Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SBC1

Protein Details
Accession M2SBC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-111TDARDAPRGKGKNKNKKEKKQKGQNTSRTFGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-102DAPRGKGKNKNKKEKKQKG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_100973  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MVDVKFEAPSSPKKRARTSTPEAEGAADTSFKRVKGVAPIKAEFLIHRNDNKVDARDHVIDDDAAEAADADHKSEGLAKTDARDAPRGKGKNKNKKEKKQKGQNTSRTFGSSRDKIPLCGTRAQYNEFSPKDCPFGEKCKFEHDLRKYLKEGRREDLTTFDGQCPIYAVKGFCHFGWKCRFVGSHSEERTTEDGRKELVLKENAELKAKLSGNDDEAEAEVVNIVPKEVKFGLSRRKIGTPRSDQYLQWIESNSRNERDMFDAAQMDPEILKEEKEARRAEYVEAPFRPSEKRRLYYGPETPMLAPLTTQGNLPYRRLCIDFGCQVTWSEMAMGMPLIQGDKGEWALMKAHESEISPPKFLAENTVVQGYDNSTDLKFGAQIAANKPWLATKTVEVLTDHCPKLRAIDLNCGCPINLVCEKGSGSALLDSEAKLEHILRGMAYVSKEVPITVKIRMGTKDNHPTAQKLIKRLVLGGHEAVESGKGTSGIAAITLHGRSKQQRYTKSADWSYIAECSALINRLRKEKDAQTDTIAEADPRDLANGGHVYFVGNGDFYSHIDYYNHLENAKVDTVMAGRGALIKPWLFEEIEQGQYLDKSATERLSYIEKFTKYGLQTWGSDEMGIGTTRRFLLEWLSFAHRYVPVGLLEHLPPHINDRPPRFKGRNELETLMASEHYKDWIKISEMFLGPAHEHFKFEPKHKSNAYEFEAEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.72
3 0.77
4 0.76
5 0.78
6 0.78
7 0.76
8 0.71
9 0.62
10 0.55
11 0.46
12 0.37
13 0.29
14 0.21
15 0.15
16 0.18
17 0.2
18 0.18
19 0.2
20 0.2
21 0.23
22 0.31
23 0.39
24 0.41
25 0.45
26 0.47
27 0.47
28 0.47
29 0.44
30 0.35
31 0.31
32 0.31
33 0.3
34 0.33
35 0.35
36 0.36
37 0.41
38 0.44
39 0.44
40 0.39
41 0.37
42 0.39
43 0.37
44 0.37
45 0.32
46 0.28
47 0.24
48 0.22
49 0.19
50 0.13
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.05
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.16
62 0.18
63 0.17
64 0.2
65 0.19
66 0.21
67 0.28
68 0.31
69 0.29
70 0.35
71 0.33
72 0.39
73 0.47
74 0.52
75 0.52
76 0.6
77 0.68
78 0.71
79 0.8
80 0.84
81 0.85
82 0.9
83 0.95
84 0.95
85 0.95
86 0.95
87 0.95
88 0.95
89 0.95
90 0.94
91 0.9
92 0.83
93 0.74
94 0.68
95 0.58
96 0.53
97 0.5
98 0.45
99 0.4
100 0.45
101 0.44
102 0.41
103 0.46
104 0.47
105 0.42
106 0.44
107 0.44
108 0.42
109 0.44
110 0.46
111 0.43
112 0.4
113 0.45
114 0.39
115 0.39
116 0.35
117 0.34
118 0.34
119 0.31
120 0.32
121 0.28
122 0.37
123 0.42
124 0.43
125 0.43
126 0.46
127 0.5
128 0.5
129 0.56
130 0.53
131 0.55
132 0.56
133 0.59
134 0.56
135 0.61
136 0.61
137 0.6
138 0.59
139 0.54
140 0.55
141 0.52
142 0.49
143 0.44
144 0.42
145 0.37
146 0.34
147 0.3
148 0.26
149 0.24
150 0.23
151 0.2
152 0.17
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.18
158 0.2
159 0.18
160 0.26
161 0.26
162 0.3
163 0.38
164 0.39
165 0.35
166 0.37
167 0.38
168 0.32
169 0.42
170 0.4
171 0.41
172 0.41
173 0.43
174 0.4
175 0.42
176 0.42
177 0.35
178 0.34
179 0.26
180 0.25
181 0.24
182 0.25
183 0.23
184 0.23
185 0.28
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.33
190 0.33
191 0.34
192 0.3
193 0.24
194 0.27
195 0.27
196 0.26
197 0.23
198 0.23
199 0.22
200 0.23
201 0.22
202 0.15
203 0.14
204 0.13
205 0.1
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.1
215 0.1
216 0.13
217 0.15
218 0.21
219 0.31
220 0.36
221 0.4
222 0.4
223 0.47
224 0.49
225 0.53
226 0.56
227 0.55
228 0.51
229 0.54
230 0.53
231 0.45
232 0.48
233 0.47
234 0.39
235 0.32
236 0.3
237 0.26
238 0.29
239 0.35
240 0.31
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.26
245 0.28
