FuNGI

M2S7M3

Protein Details

Accession

M2S7M3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-42	ALLQKSQTTHTPRNQKPPQPRLKLICRRLPP	Hydrophilic
129-149	YAPYPKMPGGRRRNDNRQGTI	Hydrophilic
191-210	REKKANRDKPSTKPNRQARA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
191-223	REKKANRDKPSTKPNRQARAEAKEDAAERAEKK
363-367	ERPTR
536-573	KVARNPRFNGPTPPGPARGGGRTNFAPRGGRGGRGAAR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	bsc:COCSADRAFT_62417 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

PPPPSAGVLPVALLQKSQTTHTPRNQKPPQPRLKLICRRLPPGLTKQEFVNVLGDDWKLGAGRIDWLSYRKGKISTDAAKPSKPARAYLHVTKPDHVKALGDYIRALSFHDAAKSWQDPVLVGPPTLEYAPYPKMPGGRRRNDNRQGTIDQDQEFKDFLESLTNPITKPPAPESEAPKDKVKTTPLIEALREKKANRDKPSTKPNRQARAEAKEDAAERAEKKILTKSTKENAPTASDKTRRSNKADKAQATKDAVKILNKEAASSKTSAAATPADKASTNPAPERKRGNVALAKSMLQRDLGVAPAPNRRRGTKREVTSATPDAAPPVKETKPSDDKAKGAAATLPAVSATPDKSAHSNRKERPTRAERRAFKANQGDKANDKATTAEAKSQTPVKTPAPQILKKPQPAQSQTTPKGPAASRAPPSQPQAPPTKADSTPTPAANNTSKATPAQSAPAPTSKQAFLKHANPSQGITEPLIEEAMKLFGAIEKVEIDKRKGFAYVDFTEPQGLQKAMAASPIKIAQGAVQVLERKEKVARNPRFNGPTPPGPARGGGRTNFAPRGGRGGRGAARGGGQVNSNPAPSASDSAPTVASPGPAPVAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.19
4	0.21
5	0.26
6	0.32
7	0.41
8	0.5
9	0.6
10	0.64
11	0.74
12	0.8
13	0.81
14	0.84
15	0.85
16	0.87
17	0.85
18	0.87
19	0.85
20	0.86
21	0.88
22	0.86
23	0.84
24	0.8
25	0.77
26	0.74
27	0.71
28	0.68
29	0.67
30	0.69
31	0.63
32	0.58
33	0.53
34	0.52
35	0.47
36	0.41
37	0.34
38	0.24
39	0.21
40	0.22
41	0.2
42	0.15
43	0.14
44	0.13
45	0.1
46	0.09
47	0.1
48	0.08
49	0.13
50	0.14
51	0.15
52	0.17
53	0.19
54	0.25
55	0.29
56	0.31
57	0.31
58	0.34
59	0.34
60	0.37
61	0.44
62	0.45
63	0.48
64	0.55
65	0.54
66	0.53
67	0.55
68	0.53
69	0.52
70	0.46
71	0.44
72	0.4
73	0.44
74	0.5
75	0.55
76	0.61
77	0.61
78	0.62
79	0.6
80	0.6
81	0.55
82	0.51
83	0.42
84	0.34
85	0.26
86	0.33
87	0.31
88	0.25
89	0.23
90	0.21
91	0.22
92	0.2
93	0.2
94	0.14
95	0.14
96	0.15
97	0.16
98	0.15
99	0.16
100	0.21
101	0.21
102	0.2
103	0.19
104	0.18
105	0.17
106	0.19
107	0.23
108	0.19
109	0.18
110	0.17
111	0.15
112	0.17
113	0.16
114	0.14
115	0.08
116	0.12
117	0.15
118	0.16
119	0.17
120	0.18
121	0.24
122	0.3
123	0.4
124	0.46
125	0.52
126	0.61
127	0.69
128	0.78
129	0.81
130	0.83
131	0.78
132	0.74
133	0.66
134	0.62
135	0.58
136	0.51
137	0.43
138	0.38
139	0.33
140	0.28
141	0.26
142	0.21
143	0.17
144	0.13
145	0.11
146	0.14
147	0.14
148	0.15
149	0.2
150	0.21
151	0.2
152	0.21
153	0.24
154	0.2
155	0.23
156	0.24
157	0.24
158	0.27
159	0.32
160	0.37
161	0.43
162	0.48
163	0.48
164	0.49
165	0.46
166	0.45
167	0.44
168	0.41
169	0.37
170	0.34
171	0.36
172	0.37
173	0.37
174	0.36
175	0.39
176	0.39
177	0.4
178	0.41
179	0.36
180	0.4
181	0.48
182	0.55
183	0.54
184	0.61
185	0.6
186	0.65
187	0.76
188	0.78
189	0.76
190	0.78
191	0.8
192	0.79
193	0.77
194	0.76
195	0.73
196	0.69
197	0.64
198	0.56
199	0.47
200	0.4
201	0.38
202	0.31
203	0.24
204	0.2
205	0.16
206	0.17
207	0.18
208	0.16
209	0.17
210	0.22
211	0.27
212	0.29
213	0.33
214	0.37
215	0.41
216	0.46
217	0.46
218	0.42
219	0.37
220	0.37
221	0.36
222	0.33
223	0.34
224	0.35
225	0.37
226	0.43
227	0.5
228	0.51
229	0.55
230	0.6
231	0.61
232	0.65
233	0.69
234	0.66
