Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SZW6

Protein Details
Accession M2SZW6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47KDEPSTKKPRFDPRNPSTLAHydrophilic
302-323KAVPKKATNNWAKKKKKAQSMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-267KDMKKAKEAQDKRDAERKAK
306-318KKATNNWAKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG bsc:COCSADRAFT_82186  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MASSSGTYNPARPKRAGEQFTRTHHLDKDEPSTKKPRFDPRNPSTLAPDADDDEEDPALEADVIGKGSGIKRNAVNIDGYDSDSSTENFDIRAEANHKKEKPAKDDDDDDDMFADEPKEDEQDEELGQDQGKKKKLRFLDNAEIEGQEESSKSGGHVAVDFTKGGKATADEVESSSDEGDDEERDRLDSDMDEELGAGSKKKHAPKLDAFNMRAEQEEGRFDEAGNYVRKAFDPDAVQDSWLEGISKKDMKKAKEAQDKRDAERKAKERAEDAIVTSDVLSTLISHLEVGETPMEALVRYGKAVPKKATNNWAKKKKKAQSMEVDTDPSEEAAAAKAKQVIDSITECASRLSDRGVEDIYELPRESIMRQYKRETGEDWKNLNAEPVQWEFHWLNAPEGDINGPYDQATMQAWEANGQFAAGAEFRRVGESEWSRLLDFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.65
3 0.66
4 0.63
5 0.64
6 0.67
7 0.71
8 0.71
9 0.64
10 0.58
11 0.55
12 0.53
13 0.5
14 0.47
15 0.5
16 0.52
17 0.53
18 0.55
19 0.62
20 0.6
21 0.63
22 0.66
23 0.67
24 0.69
25 0.75
26 0.8
27 0.76
28 0.81
29 0.75
30 0.69
31 0.64
32 0.59
33 0.51
34 0.42
35 0.36
36 0.29
37 0.28
38 0.26
39 0.21
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.11
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.22
59 0.28
60 0.3
61 0.29
62 0.27
63 0.22
64 0.25
65 0.22
66 0.22
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.15
80 0.18
81 0.24
82 0.31
83 0.39
84 0.41
85 0.48
86 0.55
87 0.58
88 0.6
89 0.63
90 0.63
91 0.59
92 0.63
93 0.58
94 0.56
95 0.49
96 0.41
97 0.32
98 0.26
99 0.21
100 0.16
101 0.13
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.15
116 0.19
117 0.24
118 0.31
119 0.36
120 0.38
121 0.44
122 0.51
123 0.56
124 0.59
125 0.62
126 0.64
127 0.61
128 0.61
129 0.54
130 0.47
131 0.38
132 0.3
133 0.21
134 0.11
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.11
187 0.16
188 0.21
189 0.27
190 0.29
191 0.36
192 0.42
193 0.51
194 0.54
195 0.55
196 0.52
197 0.48
198 0.46
199 0.39
200 0.33
201 0.25
202 0.17
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.14
226 0.14
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.05
231 0.07
232 0.1
233 0.15
234 0.15
235 0.21
236 0.26
237 0.28
238 0.37
239 0.44
240 0.5
241 0.57
242 0.61
243 0.62
244 0.68
245 0.69
246 0.64
247 0.63
248 0.55
249 0.5
250 0.54
251 0.52
252 0.5
253 0.5
254 0.48
255 0.42
256 0.43
257 0.41
258 0.33
259 0.29
260 0.22
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.11
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.13
289 0.18
290 0.24
291 0.27
292 0.33
293 0.39
294 0.44
295 0.52
296 0.58
297 0.64
298 0.69
299 0.76
300 0.76
301 0.79
302 0.84
303 0.82
304 0.82
305 0.79
306 0.78
307 0.78
308 0.8
309 0.76
310 0.68
311 0.61
312 0.51
313 0.44
314 0.35
315 0.24
316 0.15
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.15
353 0.21
354 0.29
355 0.34
356 0.39
357 0.44
358 0.49
359 0.53
360 0.54
361 0.49
362 0.48
363 0.52
364 0.55
365 0.52
366 0.49
367 0.46
368 0.43
369 0.43
370 0.34
371 0.26
372 0.23
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.26
377 0.23
378 0.24
379 0.29
380 0.25
381 0.25
382 0.23
383 0.24
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.13
388 0.14
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.11
406 0.09
407 0.11
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.13
413 0.15
414 0.16
415 0.16
416 0.24
417 0.28
418 0.31
419 0.34
420 0.36
421 0.34