Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SWA9

Protein Details
Accession M2SWA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
608-635PTGSKNEEPKGKKQKKGDKSESVPRGNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-82AKQKALAKERKAAKPNADIIERSKKLWEKLR
593-627KALKKEKKALEAAANPTGSKNEEPKGKKQKKGDKS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_96385  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MSDAESNEEAEETNGKTQKPKNESDGSKKPKGDGVESKLAGLNVNNSREAHAKQKALAKERKAAKPNADIIERSKKLWEKLRLKSHVDKDERKELVKELFDIITGRVKDFVFKHDSVRVIQTAIKYSTMEQRRMIARELKGEFKVLAEGKYSKFLIAKLVEKGDPEIRDLIITEFYSHVKRMINHPEAAWIVDDIYRAVATPEQKNRLLREWYGPEFSIKGLGAQGTDSAELSAIIKESPEKKKPIMDYLENQINSLIQKKLTGFTMLHDAMLQYFLVCEPGTEQANDFLEHLKPDPTLKEGEEADNVDLLKNLAFTKSGSRLMSLCFAYGTAKDRKLFLRPYKDTVEIMAYDQHAHHVLLAALAVTDDTKISAKSVFSELLPNNDSLPEKVLNLVNDARARTVLLYPFAADAKWLLDDNTRDRLAEIYAIRQTTSKKDPNVRLQEIAKNIEPQLLTAVTARAADFASFAFGLQFMGEVLVGAPEVEPAKRKEALTEVARLSQSILDSSLPASAGDNKATSHGKNMLKMLVQGGKFDTVAKKVVPVEPALGFADLLWPQIKDKIVDWATGQGSFVVVSMTEAEGFAKKDEVLKALKKEKKALEAAANPTGSKNEEPKGKKQKKGDKSESVPRGNAGTRILLEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.32
4 0.38
5 0.47
6 0.51
7 0.56
8 0.57
9 0.63
10 0.7
11 0.72
12 0.77
13 0.75
14 0.76
15 0.72
16 0.66
17 0.61
18 0.57
19 0.56
20 0.54
21 0.53
22 0.55
23 0.53
24 0.52
25 0.49
26 0.45
27 0.37
28 0.29
29 0.29
30 0.26
31 0.28
32 0.29
33 0.28
34 0.3
35 0.34
36 0.35
37 0.36
38 0.37
39 0.37
40 0.4
41 0.47
42 0.51
43 0.57
44 0.62
45 0.59
46 0.6
47 0.67
48 0.71
49 0.71
50 0.7
51 0.68
52 0.68
53 0.7
54 0.67
55 0.61
56 0.54
57 0.53
58 0.57
59 0.51
60 0.44
61 0.44
62 0.44
63 0.47
64 0.55
65 0.59
66 0.58
67 0.66
68 0.75
69 0.75
70 0.77
71 0.79
72 0.79
73 0.78
74 0.77
75 0.76
76 0.72
77 0.75
78 0.71
79 0.64
80 0.57
81 0.52
82 0.49
83 0.43
84 0.37
85 0.3
86 0.27
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.18
95 0.23
96 0.24
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.33
101 0.34
102 0.37
103 0.34
104 0.36
105 0.31
106 0.26
107 0.27
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.2
113 0.21
114 0.29
115 0.32
116 0.34
117 0.3
118 0.34
119 0.38
120 0.4
121 0.42
122 0.41
123 0.37
124 0.41
125 0.43
126 0.42
127 0.37
128 0.36
129 0.32
130 0.25
131 0.28
132 0.22
133 0.2
134 0.19
135 0.21
136 0.21
137 0.25
138 0.25
139 0.21
140 0.21
141 0.2
142 0.23
143 0.23
144 0.26
145 0.25
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.28
150 0.27
151 0.24
152 0.23
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.25
169 0.34
170 0.36
171 0.36
172 0.35
173 0.36
174 0.33
175 0.32
176 0.25
177 0.15
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.12
188 0.19
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.37
193 0.4
194 0.43
195 0.43
196 0.38
197 0.39
198 0.4
199 0.39
200 0.38
201 0.35
202 0.3
203 0.26
204 0.24
205 0.19
206 0.13
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.09
225 0.16
226 0.23
227 0.27
228 0.31
229 0.33
230 0.38
231 0.4
232 0.44
233 0.43
234 0.4
235 0.38
236 0.4
237 0.45
238 0.39
239 0.37
240 0.29
241 0.24
242 0.21
243 0.21
244 0.16
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.12
252 0.12
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.15
257 0.14
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.09
305 0.12
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.19
312 0.16
313 0.13
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.13
319 0.14
320 0.17
321 0.17
322 0.2
323 0.21
324 0.25
325 0.32
326 0.35
327 0.41
328 0.41
329 0.45
330 0.46
331 0.47
332 0.41
333 0.34
334 0.29
335 0.19
336 0.17
337 0.14
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.16
367 0.16
368 0.18
369 0.19
370 0.18
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.12
375 0.15
376 0.12
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.17
386 0.16
387 0.14
388 0.14
389 0.12
390 0.13
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.1
405 0.13
406 0.16
407 0.21
408 0.21
409 0.2
410 0.2
411 0.2
412 0.17
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.17
417 0.17
418 0.17
419 0.18
420 0.2
421 0.21
422 0.29
423 0.31
424 0.35
425 0.44
426 0.51
427 0.59
428 0.66
429 0.63
430 0.59
431 0.57
432 0.56
433 0.51
434 0.47
435 0.38
436 0.31
437 0.29
438 0.28
439 0.24
440 0.19
441 0.18
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.04
470 0.03
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.1
475 0.13
476 0.17
477 0.21
478 0.21
479 0.22
480 0.26
481 0.32
482 0.32
483 0.35
484 0.32
485 0.32
486 0.32
487 0.3
488 0.26
489 0.21
490 0.18
491 0.13
492 0.13
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.09
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.19
506 0.22
507 0.21
508 0.21
509 0.28
510 0.3
511 0.32
512 0.34
513 0.33
514 0.31
515 0.32
516 0.31
517 0.29
518 0.26
519 0.24
520 0.23
521 0.22
522 0.21
523 0.23
524 0.22
525 0.18
526 0.2
527 0.19
528 0.21
529 0.23
530 0.26
531 0.25
532 0.23
533 0.24
534 0.22
535 0.24
536 0.21
537 0.18
538 0.14
539 0.12
540 0.15
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.11
545 0.12
546 0.17
547 0.18
548 0.16
549 0.17
550 0.25
551 0.26
552 0.27
553 0.26
554 0.29
555 0.28
556 0.27
557 0.26
558 0.16
559 0.15
560 0.14
561 0.13
562 0.07
563 0.05
564 0.06
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.1
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.12
575 0.17
576 0.18
577 0.22
578 0.27
579 0.32
580 0.4
581 0.49
582 0.55
583 0.55
584 0.62
585 0.63
586 0.64
587 0.63
588 0.6
589 0.58
590 0.59
591 0.6
592 0.57
593 0.52
594 0.44
595 0.4
596 0.37
597 0.31
598 0.29
599 0.29
600 0.3
601 0.38
602 0.44
603 0.54
604 0.63
605 0.69
606 0.73
607 0.78
608 0.82
609 0.83
610 0.88
611 0.88
612 0.87
613 0.85
614 0.88
615 0.87
616 0.82
617 0.73
618 0.63
619 0.59
620 0.51
621 0.46
622 0.37
623 0.31
624 0.27