Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SSS5

Protein Details
Accession M2SSS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-350GHSRKSSVAPGSKKKKDRRKSQAGLASPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-341KSSVAPGSKKKKDRRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG bsc:COCSADRAFT_40337  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MPPPLPPPDEQEFDQPQLIGGLPTPDLHAGNNLFWYFTSSPWFDSECINIDVYLNLRQNDPAVAEKIMNDPKLWQQRLDDQPEGTQYVIAGEGQGEGHPWLLQRQHKVRVTENDKERIENFVEGNWYTHGTKMLMAPSLLDIVQSRMLTVSTRMHQMAELSKNMTHWTPATGYSYFPPSYETAKATTIASRVGSPTLAPTDADAPGSQSQGPGVATQATDSAASATDFSDALFMHSLNLTNAYGDEYMDENPLKGEPGAFVFEGTKTAVTARNKAQEQQAIQAVQPAPAAPTDLKIDTATPSVAPSVVATPKAVATPGAMEGHSRKSSVAPGSKKKKDRRKSQAGLASPTTPSVPQAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.35
3 0.29
4 0.26
5 0.25
6 0.16
7 0.12
8 0.12
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.23
23 0.19
24 0.19
25 0.23
26 0.21
27 0.22
28 0.24
29 0.27
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.23
54 0.26
55 0.25
56 0.22
57 0.22
58 0.3
59 0.39
60 0.4
61 0.35
62 0.34
63 0.43
64 0.5
65 0.55
66 0.49
67 0.4
68 0.4
69 0.4
70 0.38
71 0.28
72 0.2
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.15
89 0.2
90 0.28
91 0.34
92 0.43
93 0.47
94 0.5
95 0.54
96 0.58
97 0.6
98 0.6
99 0.6
100 0.6
101 0.55
102 0.54
103 0.48
104 0.42
105 0.36
106 0.29
107 0.23
108 0.16
109 0.18
110 0.16
111 0.17
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.12
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.15
256 0.17
257 0.23
258 0.27
259 0.34
260 0.35
261 0.38
262 0.42
263 0.41
264 0.4
265 0.4
266 0.39
267 0.32
268 0.3
269 0.33
270 0.28
271 0.23
272 0.21
273 0.17
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.09
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.12
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.11
302 0.09
303 0.1
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.15
308 0.17
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.21
313 0.22
314 0.28
315 0.34
316 0.4
317 0.42
318 0.52
319 0.62
320 0.71
321 0.79
322 0.83
323 0.86
324 0.88
325 0.9
326 0.9
327 0.91
328 0.89
329 0.9
330 0.88
331 0.83
332 0.79
333 0.72
334 0.63
335 0.53
336 0.46
337 0.37
338 0.28