Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SPM3

Protein Details
Accession M2SPM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-373RRRERDALARAQKKKRNKHDPRGDSSSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-366RRRERDALARAQKKKRNKHDP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_89986  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNIPFAVAAQQQQDSAIKVLESRFRQLTDIEVWKHCIGMNHISNIPDFAREAANHIIVVCLDCEHWSNNTEETTEVGIATFSRQDVVSLVNREDFGDFGEHLMQQVQFYLLRMIETSHLPNQNPQSRGVLGNRFGKGRFVTFAQARQIMHDLFVQPIKGVSGLKGNHPIVVLGHDVSHDKNNLKHKAIEFDMDPLGTVVRYIDTQVLAREGKCWNMPHKEQIGLKRLVENLWFEHSDPHTAANDAGRTLISAFQIGLGEHACRKHLKHRMLEVATDIEQYSVTNFKSIGGVEEYCWRCGQSGHMKSACKATGLHCDECKSNKCQLEPGEEHISAHCMCVAKDNAARRRERDALARAQKKKRNKHDPRGDSSSDDHGRPHSRDKDHYHSFSPSQVSHSTKPNGQEDTHEGRRKQPWNDIWREGPENGSNSNFGKRRGYRRGSGGGHSSRDGSDQSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.17
4 0.14
5 0.16
6 0.2
7 0.26
8 0.27
9 0.31
10 0.33
11 0.34
12 0.35
13 0.33
14 0.34
15 0.33
16 0.37
17 0.36
18 0.35
19 0.39
20 0.37
21 0.38
22 0.34
23 0.31
24 0.28
25 0.33
26 0.35
27 0.34
28 0.36
29 0.36
30 0.35
31 0.34
32 0.29
33 0.21
34 0.17
35 0.15
36 0.16
37 0.15
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.17
44 0.14
45 0.15
46 0.11
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.1
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.13
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.13
74 0.17
75 0.19
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.21
80 0.2
81 0.17
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.13
90 0.12
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.16
104 0.2
105 0.24
106 0.24
107 0.29
108 0.37
109 0.42
110 0.41
111 0.39
112 0.37
113 0.34
114 0.37
115 0.37
116 0.34
117 0.32
118 0.37
119 0.37
120 0.35
121 0.33
122 0.33
123 0.3
124 0.26
125 0.23
126 0.18
127 0.22
128 0.23
129 0.26
130 0.26
131 0.28
132 0.26
133 0.26
134 0.28
135 0.22
136 0.21
137 0.19
138 0.16
139 0.14
140 0.15
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.23
152 0.23
153 0.23
154 0.22
155 0.22
156 0.16
157 0.17
158 0.15
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.18
168 0.27
169 0.32
170 0.33
171 0.36
172 0.35
173 0.37
174 0.36
175 0.33
176 0.25
177 0.22
178 0.2
179 0.16
180 0.15
181 0.1
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.18
201 0.21
202 0.26
203 0.27
204 0.31
205 0.32
206 0.35
207 0.35
208 0.39
209 0.4
210 0.36
211 0.35
212 0.31
213 0.29
214 0.26
215 0.24
216 0.19
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.21
252 0.3
253 0.36
254 0.4
255 0.46
256 0.52
257 0.51
258 0.5
259 0.43
260 0.36
261 0.3
262 0.24
263 0.18
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.19
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.17
285 0.17
286 0.23
287 0.25
288 0.29
289 0.35
290 0.39
291 0.4
292 0.4
293 0.45
294 0.38
295 0.29
296 0.26
297 0.22
298 0.28
299 0.32
300 0.34
301 0.3
302 0.31
303 0.33
304 0.38
305 0.39
306 0.33
307 0.35
308 0.36
309 0.36
310 0.39
311 0.4
312 0.43
313 0.41
314 0.42
315 0.41
316 0.37
317 0.37
318 0.31
319 0.31
320 0.22
321 0.2
322 0.16
323 0.11
324 0.11
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.23
329 0.32
330 0.37
331 0.43
332 0.47
333 0.44
334 0.5
335 0.51
336 0.51
337 0.5
338 0.49
339 0.52
340 0.59
341 0.65
342 0.67
343 0.71
344 0.76
345 0.78
346 0.82
347 0.83
348 0.84
349 0.86
350 0.88
351 0.9
352 0.91
353 0.9
354 0.87
355 0.79
356 0.71
357 0.63
358 0.61
359 0.53
360 0.44
361 0.37
362 0.35
363 0.39
364 0.39
365 0.45
366 0.45
367 0.47
368 0.55
369 0.61
370 0.65
371 0.68
372 0.69
373 0.63
374 0.59
375 0.55
376 0.52
377 0.48
378 0.4
379 0.35
380 0.37
381 0.39
382 0.38
383 0.44
384 0.44
385 0.43
386 0.48
387 0.49
388 0.47
389 0.42
390 0.43
391 0.43
392 0.47
393 0.53
394 0.54
395 0.5
396 0.54
397 0.62
398 0.65
399 0.63
400 0.64
401 0.64
402 0.67
403 0.74
404 0.71
405 0.67
406 0.66
407 0.65
408 0.55
409 0.5
410 0.45
411 0.4
412 0.37
413 0.33
414 0.3
415 0.28
416 0.36
417 0.35
418 0.34
419 0.41
420 0.46
421 0.55
422 0.62
423 0.68
424 0.66
425 0.7
426 0.76
427 0.71
428 0.68
429 0.67
430 0.63
431 0.59
432 0.53
433 0.47
434 0.39
435 0.37