Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2TFD6

Protein Details
Accession M2TFD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40ATTGKGRRTSNRSKKAGTKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-37GRRTSNRSKKAGTK
209-244APAPKKAKRASKAKRASTRSSTASTASKRATRGKKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001370  BIR_rpt  
KEGG bsc:COCSADRAFT_32924  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MDASLASYHARLATFEGAATTGKGRRTSNRSKKAGTKSKASWPLTAPSAQDLAYAGFVWRPTSTSPDNVQCFSCECQLDGWEEADIPAYEHSTHSPSCGFATIACIRLRAGDPGRTEDDPTSDAMVAARRSTFGDMWPLDVASGYPSVDQMVDAGWFYDPATDTPDGVTCPYCSLALDAWDIGDDPMQEHRRRSPDCLFFVLSELYKPAPAPKKAKRASKAKRASTRSSTASTASKRATRGKKRTSDAVEETEYSEVIQPAPKRVRSSSIESFPSDLPVGTPKKTPTGIRDTVMDDFDMSSLPADLAVGTPKRTPPMMSEADDIPEPINWKPADVDAVITSQEEAHGYLSEILADSGLDNAQTADMTPEELYEYVMASLTDEEKRMTIEQWVLHNAKRGEEKLRMACEQQILAFEAEGQRAMAVLEGIPTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.16
9 0.2
10 0.25
11 0.28
12 0.37
13 0.46
14 0.56
15 0.63
16 0.7
17 0.73
18 0.76
19 0.81
20 0.83
21 0.85
22 0.79
23 0.77
24 0.72
25 0.75
26 0.78
27 0.71
28 0.65
29 0.57
30 0.57
31 0.51
32 0.48
33 0.38
34 0.31
35 0.3
36 0.25
37 0.22
38 0.17
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.19
50 0.22
51 0.25
52 0.31
53 0.37
54 0.4
55 0.4
56 0.4
57 0.34
58 0.34
59 0.31
60 0.31
61 0.23
62 0.2
63 0.2
64 0.21
65 0.22
66 0.2
67 0.18
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.1
88 0.17
89 0.17
90 0.21
91 0.2
92 0.2
93 0.18
94 0.21
95 0.22
96 0.22
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.3
101 0.34
102 0.32
103 0.33
104 0.27
105 0.26
106 0.22
107 0.21
108 0.18
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.17
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.07
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.11
174 0.17
175 0.18
176 0.2
177 0.25
178 0.32
179 0.34
180 0.39
181 0.4
182 0.42
183 0.43
184 0.44
185 0.4
186 0.33
187 0.32
188 0.27
189 0.19
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.13
196 0.18
197 0.24
198 0.32
199 0.38
200 0.48
201 0.54
202 0.62
203 0.63
204 0.68
205 0.72
206 0.74
207 0.76
208 0.74
209 0.77
210 0.75
211 0.73
212 0.68
213 0.64
214 0.56
215 0.5
216 0.42
217 0.36
218 0.34
219 0.3
220 0.28
221 0.26
222 0.26
223 0.26
224 0.34
225 0.42
226 0.48
227 0.56
228 0.61
229 0.67
230 0.67
231 0.72
232 0.67
233 0.64
234 0.57
235 0.51
236 0.43
237 0.36
238 0.33
239 0.26
240 0.21
241 0.15
242 0.12
243 0.09
244 0.08
245 0.11
246 0.1
247 0.17
248 0.22
249 0.25
250 0.26
251 0.28
252 0.33
253 0.34
254 0.42
255 0.41
256 0.41
257 0.41
258 0.39
259 0.4
260 0.33
261 0.31
262 0.23
263 0.17
264 0.12
265 0.16
266 0.18
267 0.17
268 0.2
269 0.2
270 0.23
271 0.26
272 0.29
273 0.28
274 0.34
275 0.36
276 0.34
277 0.35
278 0.34
279 0.33
280 0.3
281 0.24
282 0.16
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.08
295 0.09
296 0.11
297 0.13
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.24
304 0.27
305 0.28
306 0.29
307 0.28
308 0.28
309 0.27
310 0.24
311 0.17
312 0.14
313 0.13
314 0.11
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.18
375 0.2
376 0.23
377 0.27
378 0.33
379 0.34
380 0.34
381 0.41
382 0.38
383 0.38
384 0.41
385 0.41
386 0.4
387 0.44
388 0.5
389 0.49
390 0.54
391 0.52
392 0.47
393 0.48
394 0.45
395 0.4
396 0.33
397 0.28
398 0.25
399 0.23
400 0.2
401 0.18
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.13
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.06