Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SWX3

Protein Details
Accession M2SWX3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-53DAQAGQNSKKRKNGKEPEANKKPKVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-51KKRKNGKEPEANKKPK
148-173HKKERDGDKIASKLTRKDRKASERNR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_231870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSERGDVTAQTAERADTGTPPVDDGAADAQAGQNSKKRKNGKEPEANKKPKVIENKAVWISNLPPDTTAKEIEDEFSRFGIIDKGADGQPRIKMYMDDETGKFTGNAMVVYFRKEAITNAVNMMDDYVLRPGDYSNGTIRVEPAKIEHKKERDGDKIASKLTRKDRKASERNRAELNRKLNEWSDNEEEVAEAFAPKKNKWAKVVIIKHAFTPAELDEEPEAYLEIKEEMREAAEEYGEVTNCTLYDKEPEGIVTVRFREFEPAEKFMADYQGRGYQKRKLALSLAEDKPRFKKSTRGDEPDSDEGEADRVASTAGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.13
4 0.16
5 0.17
6 0.16
7 0.17
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.18
21 0.26
22 0.32
23 0.41
24 0.49
25 0.57
26 0.67
27 0.75
28 0.81
29 0.84
30 0.87
31 0.89
32 0.91
33 0.89
34 0.81
35 0.76
36 0.7
37 0.66
38 0.67
39 0.64
40 0.62
41 0.58
42 0.64
43 0.62
44 0.57
45 0.51
46 0.42
47 0.36
48 0.33
49 0.3
50 0.21
51 0.19
52 0.2
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.18
82 0.23
83 0.23
84 0.23
85 0.22
86 0.24
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.15
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.08
95 0.11
96 0.11
97 0.14
98 0.14
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.14
131 0.2
132 0.23
133 0.28
134 0.33
135 0.34
136 0.39
137 0.45
138 0.48
139 0.44
140 0.44
141 0.43
142 0.41
143 0.39
144 0.36
145 0.34
146 0.29
147 0.31
148 0.37
149 0.42
150 0.4
151 0.45
152 0.52
153 0.59
154 0.68
155 0.69
156 0.7
157 0.68
158 0.68
159 0.68
160 0.65
161 0.6
162 0.56
163 0.55
164 0.47
165 0.41
166 0.41
167 0.35
168 0.35
169 0.31
170 0.3
171 0.27
172 0.24
173 0.24
174 0.21
175 0.19
176 0.15
177 0.13
178 0.08
179 0.05
180 0.05
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.19
185 0.25
186 0.29
187 0.33
188 0.37
189 0.41
190 0.49
191 0.55
192 0.55
193 0.54
194 0.51
195 0.47
196 0.45
197 0.39
198 0.28
199 0.25
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.22
247 0.22
248 0.29
249 0.31
250 0.31
251 0.31
252 0.31
253 0.31
254 0.25
255 0.32
256 0.24
257 0.2
258 0.2
259 0.27
260 0.29
261 0.33
262 0.36
263 0.35
264 0.41
265 0.47
266 0.46
267 0.41
268 0.43
269 0.44
270 0.47
271 0.49
272 0.48
273 0.5
274 0.5
275 0.51
276 0.52
277 0.54
278 0.51
279 0.45
280 0.49
281 0.5
282 0.6
283 0.66
284 0.68
285 0.68
286 0.7
287 0.75
288 0.71
289 0.63
290 0.52
291 0.43
292 0.35
293 0.29
294 0.23
295 0.16
296 0.1
297 0.08