Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SNW8

Protein Details
Accession M2SNW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-286QQVERTLRKREDKRQDRLRKISLKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-200AKSLRKKAAA
270-281KREDKRQDRLRK
Subcellular Location(s) mito 19, plas 3, nucl 1, cyto 1, extr 1, cyto_nucl 1, pero 1, E.R. 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033122  LETM1-like_RBD  
IPR044202  LETM1/MDM38-like  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0043022  F:ribosome binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_33750  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07766  LETM1_RBD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51758  LETM1_RBD  
Amino Acid Sequences MKSRPMFSTFVKPLQSNSAFGRLPRHRHLYTRATTAGLSCQIWYERSQYTTQQAGYEKIVGVQGRRHASSSAAPAKRTGHNIAAAPPPLSKTNSTRVPAKTSPQRPLQPVRNSPSSPLPPVPIHPSKSATAPTLRAIEKLNPPPFAYAPEISVPARKADQNLIKWLWSAGRAYLAFYKKGISHVRQTAKLAKSLRKKAAAHTPKRPMTEVLTRAEWQVVRRSRRDVLRLPVFGVLMLLLGEWLPVVVLYLTPVIPEVCRIPQQVERTLRKREDKRQDRLRKISLKSMRLLGKDRPASSTLSDSSSSGAIPKGKTWADMSLFELCVTAAKLDVYPAVFDWVPLAPPKWWMQRSVRRKLEYLETDYRLIERDGGLGGLNAEEVKRACVERGVVVLGRKEEELRRALAGVWAEARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.4
4 0.38
5 0.4
6 0.36
7 0.37
8 0.45
9 0.43
10 0.48
11 0.53
12 0.57
13 0.53
14 0.59
15 0.66
16 0.66
17 0.63
18 0.62
19 0.56
20 0.49
21 0.46
22 0.4
23 0.36
24 0.3
25 0.25
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.21
33 0.24
34 0.27
35 0.28
36 0.32
37 0.35
38 0.34
39 0.34
40 0.33
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.24
45 0.21
46 0.23
47 0.2
48 0.2
49 0.21
50 0.26
51 0.29
52 0.3
53 0.3
54 0.28
55 0.29
56 0.31
57 0.35
58 0.39
59 0.37
60 0.36
61 0.38
62 0.41
63 0.43
64 0.44
65 0.39
66 0.33
67 0.34
68 0.35
69 0.36
70 0.36
71 0.33
72 0.29
73 0.25
74 0.24
75 0.23
76 0.24
77 0.24
78 0.24
79 0.31
80 0.37
81 0.4
82 0.44
83 0.45
84 0.5
85 0.49
86 0.53
87 0.55
88 0.55
89 0.58
90 0.6
91 0.63
92 0.61
93 0.67
94 0.68
95 0.67
96 0.68
97 0.68
98 0.67
99 0.61
100 0.58
101 0.57
102 0.51
103 0.46
104 0.39
105 0.37
106 0.31
107 0.33
108 0.38
109 0.36
110 0.35
111 0.34
112 0.35
113 0.32
114 0.34
115 0.33
116 0.28
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.25
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.26
125 0.31
126 0.38
127 0.38
128 0.35
129 0.35
130 0.36
131 0.34
132 0.32
133 0.28
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.15
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.21
146 0.28
147 0.27
148 0.32
149 0.31
150 0.3
151 0.29
152 0.28
153 0.21
154 0.16
155 0.14
156 0.09
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.18
165 0.16
166 0.21
167 0.25
168 0.22
169 0.27
170 0.34
171 0.38
172 0.38
173 0.41
174 0.43
175 0.39
176 0.41
177 0.39
178 0.39
179 0.44
180 0.49
181 0.51
182 0.51
183 0.5
184 0.49
185 0.56
186 0.59
187 0.56
188 0.57
189 0.61
190 0.58
191 0.59
192 0.55
193 0.46
194 0.41
195 0.41
196 0.36
197 0.29
198 0.27
199 0.26
200 0.25
201 0.25
202 0.22
203 0.16
204 0.21
205 0.25
206 0.28
207 0.3
208 0.34
209 0.37
210 0.41
211 0.46
212 0.43
213 0.44
214 0.46
215 0.44
216 0.41
217 0.37
218 0.32
219 0.26
220 0.21
221 0.12
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.03
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.2
249 0.24
250 0.31
251 0.38
252 0.44
253 0.47
254 0.54
255 0.57
256 0.62
257 0.66
258 0.69
259 0.72
260 0.73
261 0.78
262 0.82
263 0.86
264 0.86
265 0.86
266 0.84
267 0.81
268 0.74
269 0.74
270 0.71
271 0.64
272 0.57
273 0.56
274 0.52
275 0.46
276 0.48
277 0.43
278 0.43
279 0.44
280 0.43
281 0.39
282 0.36
283 0.35
284 0.32
285 0.32
286 0.24
287 0.22
288 0.22
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.15
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.19
299 0.19
300 0.21
301 0.22
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.26
306 0.24
307 0.24
308 0.22
309 0.2
310 0.15
311 0.13
312 0.12
313 0.09
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.12
331 0.16
332 0.22
333 0.3
334 0.31
335 0.37
336 0.45
337 0.54
338 0.64
339 0.71
340 0.74
341 0.69
342 0.69
343 0.67
344 0.66
345 0.62
346 0.6
347 0.57
348 0.51
349 0.49
350 0.47
351 0.43
352 0.35
353 0.29
354 0.23
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.09
367 0.09
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.15
372 0.18
373 0.2
374 0.19
375 0.21
376 0.22
377 0.23
378 0.25
379 0.27
380 0.26
381 0.26
382 0.25
383 0.27
384 0.28
385 0.32
386 0.32
387 0.31
388 0.3
389 0.29
390 0.29
391 0.28
392 0.25
393 0.21