FuNGI

M2SSH0

Protein Details

Accession

M2SSH0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
173-197	PDVAGNRQREPRRRQPPKKDFLDYG	Hydrophilic
309-328	RSRYRSRSPGHNNRRRREAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
183-188	PRRRQP
224-247	RRGPRRNGRDTRNERDNRGRGRGD
274-277	KEPR
322-323	RR

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019416 NCBP3
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000340 F:RNA 7-methylguanosine cap binding
KEGG	bsc:COCSADRAFT_175121 -
Pfam	View protein in Pfam PF10309 NCBP3

Amino Acid Sequences

MDDTDMTDVAYDIEIDVGPNVEPVTQQQPQQVAQNNIAEPEGSIPAAYLEDIVIHEPWPESINLQGVSDFDPNDPLYWAMEHCQSEPRVKQLRWVNDNSVNLEYYTKEDAALALNLLTHPDTGDTSNLSLQAPRKAKPYSKKPNSVLSVRQSNAGDQKPRGAATRSNYYQRNPDVAGNRQREPRRRQPPKKDFLDYGDEEMGSRERSRRRDSGDESMGDSGVDRRGPRRNGRDTRNERDNRGRGRGDRQSTGRLRSDNQGKDVDSYRPGSRSPKEPRFGRLRGRSASPASDEEGDGRFGFAEDATHAGRSRYRSRSPGHNNRRRREASADRWTHDRANYDRAGGTTSGGRWQKDAFFVDTSPMGNHHRSNAIDVKRGSGASLLSRMTKDGQPVAPQHKRSLADRITRDDDDNDSEGGYGRLKNDYRDPNVTDFSEPARPRRGLADRISRDTDMSIRGQGRSHSQEGINIRGSAERSAGGINIRGVASGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.07
4	0.07
5	0.07
6	0.08
7	0.08
8	0.07
9	0.08
10	0.11
11	0.18
12	0.21
13	0.23
14	0.28
15	0.31
16	0.33
17	0.4
18	0.44
19	0.4
20	0.42
21	0.45
22	0.4
23	0.37
24	0.35
25	0.28
26	0.21
27	0.19
28	0.16
29	0.1
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.1
34	0.09
35	0.07
36	0.05
37	0.06
38	0.07
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.12
49	0.16
50	0.15
51	0.15
52	0.15
53	0.14
54	0.17
55	0.18
56	0.17
57	0.13
58	0.16
59	0.16
60	0.17
61	0.16
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.18
68	0.18
69	0.19
70	0.25
71	0.26
72	0.32
73	0.33
74	0.4
75	0.43
76	0.42
77	0.49
78	0.51
79	0.59
80	0.59
81	0.62
82	0.59
83	0.56
84	0.59
85	0.54
86	0.47
87	0.38
88	0.31
89	0.27
90	0.21
91	0.18
92	0.19
93	0.15
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.1
100	0.07
101	0.08
102	0.07
103	0.08
104	0.08
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.08
109	0.09
110	0.1
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.12
116	0.14
117	0.16
118	0.23
119	0.25
120	0.26
121	0.31
122	0.35
123	0.42
124	0.49
125	0.57
126	0.61
127	0.67
128	0.75
129	0.73
130	0.77
131	0.75
132	0.7
133	0.65
134	0.61
135	0.59
136	0.5
137	0.5
138	0.41
139	0.39
140	0.41
141	0.39
142	0.36
143	0.29
144	0.33
145	0.31
146	0.31
147	0.31
148	0.27
149	0.27
150	0.27
151	0.36
152	0.35
153	0.4
154	0.42
155	0.41
156	0.45
157	0.42
158	0.41
159	0.33
160	0.35
161	0.33
162	0.38
163	0.45
164	0.42
165	0.44
166	0.48
167	0.53
168	0.58
169	0.62
170	0.65
171	0.67
172	0.74
173	0.81
174	0.85
175	0.88
176	0.89
177	0.87
178	0.8
179	0.71
180	0.64
