Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DJ43

Protein Details
Accession B0DJ43    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29ADQMSPTAKKSKKKSRGIRKFIPDLKSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-21KKSKKKSRGIRK
Subcellular Location(s) plas 8, cyto_mito 6, mito 5.5, cyto 5.5, nucl 4, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031777  Sortilin_C  
IPR031778  Sortilin_N  
IPR006581  VPS10  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046907  P:intracellular transport  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_329753  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15902  Sortilin-Vps10  
PF15901  Sortilin_C  
Amino Acid Sequences MADQMSPTAKKSKKKSRGIRKFIPDLKSPNESAHQSNSTRVSVSSASSAHHGTDAGNAEPRASNLADSLILQVTPRPLPSRQDLRQVLQICRSPLWVKSRRTLNLIPSEGAHDPPRLDLTKVPAAGASSAERPDKGDRRGNASVWREISRNGRHALPRQRTGWATSISVAMVQTPKTRKDCVPVGPEPIPAGVCTGNPDQTYKGPPGWRKIPGNTCVDGVKKDEKVDKKCSQGFLHNLLPGKSPTKFMTSNIRSCNTRTSRTPKSKPFWFVPSTTPCGNPATKVTAGCKSTLNTASLHSTTTNTRTIAPTSSPTPTPSTQPTTDEPKAPTPPDTFGAQVTHFHPNTDNLIWTGNRGCSAQAQSCHAEAQYSRDNGRKWSLIDSYVWNRAWAKDAELNTDPNEIICGTRRATSVFDHVVGFAKFSEFLVVAEMIPERRSWELEVSLDGIHFATGKFPPSVHPETHAYTVLESSTKSLFLHMTMSEAPAPFWGDILKSNSNGTHFGLALENVNQDEQGYVDLEKMIGLDGIALANVVSNPADATLSGHKQLQSRITHNDGSTWRPLTPPLVDSQGNIYSCEGTCALHIHGYTEQMDPRATYSSPSIVGVLMAVGNVANDEEPTDHILFSTDEGLTWREYKFTEKMRVRSIVAVPSDTSRRFILFGSFMRTPGSIAVHIDFTQLTSRKCSRIWFYSFISYANFCSLGDLSADNPEKDDFEMWSPSENRPQQCLFGRQTLGYRRRIRNTDCTVGEQEKAASRVVLNWVCSKIDFECEFNHVKNANDESELVPGTTPLPDSDAVCRNGEEFWYERTAYRLTPYFSCTDGERPDRGREHRCPGFKFHSARFWLFMLLLPFGFTALNAFYYYRRSGLARGTIRLPGDGGRPAYGGDIGVVATLASVPWSIVGVAGIAWEWVVSHVERLAPCARSGYRNLPIDKDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.85
3 0.87
4 0.92
5 0.93
6 0.92
7 0.91
8 0.9
9 0.87
10 0.82
11 0.78
12 0.73
13 0.69
14 0.65
15 0.56
16 0.51
17 0.49
18 0.47
19 0.43
20 0.44
21 0.44
22 0.4
23 0.45
24 0.44
25 0.4
26 0.37
27 0.33
28 0.31
29 0.25
30 0.26
31 0.24
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.22
36 0.19
37 0.18
38 0.16
39 0.13
40 0.17
41 0.19
42 0.18
43 0.22
44 0.21
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.21
49 0.19
50 0.17
51 0.13
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.13
60 0.15
61 0.16
62 0.19
63 0.2
64 0.23
65 0.29
66 0.38
67 0.45
68 0.46
69 0.55
70 0.57
71 0.57
72 0.61
73 0.61
74 0.56
75 0.53
76 0.52
77 0.45
78 0.41
79 0.41
80 0.36
81 0.37
82 0.43
83 0.45
84 0.46
85 0.51
86 0.59
87 0.59
88 0.64
89 0.63
90 0.61
91 0.62
92 0.59
93 0.52
94 0.44
95 0.44
96 0.38
97 0.36
98 0.3
99 0.22
100 0.2
101 0.21
102 0.25
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.27
107 0.32
108 0.31
109 0.3
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.23
114 0.18
115 0.15
116 0.17
117 0.19
118 0.18
119 0.21
120 0.29
121 0.35
122 0.39
123 0.44
124 0.44
125 0.51
126 0.55
127 0.55
128 0.55
129 0.52
130 0.51
131 0.47
132 0.46
133 0.39
134 0.39
135 0.45
136 0.43
137 0.43
138 0.4
139 0.42
140 0.46
141 0.54
142 0.61
143 0.6
144 0.59
145 0.56
146 0.59
147 0.55
148 0.52
149 0.49
150 0.41
151 0.34
152 0.28
153 0.27
154 0.21
155 0.2
