Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SN89

Protein Details
Accession M2SN89    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-57PTPTPRSSTRKQVGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATARKGSTVHydrophilic
173-195TPSTAVKKGRGRPKKTPQKELIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-50RQRKAPKAT
179-188KKGRGRPKKT
310-317AKRKAREE
320-341AAQQAAKREREEKKAKKLAKQA
392-427PERRGKTEEEKRKEKLNQHIKFLERTDKPAKDIKKG
457-484LKGRQVEKRMVGKKGGVVRVGRMERRPH
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bsc:COCSADRAFT_92012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVTTRGGTETPGAPTPTPRSSTRKQVGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATARKGSTVESKGQEESADEPSQESSNDTSDTIAANARELEVPETPKQSGLPARRKSSPQVVVGAGASDQSSNTVEKEDEVPSTVQNPAFYTPTQAPGSVYATPATHKRPEGSPTPKAKILNDQTPSTAVKKGRGRPKKTPQKELIEETDEVPSSTYESEMAPIPSQDAAPPSAQPEKAHMRFGSEEPVPTPASPVMNKQGSKRYEAAEPVIKPSQADEDDASDSDDEAPEVITIAAASSKALAARAEADRAQKAQQAKEDAKRKAREEFLAAQQAAKREREEKKAKKLAKQAAKEAEAAATDAPSAEQESDSEHPTQIDTSNGLLPASLLATIDDQRPPTPPPERRGKTEEEKRKEKLNQHIKFLERTDKPAKDIKKGKLNVAVLAQQNKVMPPKVNRDSKNVREHWLKGRQVEKRMVGKKGGVVRVGRMERRPHGNRGFLRDGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.46
7 0.49
8 0.59
9 0.63
10 0.66
11 0.69
12 0.75
13 0.8
14 0.81
15 0.78
16 0.75
17 0.67
18 0.62
19 0.56
20 0.52
21 0.46
22 0.39
23 0.37
24 0.33
25 0.4
26 0.44
27 0.51
28 0.52
29 0.58
30 0.67
31 0.75
32 0.83
33 0.85
34 0.87
35 0.89
36 0.9
37 0.9
38 0.84
39 0.79
40 0.71
41 0.66
42 0.63
43 0.56
44 0.54
45 0.48
46 0.46
47 0.42
48 0.39
49 0.34
50 0.27
51 0.26
52 0.24
53 0.22
54 0.19
55 0.18
56 0.19
57 0.2
58 0.18
59 0.17
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.19
78 0.21
79 0.24
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.25
84 0.3
85 0.35
86 0.42
87 0.47
88 0.52
89 0.56
90 0.6
91 0.61
92 0.63
93 0.59
94 0.52
95 0.48
96 0.44
97 0.39
98 0.35
99 0.29
100 0.19
101 0.13
102 0.1
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.17
125 0.16
126 0.19
127 0.17
128 0.22
129 0.22
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.22
134 0.19
135 0.18
136 0.14
137 0.13
138 0.15
139 0.18
140 0.2
141 0.21
142 0.22
143 0.24
144 0.26
145 0.3
146 0.38
147 0.41
148 0.45
149 0.48
150 0.51
151 0.52
152 0.51
153 0.48
154 0.48
155 0.47
156 0.45
157 0.42
158 0.39
159 0.36
160 0.36
161 0.37
162 0.29
163 0.28
164 0.22
165 0.26
166 0.33
167 0.4
168 0.48
169 0.56
170 0.62
171 0.67
172 0.77
173 0.81
174 0.81
175 0.83
176 0.8
177 0.79
178 0.76
179 0.7
180 0.63
181 0.55
182 0.48
183 0.4
184 0.33
185 0.24
186 0.2
187 0.15
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.19
212 0.26
213 0.27
214 0.3
215 0.27
216 0.26
217 0.28
218 0.28
219 0.27
220 0.19
221 0.18
222 0.15
223 0.17
224 0.15
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.17
232 0.2
233 0.22
234 0.23
235 0.3
236 0.3
237 0.33
238 0.32
239 0.28
240 0.27
241 0.27
242 0.27
243 0.24
244 0.23
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.18
249 0.17
250 0.18
251 0.14
252 0.15
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.21
290 0.22
291 0.24
292 0.28
293 0.32
294 0.38
295 0.46
296 0.49
297 0.54
298 0.56
299 0.55
300 0.54
301 0.53
302 0.47
303 0.44
304 0.42
305 0.38
306 0.4
307 0.37
308 0.33
309 0.31
310 0.33
311 0.3
312 0.27
313 0.25
314 0.26
315 0.32
316 0.41
317 0.5
318 0.54
319 0.62
320 0.7
321 0.73
322 0.73
323 0.77
324 0.76
325 0.75
326 0.71
327 0.68
328 0.65
329 0.61
330 0.54
331 0.45
332 0.36
333 0.27
334 0.23
335 0.15
336 0.09
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.1
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.14
372 0.14
373 0.17
374 0.19
375 0.24
376 0.32
377 0.37
378 0.42
379 0.52
380 0.55
381 0.59
382 0.63
383 0.64
384 0.65
385 0.69
386 0.73
387 0.71
388 0.75
389 0.71
390 0.75
391 0.74
392 0.72
393 0.72
394 0.72
395 0.68
396 0.68
397 0.71
398 0.66
399 0.63
400 0.59
401 0.57
402 0.49
403 0.51
404 0.52
405 0.48
406 0.49
407 0.52
408 0.53
409 0.53
410 0.6
411 0.61
412 0.62
413 0.63
414 0.65
415 0.65
416 0.62
417 0.55
418 0.5
419 0.47
420 0.42
421 0.43
422 0.37
423 0.31
424 0.3
425 0.3
426 0.31
427 0.29
428 0.31
429 0.34
430 0.43
431 0.51
432 0.59
433 0.59
434 0.64
435 0.71
436 0.73
437 0.77
438 0.7
439 0.69
440 0.67
441 0.69
442 0.69
443 0.69
444 0.65
445 0.62
446 0.67
447 0.67
448 0.67
449 0.7
450 0.68
451 0.68
452 0.7
453 0.67
454 0.63
455 0.58
456 0.57
457 0.58
458 0.54
459 0.49
460 0.44
461 0.44
462 0.49
463 0.53
464 0.53
465 0.51
466 0.54
467 0.56
468 0.65
469 0.66
470 0.66
471 0.67
472 0.71
473 0.7
474 0.71
475 0.71