Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SSX2

Protein Details
Accession M2SSX2    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-110LSKSSDRKRKRGDDTSKSQEDHydrophilic
276-296VSREHKKKEKELVKEGKKPFFBasic
309-343DRFQNMKSKQRDKVIERRRKKVTAKERRNMPDTRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-100KRKR
120-146RQIKAEKLASGAQPSKKAKTSSKSKAK
249-338EKERLKKKLLSMESQQKARENKEKLKEVSREHKKKEKELVKEGKKPFFLKKSEQKKIALVDRFQNMKSKQRDKVIERRRKKVTAKERRNM
Subcellular Location(s) nucl 25, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_175025  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MLAMVLANKLDRNLRAVEESSDGEDYYEVTDRSSSASVIEADEGGNVISSGGEEDAGSEDRSDVENDDDQVKAQMSRVSFGALAKAQDVLSKSSDRKRKRGDDTSKSQEDKLEALRERLRQIKAEKLASGAQPSKKAKTSSKSKAKPVQSDSGDDDASDSEGSDSDAAPHARSSKHAPAVQSSKRMVSRKRQVVEVKKPVFRDPRFDNVSGPRPDEYVVDKRYSFLNDYRASEISELRNTIKKTKNEDEKERLKKKLLSMESQQKARENKEKLKEVSREHKKKEKELVKEGKKPFFLKKSEQKKIALVDRFQNMKSKQRDKVIERRRKKVTAKERRNMPDTRRTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.27
6 0.27
7 0.26
8 0.24
9 0.21
10 0.18
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.15
20 0.16
21 0.13
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.05
38 0.04
39 0.05
40 0.04
41 0.05
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.14
62 0.13
63 0.15
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.15
78 0.19
79 0.23
80 0.3
81 0.39
82 0.43
83 0.51
84 0.59
85 0.65
86 0.71
87 0.77
88 0.79
89 0.8
90 0.82
91 0.82
92 0.79
93 0.71
94 0.63
95 0.54
96 0.45
97 0.38
98 0.33
99 0.31
100 0.25
101 0.28
102 0.32
103 0.32
104 0.35
105 0.39
106 0.37
107 0.35
108 0.37
109 0.4
110 0.41
111 0.4
112 0.36
113 0.32
114 0.33
115 0.29
116 0.3
117 0.27
118 0.24
119 0.3
120 0.32
121 0.33
122 0.34
123 0.38
124 0.39
125 0.43
126 0.51
127 0.54
128 0.62
129 0.64
130 0.69
131 0.73
132 0.73
133 0.72
134 0.67
135 0.64
136 0.55
137 0.52
138 0.47
139 0.41
140 0.34
141 0.27
142 0.22
143 0.14
144 0.13
145 0.1
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.17
161 0.2
162 0.25
163 0.27
164 0.27
165 0.3
166 0.37
167 0.38
168 0.37
169 0.33
170 0.31
171 0.35
172 0.39
173 0.39
174 0.42
175 0.49
176 0.52
177 0.52
178 0.56
179 0.58
180 0.63
181 0.68
182 0.68
183 0.63
184 0.58
185 0.59
186 0.58
187 0.6
188 0.52
189 0.49
190 0.44
191 0.47
192 0.48
193 0.47
194 0.44
195 0.4
196 0.47
197 0.41
198 0.39
199 0.31
200 0.27
201 0.26
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.24
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.26
210 0.26
211 0.24
212 0.2
213 0.25
214 0.26
215 0.28
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.26
220 0.26
221 0.21
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.24
226 0.25
227 0.32
228 0.37
229 0.4
230 0.46
231 0.54
232 0.62
233 0.65
234 0.72
235 0.72
236 0.75
237 0.8
238 0.78
239 0.73
240 0.68
241 0.65
242 0.62
243 0.62
244 0.57
245 0.52
246 0.54
247 0.6
248 0.6
249 0.59
250 0.56
251 0.52
252 0.53
253 0.54
254 0.55
255 0.52
256 0.56
257 0.61
258 0.67
259 0.65
260 0.69
261 0.69
262 0.67
263 0.7
264 0.73
265 0.73
266 0.73
267 0.77
268 0.75
269 0.77
270 0.79
271 0.77
272 0.74
273 0.76
274 0.79
275 0.79
276 0.82
277 0.81
278 0.77
279 0.74
280 0.7
281 0.68
282 0.66
283 0.63
284 0.63
285 0.67
286 0.71
287 0.75
288 0.76
289 0.7
290 0.67
291 0.68
292 0.67
293 0.63
294 0.56
295 0.53
296 0.55
297 0.55
298 0.5
299 0.52
300 0.47
301 0.5
302 0.56
303 0.58
304 0.58
305 0.64
306 0.73
307 0.72
308 0.79
309 0.81
310 0.82
311 0.82
312 0.84
313 0.83
314 0.83
315 0.84
316 0.84
317 0.84
318 0.85
319 0.87
320 0.87
321 0.88
322 0.87
323 0.85
324 0.82
325 0.78