Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PE36

Protein Details
Accession A0A1D8PE36    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-252NHKGGNKKFKKGNNNGKGKNNKNENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-246HKGGNKKFKKGNNNGKGK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0062040  C:fungal biofilm matrix  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG cal:CAALFM_C107500CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MTDFVYQGEDFDEKVRKQVEFYFSDSNLQTDKFLWKIYESNDGWVELKTILTFGRMRQYRPEDKVISALKESKKLVLSANNDMIRRKDPIKDFNEVKNTRKRNTIHIEGFPKDLSQDDVENWVNEKVIVQLPKEKEVCSIRRIKSRAKKEFFGVVDIEFKTQEDAEFILNNVELSYPEGIISKEDAQSLEKKDLLKKMTLLTFQEMRESSKRFGVNEVTKRRNSFNENHKGGNKKFKKGNNNGKGKNNKNENDNGNGTEDKETKLEKVEEIDSTKENTEEVAAKETAPESTEKTETKEAPAPTTETETETKTEVTEATEAAKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.28
4 0.31
5 0.37
6 0.39
7 0.36
8 0.41
9 0.41
10 0.39
11 0.43
12 0.4
13 0.35
14 0.3
15 0.27
16 0.23
17 0.19
18 0.23
19 0.19
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.24
24 0.25
25 0.33
26 0.29
27 0.32
28 0.31
29 0.31
30 0.3
31 0.26
32 0.25
33 0.15
34 0.15
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.23
42 0.25
43 0.27
44 0.36
45 0.44
46 0.49
47 0.54
48 0.59
49 0.52
50 0.5
51 0.56
52 0.5
53 0.43
54 0.38
55 0.4
56 0.35
57 0.38
58 0.37
59 0.34
60 0.32
61 0.31
62 0.32
63 0.32
64 0.34
65 0.34
66 0.41
67 0.4
68 0.4
69 0.4
70 0.39
71 0.34
72 0.33
73 0.3
74 0.3
75 0.33
76 0.41
77 0.43
78 0.48
79 0.5
80 0.53
81 0.6
82 0.56
83 0.57
84 0.57
85 0.59
86 0.54
87 0.58
88 0.53
89 0.52
90 0.57
91 0.59
92 0.54
93 0.55
94 0.57
95 0.51
96 0.5
97 0.41
98 0.33
99 0.24
100 0.2
101 0.16
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.19
118 0.2
119 0.26
120 0.26
121 0.24
122 0.26
123 0.3
124 0.33
125 0.32
126 0.4
127 0.38
128 0.45
129 0.48
130 0.53
131 0.56
132 0.63
133 0.68
134 0.64
135 0.62
136 0.57
137 0.6
138 0.51
139 0.44
140 0.34
141 0.24
142 0.22
143 0.2
144 0.18
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.23
180 0.27
181 0.28
182 0.25
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.25
188 0.23
189 0.25
190 0.23
191 0.25
192 0.22
193 0.24
194 0.26
195 0.27
196 0.25
197 0.27
198 0.29
199 0.26
200 0.29
201 0.32
202 0.36
203 0.42
204 0.5
205 0.51
206 0.52
207 0.54
208 0.54
209 0.52
210 0.49
211 0.49
212 0.5
213 0.55
214 0.55
215 0.57
216 0.58
217 0.6
218 0.59
219 0.61
220 0.57
221 0.54
222 0.59
223 0.62
224 0.68
225 0.71
226 0.78
227 0.77
228 0.82
229 0.8
230 0.83
231 0.85
232 0.82
233 0.8
234 0.79
235 0.72
236 0.68
237 0.68
238 0.62
239 0.59
240 0.53
241 0.45
242 0.39
243 0.36
244 0.32
245 0.29
246 0.27
247 0.22
248 0.22
249 0.22
250 0.2
251 0.24
252 0.24
253 0.2
254 0.23
255 0.23
256 0.24
257 0.26
258 0.27
259 0.24
260 0.24
261 0.24
262 0.2
263 0.18
264 0.15
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.19
272 0.19
273 0.17
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.18
278 0.23
279 0.23
280 0.28
281 0.34
282 0.34
283 0.38
284 0.41
285 0.38
286 0.37
287 0.39
288 0.37
289 0.32
290 0.36
291 0.31
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.27
296 0.26
297 0.24
298 0.19
299 0.19
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.15