Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2RJ17

Protein Details
Accession M2RJ17    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105PQNWSKVYRKLKKDAEREKQADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-290PKPASGGVAPTPKRKRE
297-301TKKKK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG bsc:COCSADRAFT_301484  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPALTLFELARQRLIKNIDMLRDVGDLPYSFLQPVLRFVQSPDQLIELESNCPQLLGETGEVWLRFIKRDIPDWQKKPHEPRDPQNWSKVYRKLKKDAEREKQADEEALKQQMKAIQKDRAQNKTLIVDSRIGYGSGGSRMFTGRTTTSWGQPSGAPAKTGKAAFDKLKRGMFDHGRERPKASQIPAHLLAQRKRPIQQAPARMVRMAESEAPRSMVLSRQASTSMANRPEPSRPTPSTSRPNITQRPAPQQRNPPPPSRTSLPAGQQFSAPKPKPASGGVAPTPKRKREEYSMFHTKKKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.38
6 0.38
7 0.38
8 0.33
9 0.31
10 0.27
11 0.2
12 0.18
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.17
20 0.15
21 0.2
22 0.21
23 0.2
24 0.2
25 0.23
26 0.31
27 0.3
28 0.31
29 0.28
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.2
55 0.2
56 0.26
57 0.33
58 0.41
59 0.5
60 0.54
61 0.62
62 0.64
63 0.69
64 0.74
65 0.76
66 0.76
67 0.73
68 0.76
69 0.79
70 0.8
71 0.75
72 0.74
73 0.68
74 0.63
75 0.62
76 0.62
77 0.62
78 0.61
79 0.65
80 0.65
81 0.7
82 0.75
83 0.78
84 0.81
85 0.8
86 0.81
87 0.77
88 0.7
89 0.62
90 0.53
91 0.45
92 0.35
93 0.29
94 0.22
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.22
99 0.24
100 0.27
101 0.29
102 0.31
103 0.32
104 0.37
105 0.45
106 0.5
107 0.52
108 0.5
109 0.46
110 0.43
111 0.39
112 0.36
113 0.3
114 0.24
115 0.21
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.15
134 0.16
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.14
150 0.17
151 0.21
152 0.26
153 0.3
154 0.31
155 0.33
156 0.32
157 0.31
158 0.34
159 0.34
160 0.35
161 0.38
162 0.43
163 0.45
164 0.45
165 0.47
166 0.43
167 0.44
168 0.43
169 0.36
170 0.33
171 0.31
172 0.36
173 0.34
174 0.34
175 0.31
176 0.33
177 0.34
178 0.37
179 0.41
180 0.37
181 0.38
182 0.42
183 0.43
184 0.46
185 0.5
186 0.5
187 0.51
188 0.55
189 0.53
190 0.48
191 0.43
192 0.35
193 0.29
194 0.23
195 0.21
196 0.17
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.18
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.19
205 0.19
206 0.2
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.26
215 0.27
216 0.29
217 0.34
218 0.37
219 0.39
220 0.4
221 0.39
222 0.43
223 0.48
224 0.53
225 0.57
226 0.58
227 0.59
228 0.58
229 0.64
230 0.66
231 0.64
232 0.64
233 0.61
234 0.65
235 0.69
236 0.7
237 0.69
238 0.72
239 0.77
240 0.8
241 0.79
242 0.76
243 0.71
244 0.68
245 0.67
246 0.61
247 0.56
248 0.5
249 0.51
250 0.5
251 0.53
252 0.52
253 0.45
254 0.44
255 0.42
256 0.43
257 0.48
258 0.42
259 0.41
260 0.42
261 0.44
262 0.44
263 0.43
264 0.44
265 0.37
266 0.43
267 0.42
268 0.47
269 0.48
270 0.55
271 0.6
272 0.6
273 0.62
274 0.6
275 0.62
276 0.63
277 0.7
278 0.67
279 0.68
280 0.73
281 0.72
282 0.74