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.18
161 0.22
162 0.29
163 0.32
164 0.36
165 0.36
166 0.42
167 0.47
168 0.48
169 0.51
170 0.48
171 0.5
172 0.47
173 0.46
174 0.39
175 0.34
176 0.26
177 0.19
178 0.17
179 0.12
180 0.1
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.22
188 0.26
189 0.25
190 0.28
191 0.32
192 0.36
193 0.42
194 0.46
195 0.51
196 0.52
197 0.57
198 0.6
199 0.58
200 0.59
201 0.52
202 0.47
203 0.43
204 0.39
205 0.33
206 0.3
207 0.3
208 0.27
209 0.29
210 0.36
211 0.41
212 0.46
213 0.54
214 0.55
215 0.57
216 0.6
217 0.61
218 0.57
219 0.56
220 0.54
221 0.5
222 0.49
223 0.43
224 0.41
225 0.36
226 0.35
227 0.3
228 0.28
229 0.23
230 0.23
231 0.21
232 0.25
233 0.26
234 0.26
235 0.35
236 0.38
237 0.44
238 0.46
239 0.47
240 0.43
241 0.44
242 0.51
243 0.45
244 0.44
245 0.45
246 0.48
247 0.55
248 0.64
249 0.71
250 0.7
251 0.73
252 0.75
253 0.73
254 0.7
255 0.66
256 0.59
257 0.53
258 0.5
259 0.49
260 0.46
261 0.41
262 0.37
263 0.32
264 0.33
265 0.31
266 0.25
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.24
271 0.25
272 0.27
273 0.27
274 0.27
275 0.26
276 0.22
277 0.25
278 0.26
279 0.24
280 0.19
281 0.19
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.16
286 0.15
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.21
299 0.2
300 0.21
301 0.24
302 0.23
303 0.25
304 0.27
305 0.3
306 0.29
307 0.31
308 0.33
309 0.36
310 0.37
311 0.38
312 0.35
313 0.35
314 0.37
315 0.35
316 0.35
317 0.29
318 0.29
319 0.27
320 0.26
321 0.21
322 0.19
323 0.2
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.24
333 0.22
334 0.2
335 0.13
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.16
346 0.18
347 0.18
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.21
352 0.18
353 0.16
354 0.13
355 0.17
356 0.19
357 0.19
358 0.21
359 0.24
360 0.25
361 0.27
362 0.3
363 0.27
364 0.23
365 0.25
366 0.24
367 0.22
368 0.22
369 0.24
370 0.24
371 0.28
372 0.26
373 0.24
374 0.23
375 0.22
376 0.24
377 0.19
378 0.19
379 0.18
380 0.18
381 0.22
382 0.22
383 0.23
384 0.2
385 0.21
386 0.18
387 0.13
388 0.13
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.15
398 0.16
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.14
406 0.13
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.07
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.1
444 0.17
445 0.2
446 0.19
447 0.21
448 0.23
449 0.24
450 0.26
451 0.25
452 0.18
453 0.15
454 0.15
455 0.12
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.07
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.09
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.08
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.16
486 0.17
487 0.15
488 0.12
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.06
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.13
533 0.15
534 0.17
535 0.19
536 0.24
537 0.25
538 0.27
539 0.31
540 0.33
541 0.33
542 0.32
543 0.34
544 0.29
545 0.28
546 0.28
547 0.25
548 0.21
549 0.19
550 0.2
551 0.18
552 0.17
553 0.15
554 0.13
555 0.16
556 0.16
557 0.15
558 0.18
559 0.19
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.12
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.12
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.12
588 0.13
589 0.13
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.06
595 0.05
596 0.04
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.11
615 0.08
616 0.07
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.11
622 0.11
623 0.12
624 0.16
625 0.21
626 0.26
627 0.35
628 0.39
629 0.44
630 0.48
631 0.5
632 0.47
633 0.46
634 0.42
635 0.37
636 0.32
637 0.29
638 0.24
639 0.23
640 0.26
641 0.22
642 0.22
643 0.18
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.18
648 0.17
649 0.18
650 0.22
651 0.21
652 0.21
653 0.21
654 0.21
655 0.18
656 0.16
657 0.16
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.13
662 0.13
663 0.13
664 0.11
665 0.1
666 0.16
667 0.18
668 0.18
669 0.22
670 0.25
671 0.28
672 0.29
673 0.34
674 0.34
675 0.39
676 0.43
677 0.42
678 0.42
679 0.44
680 0.43
681 0.39
682 0.35
683 0.27
684 0.23
685 0.2
686 0.17
687 0.11
688 0.12
689 0.12
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.09
694 0.15
695 0.17
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.16
700 0.17
701 0.17
702 0.12
703 0.13
704 0.16
705 0.15
706 0.2
707 0.21
708 0.23
709 0.31
710 0.35
711 0.35
712 0.37
713 0.38
714 0.39
715 0.42
716 0.47
717 0.41
718 0.41
719 0.4
720 0.37
721 0.42
722 0.46
723 0.47
724 0.49
725 0.55
726 0.57
727 0.64
728 0.7
729 0.7
730 0.7
731 0.71
732 0.69
733 0.62
734 0.59
735 0.56
736 0.5
737 0.45
738 0.35
739 0.3
740 0.25
741 0.24
742 0.2
743 0.16
744 0.14
745 0.16
746 0.22
747 0.23
748 0.21
749 0.24
750 0.25
751 0.25
752 0.25
753 0.25
754 0.19
755 0.23
756 0.23
757 0.21
758 0.21
759 0.25
760 0.29
761 0.27
762 0.32
763 0.26
764 0.26
765 0.29
766 0.31
767 0.28
768 0.26
769 0.27
770 0.22
771 0.23
772 0.22
773 0.17
774 0.13
775 0.12
776 0.11
777 0.11
778 0.1
779 0.08
780 0.1
781 0.11
782 0.13
783 0.18
784 0.23
785 0.25
786 0.25
787 0.25
788 0.23
789 0.23
790 0.22
791 0.2
792 0.16
793 0.16
794 0.19
795 0.2
796 0.2
797 0.23
798 0.24
799 0.22
800 0.25
801 0.26
802 0.26
803 0.27
804 0.3
805 0.28
806 0.28
807 0.28
808 0.26
809 0.27
810 0.31
811 0.34
812 0.36
813 0.38
814 0.44
815 0.5
816 0.55
817 0.58
818 0.59
819 0.64
820 0.66
821 0.7
822 0.66
823 0.67
824 0.67
825 0.66
826 0.65
827 0.6
828 0.6
829 0.59
830 0.57
831 0.52
832 0.45
833 0.38
834 0.32
835 0.3
836 0.23
837 0.19
838 0.16
839 0.14
840 0.13
841 0.12
842 0.12
843 0.09
844 0.08
845 0.08
846 0.09
847 0.09
848 0.1
849 0.11
850 0.16
851 0.18
852 0.18
853 0.19
854 0.2
855 0.23
856 0.28
857 0.37
858 0.36
859 0.37
860 0.39
861 0.41
862 0.4
863 0.37
864 0.31
865 0.24
866 0.24
867 0.25
868 0.24
869 0.21
870 0.21
871 0.2
872 0.2
873 0.18
874 0.15
875 0.1
876 0.09
877 0.07
878 0.07
879 0.06
880 0.05
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.04
885 0.04
886 0.04
887 0.05
888 0.05
889 0.05
890 0.06
891 0.06
892 0.05
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.04
897 0.04
898 0.04
899 0.04
900 0.05
901 0.08
902 0.08
903 0.1
904 0.11
905 0.16
906 0.16
907 0.21
908 0.25
909 0.25
910 0.25
911 0.3
912 0.31
913 0.32
914 0.39
915 0.43
916 0.46
917 0.52
918 0.54