Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SUU3

Protein Details
Accession M2SUU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-69TSRSPSSSPKKPLRAGKKHRTMASSHydrophilic
256-279ARDFRVRSRTLRRKMWWKNVKLMVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-63PKKPLRAGKKH
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10, cyto 4.5, plas 3, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR010908  Longin_dom  
IPR001388  Synaptobrevin-like  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG bsc:COCSADRAFT_158226  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13774  Longin  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50859  LONGIN  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd14824  Longin  
Amino Acid Sequences MTRPARGSIPSFHGPPLTIVAQHHDGTGEHSTLLSRGLISPTKNTSRSPSSSPKKPLRAGKKHRTMASSSSSTSLLYACIAHDTTVLAEHTASASSNASSLISMILPLIAKENPPETRRSYDKDTHSVHLLMRKPANSKSPGRLIFLVVAEKAAGKGVPYGFLQTLQDKFFAQFDVDDTAFGELPSYGCASFNAELKRLMMHQGGTLAGQEDALRTAQREIDGVREIMTENIERVLERGEHMSVLVDKTGRLGENARDFRVRSRTLRRKMWWKNVKLMVLLFVVCLFLLYIFVGFGCGLPAWGRCLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.29
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.24
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.21
12 0.19
13 0.21
14 0.23
15 0.18
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.11
22 0.08
23 0.09
24 0.14
25 0.17
26 0.18
27 0.23
28 0.29
29 0.35
30 0.37
31 0.37
32 0.4
33 0.43
34 0.46
35 0.49
36 0.53
37 0.55
38 0.61
39 0.69
40 0.71
41 0.73
42 0.76
43 0.78
44 0.79
45 0.81
46 0.83
47 0.84
48 0.86
49 0.84
50 0.81
51 0.75
52 0.68
53 0.62
54 0.58
55 0.5
56 0.41
57 0.35
58 0.31
59 0.27
60 0.24
61 0.18
62 0.12
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.12
100 0.16
101 0.18
102 0.21
103 0.23
104 0.28
105 0.32
106 0.36
107 0.39
108 0.42
109 0.45
110 0.5
111 0.49
112 0.45
113 0.43
114 0.39
115 0.34
116 0.33
117 0.3
118 0.27
119 0.26
120 0.26
121 0.27
122 0.29
123 0.33
124 0.32
125 0.33
126 0.33
127 0.38
128 0.38
129 0.37
130 0.35
131 0.3
132 0.26
133 0.23
134 0.2
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.03
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.1
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.14
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.13
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.14
240 0.19
241 0.29
242 0.32
243 0.33
244 0.34
245 0.35
246 0.4
247 0.45
248 0.45
249 0.43
250 0.52
251 0.59
252 0.65
253 0.74
254 0.76
255 0.79
256 0.84
257 0.87
258 0.86
259 0.82
260 0.82
261 0.8
262 0.74
263 0.66
264 0.56
265 0.47
266 0.39
267 0.32
268 0.23
269 0.16
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.09
287 0.1
288 0.15