Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2REP5

Protein Details
Accession M2REP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
424-445DMWQEKKKERLSERKDEDRERSBasic
450-474GGGGKNKWNKGKGKYSRNHYSKNMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-246RKGRKRSR
429-467KKKERLSERKDEDRERSYRGGGGGGKNKWNKGKGKYSRN
Subcellular Location(s) mito 18, cyto_mito 12.333, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_88422  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MATPPKESRKKVLEGIFAVNKTQWASSAGVLRDLQEHFACSSLLAPWLENQKRSLILSHAKQKHINNLKVKLGHGGTLDPMATGVLIVGLGRGTKCLQRFLECTKTYECVVLFGAATDSYDAVGKVVSKAPYEHVTRELVEEKLAQFRGKIMQKPSVFSALKVDGKKMYEYAREGKEIPEVAARPVEVEELELVEWLEPGSHEYAWPKEEVDGVEMEGAKKLLGIREVDAKIHANTMARKGRKRSRSPEDDSVEGAGKQPKMPKSETEPAMSGALPSQETPTEAAETIQDVTPRTATDSSLPTEGKPEPSSEKAEVVNQVQSSNEDPTTSTQPPPQPPAARLRMTVTSGFYVRSLCHDLGLACSSLGLMSSLIRSRQGAYTLGQNVIELSDFESAEKWEPQLQQQLEEFMEKEGWEAEELEDDDMWQEKKKERLSERKDEDRERSYRGGGGGGKNKWNKGKGKYSRNHYSKNMDGGKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.6
4 0.53
5 0.48
6 0.4
7 0.35
8 0.29
9 0.25
10 0.19
11 0.16
12 0.17
13 0.19
14 0.25
15 0.23
16 0.26
17 0.26
18 0.26
19 0.27
20 0.26
21 0.27
22 0.21
23 0.22
24 0.18
25 0.19
26 0.18
27 0.14
28 0.14
29 0.11
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.26
35 0.3
36 0.31
37 0.32
38 0.32
39 0.33
40 0.34
41 0.33
42 0.29
43 0.34
44 0.39
45 0.48
46 0.51
47 0.54
48 0.59
49 0.6
50 0.64
51 0.66
52 0.67
53 0.65
54 0.64
55 0.66
56 0.62
57 0.59
58 0.55
59 0.46
60 0.4
61 0.32
62 0.27
63 0.21
64 0.2
65 0.19
66 0.12
67 0.11
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.09
81 0.13
82 0.15
83 0.22
84 0.24
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.46
89 0.43
90 0.45
91 0.41
92 0.41
93 0.37
94 0.35
95 0.28
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.18
118 0.23
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.26
125 0.25
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.2
131 0.2
132 0.18
133 0.15
134 0.17
135 0.24
136 0.27
137 0.31
138 0.3
139 0.37
140 0.38
141 0.4
142 0.4
143 0.41
144 0.36
145 0.31
146 0.32
147 0.29
148 0.33
149 0.31
150 0.31
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.24
158 0.29
159 0.28
160 0.29
161 0.29
162 0.28
163 0.27
164 0.24
165 0.21
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.1
222 0.11
223 0.18
224 0.24
225 0.26
226 0.3
227 0.37
228 0.44
229 0.52
230 0.59
231 0.61
232 0.64
233 0.69
234 0.72
235 0.74
236 0.68
237 0.59
238 0.52
239 0.44
240 0.35
241 0.26
242 0.21
243 0.16
244 0.13
245 0.14
246 0.19
247 0.21
248 0.24
249 0.26
250 0.27
251 0.31
252 0.39
253 0.39
254 0.36
255 0.34
256 0.31
257 0.3
258 0.27
259 0.19
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.18
288 0.18
289 0.16
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.23
297 0.28
298 0.25
299 0.26
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.23
304 0.23
305 0.19
306 0.18
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.21
316 0.22
317 0.21
318 0.24
319 0.3
320 0.34
321 0.38
322 0.41
323 0.38
324 0.39
325 0.46
326 0.48
327 0.44
328 0.41
329 0.4
330 0.36
331 0.35
332 0.34
333 0.27
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.17
338 0.15
339 0.13
340 0.16
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.18
347 0.19
348 0.15
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.07
358 0.09
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.14
363 0.16
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.23
368 0.24
369 0.24
370 0.22
371 0.2
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.09
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.18
386 0.2
387 0.25
388 0.33
389 0.32
390 0.33
391 0.33
392 0.34
393 0.3
394 0.3
395 0.25
396 0.18
397 0.18
398 0.14
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.11
410 0.12
411 0.14
412 0.14
413 0.15
414 0.19
415 0.23
416 0.32
417 0.38
418 0.47
419 0.54
420 0.65
421 0.69
422 0.76
423 0.79
424 0.82
425 0.83
426 0.82
427 0.79
428 0.77
429 0.72
430 0.67
431 0.63
432 0.54
433 0.49
434 0.42
435 0.39
436 0.36
437 0.4
438 0.42
439 0.43
440 0.5
441 0.52
442 0.58
443 0.6
444 0.63
445 0.63
446 0.64
447 0.71
448 0.72
449 0.78
450 0.8
451 0.82
452 0.85
453 0.85
454 0.84
455 0.81
456 0.79
457 0.75
458 0.76
459 0.75