Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SWB3

Protein Details
Accession M2SWB3    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MARGRGSARKKQSAKDKELAKKPVAHydrophilic
363-405EEQELEKRWQQKNKEKEERRRIQRENIEKKRKEKADKGETAEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-25GRGSARKKQSAKDKELAKKPVA
297-327RREKEKLKAGDETSHARARGSKPRVEKRAVK
372-398QQKNKEKEERRRIQRENIEKKRKEKAD
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_239390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARGRGSARKKQSAKDKELAKKPVAGPKSMVIRIGAQEVGKSISDLVNDVRHCLEPDTAIRLKERRANKLKDYLVMCGPLGVSHLLLFSRSESGNTNLRLARTPRGPTLHFRVENYSLCKDIIKAMKRPRSGASDYLVAPLLVMNNFLTSDSDREKLGEKAPPKHLEKLVTDMFQGLFPPIQPHTTPLHSIKRVLLLNREPPSEDTGSINISLRHYAITTKQVGIPKAIRRLYAAEKLVGSRERKKGALPNLGKLEDVADYMLDPSAAGYTSASDTEQDTDAEVEVTAPVRQKVLSRREKEKLKAGDETSHARARGSKPRVEKRAVKLIELGPRMKLRLTKVEEDVCGGKVLWHEFITKSKAEEQELEKRWQQKNKEKEERRRIQRENIEKKRKEKADKGETAEGEGEEAEGDEEMEDFEDYDMDDDVWQDAADAGEEGEDDEDEEMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.78
4 0.78
5 0.81
6 0.8
7 0.72
8 0.7
9 0.67
10 0.68
11 0.61
12 0.54
13 0.47
14 0.46
15 0.51
16 0.45
17 0.4
18 0.33
19 0.33
20 0.32
21 0.31
22 0.27
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.23
41 0.21
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.27
46 0.27
47 0.31
48 0.32
49 0.36
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.56
54 0.62
55 0.64
56 0.7
57 0.68
58 0.67
59 0.62
60 0.55
61 0.47
62 0.41
63 0.34
64 0.25
65 0.22
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.09
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.18
81 0.24
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.37
91 0.38
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.49
96 0.52
97 0.48
98 0.45
99 0.46
100 0.45
101 0.47
102 0.45
103 0.39
104 0.31
105 0.29
106 0.28
107 0.23
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.35
112 0.43
113 0.51
114 0.52
115 0.55
116 0.52
117 0.51
118 0.5
119 0.45
120 0.38
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.27
125 0.2
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.17
144 0.2
145 0.22
146 0.25
147 0.31
148 0.38
149 0.44
150 0.46
151 0.49
152 0.49
153 0.48
154 0.44
155 0.43
156 0.38
157 0.31
158 0.28
159 0.23
160 0.21
161 0.16
162 0.15
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.21
174 0.24
175 0.31
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.3
183 0.26
184 0.33
185 0.33
186 0.33
187 0.29
188 0.28
189 0.3
190 0.25
191 0.22
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.17
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.24
213 0.24
214 0.3
215 0.3
216 0.27
217 0.26
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.28
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.23
228 0.24
229 0.28
230 0.3
231 0.3
232 0.33
233 0.37
234 0.4
235 0.46
236 0.41
237 0.41
238 0.42
239 0.42
240 0.39
241 0.32
242 0.26
243 0.16
244 0.14
245 0.09
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.14
280 0.22
281 0.32
282 0.4
283 0.45
284 0.52
285 0.6
286 0.67
287 0.67
288 0.67
289 0.64
290 0.58
291 0.57
292 0.52
293 0.48
294 0.44
295 0.44
296 0.4
297 0.36
298 0.33
299 0.28
300 0.31
301 0.32
302 0.39
303 0.4
304 0.41
305 0.48
306 0.57
307 0.64
308 0.66
309 0.68
310 0.64
311 0.69
312 0.64
313 0.56
314 0.51
315 0.49
316 0.49
317 0.45
318 0.39
319 0.32
320 0.33
321 0.33
322 0.3
323 0.3
324 0.26
325 0.32
326 0.37
327 0.38
328 0.41
329 0.44
330 0.42
331 0.4
332 0.37
333 0.28
334 0.24
335 0.19
336 0.16
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.25
345 0.23
346 0.24
347 0.28
348 0.3
349 0.31
350 0.35
351 0.36
352 0.42
353 0.46
354 0.48
355 0.47
356 0.52
357 0.57
358 0.59
359 0.64
360 0.63
361 0.69
362 0.76
363 0.82
364 0.84
365 0.88
366 0.91
367 0.92
368 0.92
369 0.92
370 0.87
371 0.86
372 0.86
373 0.86
374 0.86
375 0.87
376 0.87
377 0.83
378 0.84
379 0.84
380 0.83
381 0.82
382 0.8
383 0.8
384 0.8
385 0.81
386 0.81
387 0.78
388 0.69
389 0.62
390 0.54
391 0.43
392 0.33
393 0.25
394 0.17
395 0.1
396 0.09
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06