Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D2U6

Protein Details
Accession B0D2U6    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-46TPEPTISVKKTSKKSKDKGKQKSSTGQGKNHydrophilic
243-294KEVASQKKEKKVNDKKKDEAVEEKDTRKSPVVETKKSKGKKRKGEAEVIDTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-38KKTSKKSKDKGKQK
153-160KKGKKGKL
249-304KKEKKVNDKKKDEAVEEKDTRKSPVVETKKSKGKKRKGEAEVIDTPAPKKSRKAKT
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_315649  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSSPSPSGSGSSRSSATPEPTISVKKTSKKSKDKGKQKSSTGQGKNEGVDQNWAYKPPAGAVLIEEDVDAGEFDWDKVNSDDVDLWLIRVPESVKPKYLENLQVEVPSSSKSTRIGTVKRKHATFDIWSIGGDDDDLPIGGEEIKSISCLLPKKGKKGKLYPAPKPFARHLVIAAQAVVPSPIAPSESGPDPETGKYKSVPRQRYPTELLKHRFMPYGSVGGVDESVVGPANAGDVAMDVDVKEVASQKKEKKVNDKKKDEAVEEKDTRKSPVVETKKSKGKKRKGEAEVIDTPAPKKSRKAKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.31
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.31
8 0.36
9 0.34
10 0.38
11 0.41
12 0.46
13 0.54
14 0.62
15 0.69
16 0.74
17 0.81
18 0.84
19 0.88
20 0.9
21 0.92
22 0.92
23 0.9
24 0.86
25 0.86
26 0.84
27 0.84
28 0.8
29 0.75
30 0.7
31 0.64
32 0.58
33 0.53
34 0.46
35 0.36
36 0.35
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.28
41 0.24
42 0.24
43 0.23
44 0.19
45 0.21
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.12
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.11
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.14
79 0.22
80 0.23
81 0.25
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.33
86 0.35
87 0.31
88 0.32
89 0.29
90 0.28
91 0.28
92 0.25
93 0.2
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.18
101 0.24
102 0.3
103 0.39
104 0.47
105 0.54
106 0.57
107 0.57
108 0.53
109 0.5
110 0.46
111 0.38
112 0.34
113 0.27
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.17
118 0.13
119 0.1
120 0.07
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.08
136 0.1
137 0.13
138 0.21
139 0.23
140 0.33
141 0.39
142 0.46
143 0.49
144 0.56
145 0.62
146 0.63
147 0.69
148 0.68
149 0.69
150 0.68
151 0.63
152 0.59
153 0.52
154 0.49
155 0.42
156 0.34
157 0.27
158 0.24
159 0.24
160 0.2
161 0.18
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.08
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.23
185 0.3
186 0.38
187 0.45
188 0.49
189 0.56
190 0.58
191 0.62
192 0.61
193 0.62
194 0.61
195 0.61
196 0.59
197 0.55
198 0.55
199 0.5
200 0.47
201 0.39
202 0.34
203 0.27
204 0.25
205 0.21
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.08
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.1
232 0.13
233 0.18
234 0.26
235 0.32
236 0.42
237 0.48
238 0.55
239 0.62
240 0.7
241 0.76
242 0.8
243 0.82
244 0.79
245 0.81
246 0.8
247 0.74
248 0.72
249 0.67
250 0.66
251 0.63
252 0.6
253 0.58
254 0.53
255 0.52
256 0.47
257 0.42
258 0.39
259 0.44
260 0.5
261 0.53
262 0.6
263 0.65
264 0.7
265 0.76
266 0.8
267 0.81
268 0.82
269 0.83
270 0.86
271 0.88
272 0.86
273 0.88
274 0.83
275 0.81
276 0.75
277 0.69
278 0.61
279 0.52
280 0.46
281 0.42
282 0.4
283 0.35
284 0.39