Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SUH0

Protein Details
Accession M2SUH0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-47DEAVAVSKKERREKKDKKEKKEKKRSKSESKNEVAEABasic
54-75ASVKAETPAKKRKRDILPDELEHydrophilic
81-104PEPVSKKAARKAKKAKLNPTPAAEHydrophilic
334-353EDAKPEKKRKWFVSKFMGREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-39KKERREKKDKKEKKEKKRSKSE
86-96KKAARKAKKAK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_40088  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKDIDMTSSDEAVAVSKKERREKKDKKEKKEKKRSKSESKNEVAEASASEEEASVKAETPAKKRKRDILPDELEIDVNLPEPVSKKAARKAKKAKLNPTPAAEGEGGDTGAKTDGEAKGSKDADGKRSAYGVWIGNLPWSATKDSLRTFLSENSEIASDQITRVHMPPPTKVNPSWTTKPLNKGFAYVDFSTELAMYSAIALTETKMDGRALLIKNAKSFEGRPDKPKTEEGQDSRRAGNTDKSGHPPNKRVFIGNLSFDVTKEDLQEHYAQCGDIEDIHMATFEDSGKCKGYAWITFADVESATWAVKGFVFKDAAEFKKKGKKDDSDDDDEDAKPEKKRKWFVSKFMGRELRCEFAEDATTRYNKRWGKDRPVKAVDGVNPDRWRNFDQGGDGKAGRGNNERGNGSKRKVDPRTIKSGAAHSSAPRASQAIVESQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.18
4 0.22
5 0.3
6 0.4
7 0.49
8 0.57
9 0.66
10 0.75
11 0.81
12 0.88
13 0.9
14 0.92
15 0.94
16 0.95
17 0.95
18 0.96
19 0.95
20 0.95
21 0.96
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.94
26 0.93
27 0.9
28 0.84
29 0.74
30 0.64
31 0.54
32 0.43
33 0.33
34 0.26
35 0.19
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.12
45 0.18
46 0.24
47 0.32
48 0.42
49 0.49
50 0.58
51 0.64
52 0.71
53 0.75
54 0.81
55 0.8
56 0.8
57 0.77
58 0.7
59 0.66
60 0.57
61 0.46
62 0.35
63 0.28
64 0.17
65 0.12
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.09
70 0.11
71 0.16
72 0.2
73 0.25
74 0.34
75 0.44
76 0.5
77 0.6
78 0.68
79 0.72
80 0.78
81 0.82
82 0.84
83 0.84
84 0.86
85 0.8
86 0.74
87 0.68
88 0.58
89 0.53
90 0.42
91 0.32
92 0.23
93 0.18
94 0.14
95 0.1
96 0.1
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.09
102 0.1
103 0.13
104 0.15
105 0.16
106 0.21
107 0.22
108 0.23
109 0.25
110 0.27
111 0.29
112 0.33
113 0.33
114 0.28
115 0.28
116 0.27
117 0.22
118 0.23
119 0.19
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.15
131 0.17
132 0.18
133 0.22
134 0.21
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.26
139 0.24
140 0.22
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.16
145 0.13
146 0.08
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.2
156 0.25
157 0.28
158 0.31
159 0.31
160 0.35
161 0.37
162 0.43
163 0.44
164 0.42
165 0.44
166 0.44
167 0.52
168 0.49
169 0.49
170 0.42
171 0.4
172 0.37
173 0.33
174 0.35
175 0.26
176 0.23
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.14
181 0.11
182 0.06
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.12
199 0.12
200 0.16
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.17
207 0.18
208 0.22
209 0.28
210 0.29
211 0.34
212 0.4
213 0.42
214 0.43
215 0.47
216 0.41
217 0.37
218 0.42
219 0.4
220 0.41
221 0.44
222 0.43
223 0.39
224 0.38
225 0.34
226 0.29
227 0.29
228 0.26
229 0.25
230 0.25
231 0.29
232 0.35
233 0.4
234 0.43
235 0.45
236 0.45
237 0.47
238 0.45
239 0.42
240 0.37
241 0.37
242 0.35
243 0.29
244 0.26
245 0.21
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.12
255 0.16
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.13
262 0.11
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.16
303 0.21
304 0.24
305 0.29
306 0.3
307 0.33
308 0.4
309 0.43
310 0.47
311 0.5
312 0.54
313 0.56
314 0.65
315 0.67
316 0.66
317 0.65
318 0.6
319 0.53
320 0.45
321 0.38
322 0.32
323 0.28
324 0.25
325 0.31
326 0.35
327 0.42
328 0.51
329 0.6
330 0.67
331 0.71
332 0.75
333 0.79
334 0.8
335 0.75
336 0.75
337 0.74
338 0.62
339 0.6
340 0.55
341 0.48
342 0.39
343 0.39
344 0.3
345 0.24
346 0.29
347 0.24
348 0.23
349 0.25
350 0.28
351 0.26
352 0.28
353 0.36
354 0.35
355 0.39
356 0.46
357 0.5
358 0.58
359 0.67
360 0.73
361 0.75
362 0.75
363 0.73
364 0.66
365 0.62
366 0.56
367 0.55
368 0.5
369 0.47
370 0.46
371 0.47
372 0.45
373 0.44
374 0.42
375 0.38
376 0.37
377 0.31
378 0.34
379 0.37
380 0.37
381 0.37
382 0.33
383 0.3
384 0.3
385 0.29
386 0.26
387 0.27
388 0.31
389 0.32
390 0.37
391 0.38
392 0.4
393 0.47
394 0.51
395 0.48
396 0.51
397 0.53
398 0.59
399 0.63
400 0.69
401 0.72
402 0.71
403 0.77
404 0.72
405 0.69
406 0.61
407 0.61
408 0.55
409 0.47
410 0.43
411 0.35
412 0.38
413 0.35
414 0.33
415 0.28
416 0.25
417 0.22
418 0.22
419 0.22
420 0.2
421 0.24
422 0.29
423 0.31
424 0.33
425 0.38