Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2TF02

Protein Details
Accession M2TF02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-464FLGNHHTQGKRRVKKGKQQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-353GRKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG bsc:COCSADRAFT_168983  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRRKFIDKKTAINFRLVHRAQNDPRIHDEDAPQMVFAETVAPNQREVSEPAGSSRASQYSAATGRSKIKSRRDLESEYGSKVRNNEGEAANYGIFYDDTEYDYMQHMRDLGSGGGDAYFVEAKQEKKGKQKMDLADMLRDASLNDSKSQADMSVSSNISSVSDFFGEDMAPSEFVRKTTYQDQQNIPDALSGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDEEDIFNELAQDGYEIDQREWDASADFDDDERDPMDRFLDEEDPGWETDDTIKASSPKVKATKASEDSTDPSSLPAPDAAPAPADAEDMAYLKEFKKFKEDVKAAKPNKPTDAPADTQSFITGASALTSGGRKKKRKGAMTSTSGYSMSSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEEYANDDIFDFPDDASMVSGMSKMSGMTGMSQWSSSQAPPLLRSDFDSIMDDFLGNHHTQGKRRVKKGKQQTGLEQLDEVRKGLGAPIVKPKDHFSVLKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.6
3 0.63
4 0.55
5 0.52
6 0.45
7 0.54
8 0.52
9 0.58
10 0.59
11 0.52
12 0.58
13 0.56
14 0.55
15 0.49
16 0.46
17 0.43
18 0.42
19 0.38
20 0.31
21 0.27
22 0.24
23 0.2
24 0.17
25 0.14
26 0.1
27 0.14
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.22
38 0.23
39 0.25
40 0.24
41 0.23
42 0.24
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.23
48 0.25
49 0.27
50 0.26
51 0.27
52 0.33
53 0.38
54 0.46
55 0.48
56 0.55
57 0.61
58 0.63
59 0.68
60 0.67
61 0.68
62 0.65
63 0.66
64 0.58
65 0.52
66 0.52
67 0.44
68 0.4
69 0.36
70 0.36
71 0.3
72 0.3
73 0.31
74 0.29
75 0.3
76 0.29
77 0.29
78 0.24
79 0.2
80 0.18
81 0.13
82 0.11
83 0.09
84 0.1
85 0.08
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.09
109 0.12
110 0.13
111 0.2
112 0.28
113 0.31
114 0.41
115 0.49
116 0.51
117 0.56
118 0.63
119 0.6
120 0.6
121 0.61
122 0.53
123 0.47
124 0.42
125 0.35
126 0.27
127 0.22
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.13
165 0.17
166 0.24
167 0.32
168 0.35
169 0.41
170 0.43
171 0.44
172 0.48
173 0.44
174 0.37
175 0.31
176 0.25
177 0.19
178 0.16
179 0.13
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.03
216 0.04
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.09
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.17
259 0.17
260 0.21
261 0.25
262 0.26
263 0.3
264 0.34
265 0.41
266 0.4
267 0.4
268 0.35
269 0.34
270 0.34
271 0.31
272 0.28
273 0.19
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.22
300 0.24
301 0.28
302 0.37
303 0.42
304 0.44
305 0.52
306 0.61
307 0.58
308 0.62
309 0.64
310 0.57
311 0.57
312 0.52
313 0.45
314 0.41
315 0.42
316 0.37
317 0.34
318 0.34
319 0.3
320 0.27
321 0.25
322 0.19
323 0.14
324 0.12
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.08
332 0.13
333 0.21
334 0.3
335 0.36
336 0.43
337 0.52
338 0.6
339 0.67
340 0.72
341 0.74
342 0.74
343 0.74
344 0.7
345 0.62
346 0.54
347 0.45
348 0.36
349 0.27
350 0.18
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.18
364 0.18
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.19
369 0.2
370 0.18
371 0.15
372 0.18
373 0.16
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.17
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.11
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.17
410 0.19
411 0.21
412 0.23
413 0.28
414 0.27
415 0.26
416 0.29
417 0.3
418 0.27
419 0.26
420 0.27
421 0.23
422 0.21
423 0.21
424 0.17
425 0.12
426 0.12
427 0.14
428 0.12
429 0.13
430 0.19
431 0.23
432 0.28
433 0.39
434 0.49
435 0.54
436 0.64
437 0.73
438 0.76
439 0.83
440 0.89
441 0.89
442 0.87
443 0.85
444 0.84
445 0.84
446 0.77
447 0.68
448 0.58
449 0.51
450 0.47
451 0.41
452 0.32
453 0.22
454 0.19
455 0.18
456 0.19
457 0.19
458 0.16
459 0.19
460 0.3
461 0.35
462 0.36
463 0.38
464 0.41
465 0.44
466 0.46