Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SDB1

Protein Details
Accession M2SDB1    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-246ADIPQPRKRGRPSKKDRKAEEAQTRTTRKRNTRLANQDAEHydrophilic
282-308DGSLSEKHKQKKAKGRGGKKNGKGRGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-228PRKRGRPSKKDRKAEEA
288-308KHKQKKAKGRGGKKNGKGRGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.333, cyto 9.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_35361  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MDPQIDLPDLVEDLEVDIDELTTALEPLLSKPLSTTASSLPLLDKAKLYCLAAYAIESLLFASLTASGVNATEHAIFKEIARLRQYNSKIKEIEDRGIKGSAEGRARLDVAAAGRFIKHGLLGNDKYDLERQERMAKERARAHLKAQQINKKFDNEGKEVQKGQNVTPKKRGAEEKEEEDEEDEQVLEGLEEEPAVKKARVQDGTEADIPQPRKRGRPSKKDRKAEEAQTRTTRKRNTRLANQDAEENQEEEGQAEEEGEDDDEVADQAPKTRSETFTALLDGSLSEKHKQKKAKGRGGKKNGKGRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.04
12 0.05
13 0.06
14 0.07
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.18
24 0.23
25 0.23
26 0.23
27 0.2
28 0.23
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.19
33 0.22
34 0.24
35 0.23
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.15
40 0.15
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.18
66 0.2
67 0.23
68 0.27
69 0.28
70 0.29
71 0.38
72 0.44
73 0.44
74 0.46
75 0.48
76 0.45
77 0.45
78 0.51
79 0.46
80 0.46
81 0.42
82 0.39
83 0.35
84 0.35
85 0.32
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.2
91 0.18
92 0.18
93 0.19
94 0.17
95 0.15
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.17
118 0.18
119 0.24
120 0.26
121 0.28
122 0.34
123 0.34
124 0.37
125 0.41
126 0.46
127 0.45
128 0.44
129 0.44
130 0.42
131 0.45
132 0.45
133 0.46
134 0.48
135 0.46
136 0.5
137 0.48
138 0.45
139 0.41
140 0.38
141 0.37
142 0.32
143 0.33
144 0.31
145 0.32
146 0.32
147 0.31
148 0.3
149 0.26
150 0.25
151 0.26
152 0.28
153 0.3
154 0.35
155 0.38
156 0.37
157 0.4
158 0.44
159 0.43
160 0.47
161 0.47
162 0.44
163 0.44
164 0.43
165 0.38
166 0.33
167 0.27
168 0.18
169 0.15
170 0.1
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.05
181 0.07
182 0.09
183 0.08
184 0.1
185 0.15
186 0.23
187 0.26
188 0.27
189 0.31
190 0.33
191 0.37
192 0.36
193 0.32
194 0.25
195 0.26
196 0.27
197 0.24
198 0.29
199 0.28
200 0.34
201 0.43
202 0.53
203 0.59
204 0.68
205 0.76
206 0.8
207 0.87
208 0.9
209 0.86
210 0.83
211 0.81
212 0.8
213 0.79
214 0.73
215 0.7
216 0.69
217 0.7
218 0.68
219 0.68
220 0.67
221 0.65
222 0.69
223 0.72
224 0.73
225 0.77
226 0.8
227 0.8
228 0.77
229 0.69
230 0.64
231 0.55
232 0.51
233 0.42
234 0.32
235 0.25
236 0.19
237 0.18
238 0.14
239 0.14
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.12
256 0.14
257 0.16
258 0.2
259 0.24
260 0.27
261 0.3
262 0.34
263 0.31
264 0.3
265 0.3
266 0.26
267 0.21
268 0.19
269 0.14
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.19
274 0.26
275 0.34
276 0.41
277 0.5
278 0.58
279 0.66
280 0.74
281 0.8
282 0.83
283 0.86
284 0.9
285 0.93
286 0.93
287 0.92
288 0.91