246 0.25
247 0.2
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.16
261 0.19
262 0.25
263 0.26
264 0.25
265 0.29
266 0.3
267 0.3
268 0.3
269 0.3
270 0.29
271 0.29
272 0.29
273 0.26
274 0.26
275 0.3
276 0.26
277 0.32
278 0.35
279 0.37
280 0.39
281 0.43
282 0.48
283 0.5
284 0.52
285 0.46
286 0.4
287 0.38
288 0.34
289 0.32
290 0.26
291 0.19
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.16
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.2
306 0.16
307 0.18
308 0.2
309 0.2
310 0.19
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.11
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.13
341 0.19
342 0.2
343 0.19
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.1
369 0.13
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.11
379 0.15
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.17
384 0.2
385 0.26
386 0.25
387 0.21
388 0.22
389 0.21
390 0.23
391 0.24
392 0.23
393 0.18
394 0.28
395 0.29
396 0.31
397 0.31
398 0.29
399 0.25
400 0.21
401 0.19
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.15
440 0.15
441 0.18
442 0.2
443 0.22
444 0.23
445 0.29
446 0.37
447 0.37
448 0.4
449 0.38
450 0.38
451 0.39
452 0.43
453 0.39
454 0.33
455 0.35
456 0.34
457 0.33
458 0.33
459 0.3
460 0.24
461 0.24
462 0.2
463 0.17
464 0.14
465 0.13
466 0.12
467 0.1
468 0.08
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.13
484 0.19
485 0.26
486 0.33
487 0.4
488 0.47
489 0.52
490 0.58
491 0.6
492 0.63
493 0.59
494 0.53
495 0.46
496 0.4
497 0.35
498 0.29
499 0.23
500 0.15
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.13
505 0.15
506 0.19
507 0.22
508 0.3
509 0.32
510 0.34
511 0.39
512 0.43
513 0.49
514 0.49
515 0.48
516 0.43
517 0.43
518 0.4
519 0.36
520 0.29
521 0.19
522 0.14
523 0.13
524 0.1
525 0.08
526 0.09
527 0.07
528 0.07
529 0.1
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.08
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.12
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.14
548 0.17
549 0.22
550 0.23
551 0.19
552 0.19
553 0.19
554 0.23
555 0.23
556 0.19
557 0.13
558 0.12
559 0.13
560 0.13
561 0.12
562 0.07
563 0.06
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.16
572 0.13
573 0.13
574 0.19
575 0.19
576 0.21
577 0.21
578 0.19
579 0.18
580 0.18
581 0.18
582 0.12
583 0.09
584 0.1
585 0.13
586 0.15
587 0.15
588 0.15
589 0.16
590 0.23
591 0.23
592 0.26
593 0.3
594 0.29
595 0.29
596 0.31
597 0.35
598 0.3
599 0.34
600 0.34
601 0.31
602 0.31
603 0.33
604 0.35
605 0.29
606 0.27
607 0.22
608 0.18
609 0.16
610 0.15
611 0.12
612 0.09
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.11
617 0.1
618 0.17
619 0.19
620 0.2
621 0.22
622 0.27
623 0.27
624 0.27
625 0.3
626 0.24
627 0.23
628 0.23
629 0.22
630 0.17
631 0.19
632 0.2
633 0.19
634 0.18
635 0.18
636 0.18
637 0.17
638 0.16
639 0.21
640 0.26
641 0.31
642 0.38
643 0.46
644 0.55
645 0.6
646 0.7
647 0.68
648 0.68
649 0.72
650 0.73
651 0.72
652 0.68
653 0.65
654 0.57
655 0.53
656 0.48
657 0.38
658 0.3
659 0.22
660 0.18
661 0.16
662 0.18
663 0.2
664 0.19
665 0.21
666 0.24
667 0.27
668 0.3
669 0.31
670 0.34
671 0.32
672 0.33
673 0.31
674 0.29
675 0.27
676 0.26
677 0.28
678 0.2
679 0.23
680 0.22
681 0.31
682 0.35
683 0.41
684 0.49
685 0.49
686 0.59
687 0.61
688 0.67
689 0.65
690 0.67
691 0.64