Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2TJR8

Protein Details
Accession M2TJR8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-45TIMTSKVQDKSKDKNKKPRGQYNDGLSTEHydrophilic
274-298IKCTIDCQFHKEQRRKARRVDDYYHHydrophilic
336-358ICEAKDCPIHKSKKPEPRKRATQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-355KSKKPEPRKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_155185  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MANTRKQRSRFDKDGDTIMTSKVQDKSKDKNKKPRGQYNDGLSTEERKKRYDSKACLRCGEVGHFRRDCPKNEVRQGAVKIGMIRIPTPYPTKKPDETLSDLDLYEEARQATDEAFELVQEAIGLQDFKWDAPLPTDWQIEGAEVLRRLRNQQCWICGTNAHQANDCDIDGRVTISGPRADKIAYRAAQEQPRFKEPDDEETPRTFKERMEQHERLCWVDCPRQCDYHLRKREETRDNEDDCCHTNLWHNECRVQHCHMHQPGEKEAHEELCWIKCTIDCQFHKEQRRKARRVDDYYHSTISAEECIAKNCRMHRAQFEDARQVGNHYYSILPANICEAKDCPIHKSKKPEPRKRATQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.63
3 0.57
4 0.48
5 0.41
6 0.37
7 0.29
8 0.31
9 0.31
10 0.34
11 0.39
12 0.45
13 0.54
14 0.61
15 0.71
16 0.75
17 0.8
18 0.86
19 0.87
20 0.91
21 0.91
22 0.9
23 0.88
24 0.85
25 0.83
26 0.8
27 0.71
28 0.64
29 0.54
30 0.52
31 0.52
32 0.52
33 0.45
34 0.39
35 0.45
36 0.5
37 0.6
38 0.63
39 0.64
40 0.68
41 0.74
42 0.76
43 0.73
44 0.66
45 0.59
46 0.51
47 0.48
48 0.47
49 0.43
50 0.47
51 0.45
52 0.45
53 0.51
54 0.54
55 0.51
56 0.5
57 0.54
58 0.55
59 0.62
60 0.65
61 0.59
62 0.61
63 0.58
64 0.53
65 0.45
66 0.37
67 0.3
68 0.26
69 0.24
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.17
75 0.23
76 0.27
77 0.31
78 0.37
79 0.43
80 0.43
81 0.47
82 0.49
83 0.49
84 0.49
85 0.47
86 0.43
87 0.37
88 0.34
89 0.3
90 0.25
91 0.19
92 0.13
93 0.11
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.04
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.18
136 0.22
137 0.27
138 0.33
139 0.35
140 0.37
141 0.39
142 0.4
143 0.36
144 0.32
145 0.29
146 0.29
147 0.3
148 0.27
149 0.25
150 0.24
151 0.24
152 0.24
153 0.21
154 0.14
155 0.1
156 0.09
157 0.07
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.18
171 0.17
172 0.18
173 0.21
174 0.26
175 0.31
176 0.34
177 0.37
178 0.34
179 0.37
180 0.37
181 0.34
182 0.38
183 0.33
184 0.38
185 0.38
186 0.39
187 0.37
188 0.37
189 0.38
190 0.3
191 0.32
192 0.24
193 0.19
194 0.23
195 0.27
196 0.31
197 0.4
198 0.43
199 0.42
200 0.46
201 0.47
202 0.41
203 0.36
204 0.31
205 0.27
206 0.3
207 0.3
208 0.3
209 0.32
210 0.33
211 0.33
212 0.41
213 0.44
214 0.48
215 0.55
216 0.56
217 0.59
218 0.64
219 0.72
220 0.7
221 0.68
222 0.66
223 0.65
224 0.61
225 0.57
226 0.52
227 0.44
228 0.38
229 0.34
230 0.26
231 0.19
232 0.23
233 0.28
234 0.32
235 0.35
236 0.34
237 0.36
238 0.39
239 0.44
240 0.41
241 0.39
242 0.38
243 0.37
244 0.45
245 0.44
246 0.48
247 0.46
248 0.46
249 0.48
250 0.47
251 0.44
252 0.38
253 0.35
254 0.3
255 0.27
256 0.24
257 0.21
258 0.18
259 0.2
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.18
264 0.22
265 0.3
266 0.29
267 0.34
268 0.43
269 0.51
270 0.6
271 0.66
272 0.69
273 0.71
274 0.8
275 0.8
276 0.8
277 0.83
278 0.83
279 0.82
280 0.8
281 0.77
282 0.74
283 0.72
284 0.63
285 0.53
286 0.43
287 0.35
288 0.3
289 0.23
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.17
294 0.2
295 0.22
296 0.25
297 0.27
298 0.36
299 0.38
300 0.43
301 0.48
302 0.52
303 0.58
304 0.61
305 0.62
306 0.61
307 0.57
308 0.54
309 0.46
310 0.41
311 0.35
312 0.29
313 0.25
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.15
320 0.14
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.21
327 0.27
328 0.28
329 0.3
330 0.37
331 0.45
332 0.5
333 0.59
334 0.65
335 0.7
336 0.8
337 0.84
338 0.85