FuNGI

M2TJ40

Protein Details

Accession

M2TJ40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-84	NGFPAHKKRTPRVSAFKQQRAAK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-73	KKRTPR
458-458	R

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	bsc:COCSADRAFT_33592 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MEFQRGERVNLNFDTGAVEKLEPEEQNVLPMPSFPAFVGDIQERDSSSANPPVAPSPKPNVNGFPAHKKRTPRVSAFKQQRAAKEKQAAAAPPPNPRSAFAPDPDEERRAIDEENRRTIAAMSDAEIEQERKELMASLNPALLQKLLLRSNIDQGSNERDFDVEPPAPAATKPPATEKAEEEIQTKSTSTKKVSFAASGPVDESKLPKSTTSPSISATEPSSDAIKSALEQQTDDSIHFPRPPQPPDLDPNDPAFLKNLHEKYFPNLAYDPSKLSWMSPIDPSDEKSPYHPSQTALNPAELRFDFEGNLLAPSVAREIPTDRGLHHHAEAPEAAGYTIPELAVTARSKVSSQRCIAYQTLGRILYRLGKGQFGVESAQKTDGPVRVAKNPDVEEDDDDDGEWVEEDVGSAIAGGLWQCVEEGRVIETLTEEANKERGHLTARTFAQEALWNWRRGGGRKRHAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.23
3	0.22
4	0.18
5	0.17
6	0.13
7	0.16
8	0.2
9	0.17
10	0.19
11	0.22
12	0.2
13	0.24
14	0.25
15	0.24
16	0.19
17	0.2
18	0.2
19	0.17
20	0.18
21	0.14
22	0.15
23	0.15
24	0.16
25	0.19
26	0.18
27	0.18
28	0.2
29	0.21
30	0.19
31	0.19
32	0.2
33	0.18
34	0.2
35	0.26
36	0.24
37	0.23
38	0.25
39	0.29
40	0.32
41	0.33
42	0.33
43	0.34
44	0.41
45	0.44
46	0.45
47	0.44
48	0.44
49	0.5
50	0.5
51	0.54
52	0.56
53	0.59
54	0.61
55	0.64
56	0.68
57	0.7
58	0.74
59	0.72
60	0.74
61	0.76
62	0.82
63	0.84
64	0.83
65	0.81
66	0.77
67	0.77
68	0.73
69	0.69
70	0.67
71	0.65
72	0.59
73	0.55
74	0.54
75	0.47
76	0.45
77	0.47
78	0.42
79	0.41
80	0.42
81	0.42
82	0.39
83	0.38
84	0.37
85	0.36
86	0.37
87	0.32
88	0.35
89	0.32
90	0.36
91	0.38
92	0.35
93	0.29
94	0.26
95	0.25
96	0.22
97	0.22
98	0.24
99	0.3
100	0.34
101	0.4
102	0.39
103	0.37
104	0.36
105	0.35
106	0.29
107	0.23
108	0.17
109	0.13
110	0.14
111	0.13
112	0.14
113	0.14
114	0.13
115	0.1
116	0.11
117	0.1
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.12
123	0.14
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.15
128	0.13
129	0.13
130	0.1
131	0.09
132	0.13
133	0.14
134	0.15
135	0.18
136	0.18
137	0.25
138	0.26
139	0.25
140	0.22
141	0.22
142	0.27
143	0.26
144	0.25
145	0.19
146	0.17
147	0.17
148	0.17
149	0.2
150	0.13
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.14
157	0.12
158	0.14
159	0.15
160	0.18
161	0.24
162	0.27
163	0.29
164	0.28
165	0.29
166	0.3
167	0.3
168	0.27
169	0.22
170	0.2
171	0.18
172	0.17
173	0.16
174	0.17
175	0.19
176	0.22
177	0.26
178	0.28
179	0.31
180	0.32
181	0.3
182	0.27
183	0.29
184	0.26
185	0.2
186	0.18
187	0.15
188	0.15
189	0.13
190	0.14
191	0.1
192	0.12
193	0.13
194	0.12
195	0.14
196	0.18
197	0.23
198	0.25
199	0.24
200	0.24
201	0.26
202	0.26
203	0.24
204	0.21
205	0.16
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.12
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.12
223	0.11
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.18
228	0.24
229	0.26
230	0.27
231	0.28
232	0.3
233	0.34
234	0.39
235	0.34
236	0.3
237	0.3
238	0.28
239	0.26
240	0.23
241	0.19
242	0.14
243	0.13
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.22
248	0.22
249	0.25
250	0.32
251	0.3
252	0.25
253	0.24
254	0.24
255	0.25
256	0.25
257	0.23
258	0.16
259	0.18
260	0.15
261	0.14
262	0.16
263	0.15
264	0.16
265	0.16
266	0.17
267	0.19
268	0.19
269	0.21
270	0.21
271	0.21
272	0.2
273	0.2
274	0.27
275	0.25
276	0.28
277	0.28
278	0.25
279	0.29
280	0.31
281	0.37
282	0.31
283	0.31
284	0.28
285	0.27
286	0.29
287	0.23
288	0.24
289	0.17
290	0.16
291	0.15
292	0.14
293	0.15
294	0.11
295	0.11
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.1
305	0.13
306	0.16
307	0.17
308	0.15
309	0.2
310	0.23
311	0.24
312	0.23
313	0.25
314	0.22
315	0.23
316	0.23
317	0.19
318	0.16
319	0.14
320	0.13
321	0.08
322	0.08
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.21
336	0.28
337	0.31
338	0.33
339	0.35
340	0.36
341	0.39
342	0.39
343	0.37
344	0.33
345	0.28
346	0.31
347	0.29
348	0.27
349	0.23
350	0.24
351	0.25
352	0.24
353	0.25
354	0.22
355	0.22
356	0.23
357	0.24
358	0.23
359	0.18
360	0.19
361	0.17
362	0.17
363	0.17
364	0.19
365	0.18
366	0.19
367	0.22
368	0.23
369	0.22
370	0.26
371	0.28
372	0.32
373	0.37
374	0.38
375	0.4
376	0.38
377	0.38
378	0.38
379	0.36
380	0.32
381	0.31
382	0.3
383	0.24
384	0.22
385	0.19
386	0.15
387	0.13
388	0.1
389	0.07
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.09
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.18
420	0.18
421	0.19
422	0.19
423	0.2
424	0.23
425	0.26
426	0.29
427	0.32
428	0.34
429	0.36
430	0.36
431	0.34
432	0.32
433	0.34
434	0.32
435	0.34
436	0.39
437	0.37
438	0.36
439	0.42
440	0.45
441	0.47
442	0.55
443	0.55

M2TJ40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer