Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SEH6

Protein Details
Accession M2SEH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-449EFEMMPRTKTRRRSPARSTRSGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-453KTRRRSPARSTRSGGSNRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG bsc:COCSADRAFT_236710  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PF00515  TPR_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKQEIETWVAALASYDNNEFDVALKVFEQISDTSKILFNCGVIHATLGEHEKAVECYQRAVRLDQYLAVAYFQQGVSNFLMGDFEEALANFNDTLLYLRGNNNIDYEQLGLKFKLYSCEVLFNRGLCYIYLQQREAGLQDLSFAAKEKVVPDHDVIDEAIREEAEGYTVFSIPVGIVYRPNEAKVKNLKTKDYLGKARLVAASDRSNAFTGFAGAEIKKGGQAAKDDRTEDKISYAATNLVKPELQSRARQQSEPPMNRNVFPPTPPPEADRRSGERRSAGARPAADPNAPMSRAQSVRGGGPKPQPLNLGRAAFDQPSSQEPPRRQPTQRSASERPPPARSESTRDRGQRDTRERDTRDREYSRQQRRRGSDEDIIDDYYEDDGYPPSRSSRGQYSRTKSTRRPAYIEEEEEDDYDGSDLDDAEFEMMPRTKTRRRSPARSTRSGGSNRGAGSKIRVKVHSTDTRYVFINSDQLITEFWQQIREKFGVRNKFKLEFKDDGDMITMADQDDLDMAIQAAKSIARKESSDVAKMEVWVREV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.11
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.12
19 0.16
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.22
24 0.22
25 0.23
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.33
50 0.35
51 0.34
52 0.34
53 0.31
54 0.29
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.14
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.13
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.29
108 0.28
109 0.31
110 0.32
111 0.28
112 0.28
113 0.25
114 0.24
115 0.15
116 0.19
117 0.21
118 0.26
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.28
123 0.29
124 0.25
125 0.21
126 0.14
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.18
145 0.15
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.21
171 0.2
172 0.27
173 0.34
174 0.41
175 0.45
176 0.48
177 0.49
178 0.48
179 0.55
180 0.54
181 0.52
182 0.5
183 0.45
184 0.46
185 0.43
186 0.41
187 0.35
188 0.3
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.13
212 0.17
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.26
217 0.3
218 0.3
219 0.26
220 0.22
221 0.18
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.21
236 0.27
237 0.35
238 0.37
239 0.38
240 0.36
241 0.4
242 0.47
243 0.48
244 0.46
245 0.43
246 0.42
247 0.42
248 0.43
249 0.38
250 0.29
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.28
255 0.28
256 0.29
257 0.31
258 0.33
259 0.34
260 0.33
261 0.33
262 0.37
263 0.38
264 0.38
265 0.33
266 0.32
267 0.33
268 0.32
269 0.28
270 0.25
271 0.23
272 0.23
273 0.24
274 0.23
275 0.19
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.17
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.26
292 0.3
293 0.29
294 0.29
295 0.31
296 0.28
297 0.31
298 0.31
299 0.27
300 0.22
301 0.24
302 0.24
303 0.2
304 0.19
305 0.15
306 0.12
307 0.15
308 0.18
309 0.19
310 0.23
311 0.26
312 0.35
313 0.42
314 0.47
315 0.47
316 0.52
317 0.59
318 0.62
319 0.67
320 0.66
321 0.64
322 0.66
323 0.7
324 0.67
325 0.62
326 0.56
327 0.5
328 0.48
329 0.49
330 0.43
331 0.43
332 0.45
333 0.47
334 0.51
335 0.53
336 0.51
337 0.52
338 0.57
339 0.59
340 0.6
341 0.62
342 0.63
343 0.68
344 0.68
345 0.7
346 0.71
347 0.67
348 0.67
349 0.64
350 0.6
351 0.62
352 0.67
353 0.7
354 0.71
355 0.71
356 0.71
357 0.72
358 0.74
359 0.68
360 0.64
361 0.59
362 0.53
363 0.5
364 0.43
365 0.37
366 0.3
367 0.26
368 0.2
369 0.13
370 0.11
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.14
379 0.15
380 0.19
381 0.28
382 0.35
383 0.42
384 0.5
385 0.55
386 0.64
387 0.7
388 0.73
389 0.7
390 0.72
391 0.73
392 0.69
393 0.67
394 0.61
395 0.63
396 0.61
397 0.57
398 0.48
399 0.41
400 0.37
401 0.32
402 0.28
403 0.19
404 0.14
405 0.11
406 0.09
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.1
417 0.11
418 0.12
419 0.17
420 0.24
421 0.3
422 0.4
423 0.49
424 0.56
425 0.65
426 0.73
427 0.8
428 0.84
429 0.86
430 0.85
431 0.79
432 0.74
433 0.73
434 0.68
435 0.62
436 0.54
437 0.49
438 0.42
439 0.41
440 0.37
441 0.29
442 0.31
443 0.34
444 0.37
445 0.38
446 0.39
447 0.4
448 0.44
449 0.52
450 0.54
451 0.53
452 0.55
453 0.52
454 0.52
455 0.5
456 0.46
457 0.38
458 0.3
459 0.29
460 0.22
461 0.21
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.18
466 0.21
467 0.2
468 0.19
469 0.25
470 0.27
471 0.28
472 0.33
473 0.33
474 0.32
475 0.35
476 0.44
477 0.47
478 0.51
479 0.57
480 0.58
481 0.63
482 0.65
483 0.65
484 0.64
485 0.58
486 0.57
487 0.56
488 0.5
489 0.43
490 0.4
491 0.32
492 0.26
493 0.21
494 0.17
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.1
509 0.13
510 0.15
511 0.2
512 0.21
513 0.23
514 0.27
515 0.36
516 0.39
517 0.42
518 0.4
519 0.39
520 0.37
521 0.38
522 0.38