Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2S990

Protein Details
Accession M2S990    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-301GHESRSRSRSRSRSYDNRDRGRSRSBasic
305-332GEQSIRSRSRRSTRSRSSSRNQRHSNDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-321SRSRSRGHESRSRSRSRSRSYDNRDRGRSRSRSPGEQSIRSRSRRSTRSRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG bsc:COCSADRAFT_332996  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPQFDRADASALLDDRGYRGALIRGQNPALLFEKGVRERITESYYWKEQCFGLNAATLCDRAAELKFIGGTTGITGKPTPFLCLAFKMLQLVPDKEIVLEYLNFRDDEDDEDDKDDKAEVKRENGDTAADDDDDSAKKELDLNAAGKLGCFKYLRCLAAFYIRLAWEPVEIYKTLEPLLTDYRKIKRRLKDTFTLTHVDQFIDDLLTKDRICATSLWKLPSRAILEDLDMLDPRESPLGDEVDELDEDMDRRSVGSEESYRSRSYDSRSRSRSRGHESRSRSRSRSRSYDNRDRGRSRSRSPGEQSIRSRSRRSTRSRSSSRNQRHSNDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.17
4 0.14
5 0.15
6 0.13
7 0.1
8 0.12
9 0.15
10 0.2
11 0.25
12 0.27
13 0.3
14 0.3
15 0.32
16 0.3
17 0.3
18 0.27
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.26
23 0.27
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.3
28 0.33
29 0.35
30 0.29
31 0.31
32 0.33
33 0.39
34 0.4
35 0.38
36 0.35
37 0.32
38 0.33
39 0.32
40 0.27
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.22
46 0.19
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.15
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.23
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.16
85 0.16
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.19
101 0.2
102 0.18
103 0.18
104 0.15
105 0.13
106 0.14
107 0.2
108 0.2
109 0.23
110 0.27
111 0.28
112 0.29
113 0.25
114 0.24
115 0.18
116 0.18
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.13
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.15
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.2
146 0.18
147 0.23
148 0.24
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.15
168 0.14
169 0.16
170 0.2
171 0.27
172 0.34
173 0.41
174 0.47
175 0.49
176 0.57
177 0.64
178 0.65
179 0.66
180 0.65
181 0.62
182 0.57
183 0.53
184 0.44
185 0.39
186 0.33
187 0.25
188 0.19
189 0.15
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.22
204 0.26
205 0.29
206 0.3
207 0.31
208 0.31
209 0.35
210 0.33
211 0.26
212 0.25
213 0.21
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.15
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.13
245 0.15
246 0.19
247 0.24
248 0.27
249 0.26
250 0.27
251 0.29
252 0.28
253 0.32
254 0.36
255 0.39
256 0.47
257 0.54
258 0.6
259 0.63
260 0.67
261 0.69
262 0.71
263 0.72
264 0.7
265 0.71
266 0.73
267 0.77
268 0.78
269 0.78
270 0.74
271 0.74
272 0.77
273 0.77
274 0.78
275 0.77
276 0.79
277 0.8
278 0.85
279 0.86
280 0.85
281 0.86
282 0.81
283 0.79
284 0.78
285 0.76
286 0.71
287 0.72
288 0.69
289 0.69
290 0.71
291 0.74
292 0.71
293 0.72
294 0.72
295 0.72
296 0.74
297 0.71
298 0.7
299 0.69
300 0.71
301 0.72
302 0.76
303 0.76
304 0.78
305 0.83
306 0.87
307 0.87
308 0.88
309 0.89
310 0.9
311 0.9
312 0.88