.21
480 0.21
481 0.19
482 0.2
483 0.23
484 0.23
485 0.28
486 0.32
487 0.41
488 0.49
489 0.53
490 0.58
491 0.66
492 0.77
493 0.8
494 0.86
495 0.86
496 0.87
497 0.88
498 0.87
499 0.84
500 0.84
501 0.84
502 0.84
503 0.85
504 0.82
505 0.81
506 0.79
507 0.76
508 0.68
509 0.64
510 0.58
511 0.48
512 0.45
513 0.4
514 0.37
515 0.34
516 0.34
517 0.35