235	0.64
236	0.61
237	0.59
238	0.54
239	0.48
240	0.39
241	0.36
242	0.32
243	0.28
244	0.27
245	0.24
246	0.25
247	0.22
248	0.22
249	0.2
250	0.21
251	0.2
252	0.19
253	0.18
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.14
258	0.14
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.15
266	0.16
267	0.17
268	0.19
269	0.26
270	0.28
271	0.32
272	0.37
273	0.34
274	0.36
275	0.35
276	0.38
277	0.35
278	0.33
279	0.33
280	0.29
281	0.28
282	0.24
283	0.24
284	0.18
285	0.14
286	0.12
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.09
293	0.16
294	0.18
295	0.23
296	0.25
297	0.28
298	0.33
299	0.38
300	0.45
301	0.47
302	0.49
303	0.5
304	0.51
305	0.5
306	0.5
307	0.45
308	0.37
309	0.29
310	0.25
311	0.19
312	0.18
313	0.15
314	0.12
315	0.15
316	0.15
317	0.19
318	0.2
319	0.26
320	0.31
321	0.33
322	0.38
323	0.36
324	0.36
325	0.34
326	0.35
327	0.27
328	0.21
329	0.2
330	0.14
331	0.12
332	0.11
333	0.09
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.14
343	0.21
344	0.29
345	0.37
346	0.45
347	0.49
348	0.59
349	0.66
350	0.65
351	0.69
352	0.7
353	0.72
354	0.73
355	0.76
356	0.71
357	0.7
358	0.76
359	0.67
360	0.64
361	0.64
362	0.59
363	0.56
364	0.53
365	0.49
366	0.42
367	0.45
368	0.4
369	0.3
370	0.26
371	0.19
372	0.18
373	0.2
374	0.19
375	0.2
376	0.2
377	0.21
378	0.22
379	0.26
380	0.25
381	0.24
382	0.28
383	0.25
384	0.3
385	0.31
386	0.36
387	0.39
388	0.41
389	0.45
390	0.5
391	0.54
392	0.53
393	0.57
394	0.58
395	0.59
396	0.6
397	0.6
398	0.59
399	0.62
400	0.6
401	0.59
402	0.54
403	0.46
404	0.46
405	0.4
406	0.37
407	0.33
408	0.36
409	0.35
410	0.36
411	0.39
412	0.38
413	0.43
414	0.44
415	0.41
416	0.39
417	0.43
418	0.41
419	0.41
420	0.41
421	0.42
422	0.35
423	0.35
424	0.34
425	0.33
426	0.35
427	0.33
428	0.3
429	0.26
430	0.3
431	0.3
432	0.31
433	0.25
434	0.22
435	0.22
436	0.21
437	0.22
438	0.2
439	0.18
440	0.18
441	0.19
442	0.2
443	0.22
444	0.26
445	0.25
446	0.25
447	0.27
448	0.26
449	0.28
450	0.29
451	0.32
452	0.33
453	0.38
454	0.44
455	0.46
456	0.47
457	0.44
458	0.42
459	0.38
460	0.34
461	0.3
462	0.22
463	0.19
464	0.15
465	0.14
466	0.14
467	0.11
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.11
480	0.17
481	0.2
482	0.23
483	0.26
484	0.27
485	0.27
486	0.28
487	0.27
488	0.26
489	0.3
490	0.29
491	0.3
492	0.29
493	0.29
494	0.29
495	0.28
496	0.25
497	0.21
498	0.19
499	0.14
500	0.15
501	0.17
502	0.15
503	0.21
504	0.21
505	0.17
506	0.2
507	0.21
508	0.19
509	0.18
510	0.17
511	0.13
512	0.17
513	0.17
514	0.15
515	0.16
516	0.2
517	0.21
518	0.27
519	0.25
520	0.23
521	0.29
522	0.33
523	0.41
524	0.48
525	0.56
526	0.6
527	0.65
528	0.72
529	0.73
530	0.72
531	0.7
532	0.66
533	0.64
534	0.61
535	0.59
536	0.54
537	0.48
538	0.48
539	0.43
540	0.43
541	0.41
542	0.36
543	0.38
544	0.38
545	0.43
546	0.42
547	0.41
548	0.39
549	0.34
550	0.41
551	0.38
552	0.37
553	0.33
554	0.37
555	0.38
556	0.38
557	0.38
558	0.3
559	0.3
560	0.29
561	0.28
562	0.23
563	0.2
564	0.19
565	0.24
566	0.24
567	0.23
568	0.21
569	0.19
570	0.2
571	0.21
572	0.23
573	0.18
574	0.19
575	0.19
576	0.2
577	0.21
578	0.18
579	0.18
580	0.15
581	0.15
582	0.13
583	0.13

M2S7M3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer