Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SDT3

Protein Details
Accession M2SDT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-251RSQLFKRPPRFQQKRPRDLATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039113  ATG29  
IPR040666  Atg29_N  
IPR039362  ATG29_sf  
Gene Ontology GO:0000407  C:phagophore assembly site  
GO:0000045  P:autophagosome assembly  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG bsc:COCSADRAFT_35504  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18388  ATG29_N  
Amino Acid Sequences MSSVQFTALIRLPFIRGDFEDPPQAQWDAEKDRQLWKVISKSSKTSDLNWVELADKFQVPPTFLLQQAAWLYERHLDHVRNQMKKVSITNAAPSSPTVGSTMTAVGGVAMRRGGSAGSGAGKTPSALSGRSRESPSLRNAEVATPAPSLSRTPSTTTITQSRAHAQAPARTLSTRSTQRPNLTSRKSEERAQASNLPHPSYRNDEDVSPEIPESSSSSSSSLSDADHPVHRSQLFKRPPRFQQKRPRDLATFDEGDVAQEFDESGSHETSLPFASAARTQPSSSKFAQDAQFRGSTKAEQKAVLPHRSRTDPPSRQKSIDVQSLTTETASSMTSSGGPPSAAKSPMSPPLGHRAALGRLGSPRSGGPRSRKEGSEGTPSMGSSFSDIDDAGISQSALEEALLSNMQHGRMSTLSRMSKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.2
4 0.26
5 0.28
6 0.3
7 0.36
8 0.34
9 0.35
10 0.34
11 0.32
12 0.26
13 0.25
14 0.29
15 0.29
16 0.33
17 0.36
18 0.36
19 0.42
20 0.46
21 0.48
22 0.45
23 0.44
24 0.46
25 0.49
26 0.55
27 0.52
28 0.55
29 0.55
30 0.61
31 0.56
32 0.52
33 0.54
34 0.5
35 0.48
36 0.42
37 0.39
38 0.31
39 0.3
40 0.28
41 0.21
42 0.18
43 0.16
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.26
52 0.21
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.19
57 0.16
58 0.16
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.25
63 0.25
64 0.29
65 0.4
66 0.46
67 0.45
68 0.47
69 0.48
70 0.46
71 0.47
72 0.46
73 0.4
74 0.39
75 0.35
76 0.39
77 0.36
78 0.32
79 0.3
80 0.27
81 0.25
82 0.19
83 0.18
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.13
115 0.18
116 0.22
117 0.26
118 0.28
119 0.29
120 0.32
121 0.35
122 0.38
123 0.38
124 0.35
125 0.33
126 0.31
127 0.29
128 0.27
129 0.23
130 0.2
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.14
139 0.18
140 0.21
141 0.25
142 0.26
143 0.29
144 0.31
145 0.31
146 0.31
147 0.3
148 0.3
149 0.28
150 0.26
151 0.27
152 0.24
153 0.25
154 0.26
155 0.25
156 0.22
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.24
161 0.26
162 0.28
163 0.33
164 0.37
165 0.41
166 0.45
167 0.49
168 0.52
169 0.5
170 0.5
171 0.47
172 0.51
173 0.5
174 0.5
175 0.49
176 0.45
177 0.43
178 0.42
179 0.43
180 0.36
181 0.39
182 0.35
183 0.31
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.25
189 0.23
190 0.22
191 0.21
192 0.23
193 0.24
194 0.22
195 0.17
196 0.14
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.21
220 0.29
221 0.36
222 0.42
223 0.49
224 0.53
225 0.61
226 0.7
227 0.74
228 0.75
229 0.77
230 0.8
231 0.82
232 0.81
233 0.76
234 0.67
235 0.62
236 0.56
237 0.5
238 0.4
239 0.31
240 0.26
241 0.21
242 0.19
243 0.17
244 0.13
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.2
268 0.23
269 0.27
270 0.25
271 0.28
272 0.26
273 0.29
274 0.35
275 0.34
276 0.33
277 0.32
278 0.35
279 0.32
280 0.33
281 0.29
282 0.28
283 0.3
284 0.34
285 0.32
286 0.29
287 0.29
288 0.36
289 0.42
290 0.47
291 0.44
292 0.42
293 0.45
294 0.49
295 0.51
296 0.49
297 0.53
298 0.53
299 0.6
300 0.66
301 0.66
302 0.63
303 0.64
304 0.64
305 0.59
306 0.57
307 0.49
308 0.4
309 0.37
310 0.36
311 0.33
312 0.25
313 0.19
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.16
328 0.16
329 0.17
330 0.19
331 0.22
332 0.29
333 0.32
334 0.3
335 0.28
336 0.36
337 0.38
338 0.35
339 0.33
340 0.28
341 0.28
342 0.31
343 0.28
344 0.21
345 0.23
346 0.25
347 0.24
348 0.22
349 0.23
350 0.25
351 0.3
352 0.35
353 0.41
354 0.48
355 0.55
356 0.59
357 0.58
358 0.57
359 0.59
360 0.56
361 0.56
362 0.48
363 0.44
364 0.4
365 0.38
366 0.33
367 0.26
368 0.22
369 0.14
370 0.14
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.17
396 0.19
397 0.23
398 0.23
399 0.3