Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2S867

Protein Details
Accession M2S867    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-511LPPVENPEPKQSKKQRKKNKQVSKKAEQTRFQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-503PKQSKKQRKKNKQVSKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG bsc:COCSADRAFT_143653  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MDVDAATFPHHLLWILINIAEADFVSFDLELSGIPSRIQDKPPRGPGRFTMEERYAETKMGADRYQILQVGITCARFDYIANKYVLRPYNIDISPLLDERIDFEREIRFQSGACTFLLKNGFDLGLPFANGVQYLSRQEADKAKQMACDRLEKKNPVPDLQLKEGDVESLDFMRRVREAINKWKTTTSSGLDITTHTGLPERPKIPVITRFEKRLVHQLVRAEFPDLVTMGRSECVRIIQLDPVREAENMQRMKNRVDESILRQTGFRWIFEALVKGGNLSRTDLLYVARTTGMAPTADTDDTRTRFDKAMERLKTKQPVLVGHNMFTDIVYLYRTFVGELPDTLNDFQDAIHELFPKIIDTKYLATFAEGDLNASPTLQDIAQGLSSQPLPDIITHADHPKYQDIEAFHEAGYDSLLTATIMIKLAARLGVERGEKTLPPLFQNSANGADNQSNPTTNQNVPDFVKDGREKVQKPVPLPPVENPEPKQSKKQRKKNKQVSKKAEQTRFQTKNVFDALSEMSLNPETAPLSTDDEEAEPIETKEDHQNGKWEEQTSQSPGSWENAAPVQNTTSLTPLEQVERQPMELMPHFNSKFWAEFGNTLRVFGTEEAVWKIATWES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.13
23 0.16
24 0.21
25 0.29
26 0.36
27 0.43
28 0.52
29 0.63
30 0.7
31 0.69
32 0.69
33 0.68
34 0.68
35 0.66
36 0.61
37 0.57
38 0.52
39 0.51
40 0.5
41 0.49
42 0.41
43 0.34
44 0.31
45 0.26
46 0.25
47 0.27
48 0.24
49 0.21
50 0.23
51 0.25
52 0.28
53 0.26
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.18
67 0.23
68 0.25
69 0.26
70 0.27
71 0.34
72 0.38
73 0.35
74 0.33
75 0.3
76 0.37
77 0.36
78 0.36
79 0.29
80 0.27
81 0.27
82 0.25
83 0.23
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.22
93 0.26
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.24
98 0.23
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.2
104 0.24
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.18
126 0.24
127 0.27
128 0.32
129 0.34
130 0.33
131 0.38
132 0.4
133 0.43
134 0.38
135 0.44
136 0.41
137 0.46
138 0.53
139 0.52
140 0.55
141 0.56
142 0.56
143 0.49
144 0.52
145 0.5
146 0.49
147 0.49
148 0.45
149 0.38
150 0.37
151 0.34
152 0.27
153 0.2
154 0.14
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.2
165 0.26
166 0.36
167 0.45
168 0.46
169 0.47
170 0.49
171 0.47
172 0.43
173 0.42
174 0.33
175 0.28
176 0.27
177 0.26
178 0.23
179 0.22
180 0.21
181 0.18
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.17
187 0.23
188 0.21
189 0.22
190 0.24
191 0.26
192 0.29
193 0.35
194 0.38
195 0.38
196 0.41
197 0.43
198 0.45
199 0.46
200 0.43
201 0.45
202 0.43
203 0.38
204 0.38
205 0.39
206 0.37
207 0.36
208 0.35
209 0.26
210 0.21
211 0.18
212 0.16
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.15
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.18
234 0.16
235 0.21
236 0.22
237 0.23
238 0.26
239 0.26
240 0.28
241 0.32
242 0.3
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.28
247 0.36
248 0.35
249 0.3
250 0.28
251 0.27
252 0.32
253 0.3
254 0.24
255 0.16
256 0.15
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.13
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.24
296 0.27
297 0.34
298 0.36
299 0.4
300 0.42
301 0.47
302 0.5
303 0.44
304 0.39
305 0.32
306 0.33
307 0.32
308 0.36
309 0.31
310 0.26
311 0.26
312 0.24
313 0.22
314 0.17
315 0.14
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.18
388 0.2
389 0.2
390 0.19
391 0.21
392 0.18
393 0.23
394 0.24
395 0.23
396 0.19
397 0.18
398 0.18
399 0.14
400 0.13
401 0.07
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.16
423 0.16
424 0.2
425 0.23
426 0.2
427 0.21
428 0.24
429 0.23
430 0.24
431 0.26
432 0.24
433 0.24
434 0.23
435 0.22
436 0.2
437 0.21
438 0.2
439 0.2
440 0.19
441 0.16
442 0.16
443 0.2
444 0.22
445 0.21
446 0.25
447 0.23
448 0.26
449 0.26
450 0.28
451 0.26
452 0.22
453 0.28
454 0.25
455 0.26
456 0.31
457 0.38
458 0.37
459 0.43
460 0.48
461 0.45
462 0.46
463 0.52
464 0.52
465 0.48
466 0.49
467 0.46
468 0.48
469 0.5
470 0.53
471 0.47
472 0.5
473 0.53
474 0.53
475 0.6
476 0.61
477 0.67
478 0.72
479 0.81
480 0.82
481 0.86
482 0.94
483 0.95
484 0.96
485 0.95
486 0.95
487 0.94
488 0.93
489 0.92
490 0.9
491 0.88
492 0.83
493 0.8
494 0.79
495 0.75
496 0.68
497 0.65
498 0.56
499 0.53
500 0.49
501 0.42
502 0.31
503 0.28
504 0.26
505 0.21
506 0.2
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.15
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.17
523 0.16
524 0.15
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.21
531 0.26
532 0.28
533 0.3
534 0.38
535 0.4
536 0.45
537 0.46
538 0.4
539 0.36
540 0.37
541 0.4
542 0.36
543 0.35
544 0.31
545 0.28
546 0.27
547 0.28
548 0.26
549 0.22
550 0.2
551 0.21
552 0.22
553 0.21
554 0.21
555 0.2
556 0.2
557 0.21
558 0.19
559 0.18
560 0.17
561 0.16
562 0.17
563 0.18
564 0.2
565 0.21
566 0.22
567 0.28
568 0.29
569 0.29
570 0.28
571 0.28
572 0.3
573 0.3
574 0.33
575 0.28
576 0.36
577 0.36
578 0.35
579 0.37
580 0.34
581 0.32
582 0.29
583 0.29
584 0.22
585 0.27
586 0.31
587 0.38
588 0.35
589 0.33
590 0.32
591 0.29
592 0.29
593 0.23
594 0.23
595 0.14
596 0.17
597 0.19
598 0.19
599 0.19
600 0.16