181	0.61
182	0.5
183	0.42
184	0.33
185	0.27
186	0.22
187	0.21
188	0.17
189	0.11
190	0.12
191	0.14
192	0.2
193	0.26
194	0.32
195	0.36
196	0.41
197	0.48
198	0.51
199	0.54
200	0.51
201	0.46
202	0.42
203	0.37
204	0.31
205	0.23
206	0.18
207	0.11
208	0.08
209	0.09
210	0.08
211	0.12
212	0.19
213	0.25
214	0.33
215	0.4
216	0.49
217	0.56
218	0.62
219	0.69
220	0.7
221	0.72
222	0.74
223	0.69
224	0.63
225	0.64
226	0.64
227	0.58
228	0.56
229	0.51
230	0.44
231	0.48
232	0.51
233	0.45
234	0.43
235	0.4
236	0.43
237	0.43
238	0.44
239	0.4
240	0.34
241	0.33
242	0.35
243	0.41
244	0.35
245	0.35
246	0.33
247	0.3
248	0.31
249	0.31
250	0.26
251	0.2
252	0.21
253	0.19
254	0.19
255	0.2
256	0.24
257	0.24
258	0.32
259	0.39
260	0.44
261	0.5
262	0.51
263	0.56
264	0.58
265	0.61
266	0.61
267	0.59
268	0.57
269	0.52
270	0.53
271	0.51
272	0.44
273	0.4
274	0.33
275	0.27
276	0.22
277	0.21
278	0.18
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.11
283	0.1
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.12
296	0.17
297	0.25
298	0.3
299	0.34
300	0.39
301	0.43
302	0.53
303	0.61
304	0.67
305	0.71
306	0.73
307	0.79
308	0.78
309	0.84
310	0.76
311	0.7
312	0.68
313	0.66
314	0.66
315	0.67
316	0.65
317	0.57
318	0.58
319	0.56
320	0.5
321	0.43
322	0.39
323	0.31
324	0.34
325	0.33
326	0.3
327	0.29
328	0.26
329	0.26
330	0.2
331	0.18
332	0.13
333	0.13
334	0.18
335	0.21
336	0.21
337	0.2
338	0.21
339	0.22
340	0.25
341	0.27
342	0.22
343	0.21
344	0.21
345	0.21
346	0.2
347	0.19
348	0.15
349	0.16
350	0.17
351	0.18
352	0.19
353	0.2
354	0.23
355	0.23
356	0.28
357	0.33
358	0.33
359	0.36
360	0.35
361	0.35
362	0.33
363	0.32
364	0.27
365	0.21
366	0.19
367	0.14
368	0.17
369	0.15
370	0.16
371	0.16
372	0.17
373	0.19
374	0.2
375	0.21
376	0.23
377	0.25
378	0.28
379	0.34
380	0.42
381	0.46
382	0.47
383	0.47
384	0.49
385	0.49
386	0.47
387	0.51
388	0.48
389	0.49
390	0.51
391	0.54
392	0.53
393	0.53
394	0.52
395	0.44
396	0.4
397	0.36
398	0.33
399	0.27
400	0.21
401	0.19
402	0.17
403	0.16
404	0.15
405	0.12
406	0.12
407	0.19
408	0.2
409	0.24
410	0.32
411	0.4
412	0.44
413	0.48
414	0.51
415	0.49
416	0.51
417	0.49
418	0.42
419	0.35
420	0.33
421	0.36
422	0.34
423	0.35
424	0.39
425	0.37
426	0.37
427	0.44
428	0.48
429	0.47
430	0.53
431	0.59
432	0.57
433	0.62
434	0.65
435	0.57
436	0.51
437	0.45
438	0.4
439	0.32
440	0.29
441	0.29
442	0.27
443	0.28
444	0.29
445	0.3
446	0.35
447	0.38
448	0.38
449	0.36
450	0.35
451	0.39
452	0.41
453	0.44
454	0.4
455	0.34
456	0.31
457	0.3
458	0.31
459	0.26
460	0.24
461	0.18
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.16
466	0.17
467	0.16
468	0.17
469	0.17

M2SSH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer