Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SJM3

Protein Details
Accession M2SJM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-345VVAMEKRRPGRPKGSKNKPLVEATETVGPRPRGRPKGSKNQSTLHydrophilic
349-368KEATYKPRGRPKGTTKHYAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
307-341KRRPGRPKGSKNKPLVEATETVGPRPRGRPKGSKN
354-364KPRGRPKGTTK
388-396RPKGAKTKR
Subcellular Location(s) mito 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR018828  RRG7  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG bsc:COCSADRAFT_38445  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10356  DUF2034  
Amino Acid Sequences MRPSLRPTWPTNSSLLAWLPRATPHRVPRRIATTSAHNAAPVDLPKMVLSPGSPHHNSLPTFLDYAKRTNLALDSTLFIGTHYEYTSALALMRLGFSLLRIGRTSDAGIDLIGHWVLAPLREPLPVIIQCKARKISVNPSHIRELEGSFCGIPPDWTKKDVLGLLVTTKKATRGVLEAVGHSHWPMGFVLISQQGLIQQFVWNRAACDRGLEGVGVTVRHTPRILLPDAEHETEQDESGTAKKRLAKFKNAGTRRDIQLTWMGSPIFPERKDLDQETLGLMRQIPADDKVVKVAKVAKVATVVAMEKRRPGRPKGSKNKPLVEATETVGPRPRGRPKGSKNQSTLQAEKEATYKPRGRPKGTTKHYAEKMPFPRGGLVPRTLKSYCGRPKGAKTKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.31
4 0.28
5 0.27
6 0.25
7 0.27
8 0.31
9 0.34
10 0.39
11 0.46
12 0.55
13 0.61
14 0.64
15 0.66
16 0.7
17 0.67
18 0.63
19 0.57
20 0.55
21 0.55
22 0.54
23 0.46
24 0.38
25 0.35
26 0.32
27 0.31
28 0.23
29 0.19
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.16
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.12
38 0.17
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.31
43 0.36
44 0.36
45 0.36
46 0.35
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.29
51 0.26
52 0.29
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.24
57 0.25
58 0.21
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.15
112 0.17
113 0.18
114 0.2
115 0.26
116 0.27
117 0.32
118 0.33
119 0.3
120 0.32
121 0.34
122 0.41
123 0.44
124 0.51
125 0.5
126 0.52
127 0.54
128 0.5
129 0.47
130 0.38
131 0.3
132 0.23
133 0.2
134 0.17
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.21
146 0.23
147 0.22
148 0.2
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.11
169 0.09
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.17
211 0.17
212 0.14
213 0.15
214 0.2
215 0.22
216 0.23
217 0.2
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.1
226 0.15
227 0.14
228 0.17
229 0.22
230 0.28
231 0.38
232 0.43
233 0.49
234 0.5
235 0.57
236 0.65
237 0.65
238 0.62
239 0.57
240 0.57
241 0.51
242 0.49
243 0.41
244 0.33
245 0.33
246 0.31
247 0.26
248 0.23
249 0.2
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.18
255 0.22
256 0.23
257 0.26
258 0.3
259 0.31
260 0.29
261 0.25
262 0.26
263 0.23
264 0.22
265 0.18
266 0.15
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.26
281 0.25
282 0.29
283 0.29
284 0.24
285 0.23
286 0.23
287 0.22
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.21
292 0.2
293 0.25
294 0.3
295 0.37
296 0.42
297 0.48
298 0.54
299 0.6
300 0.71
301 0.75
302 0.81
303 0.83
304 0.85
305 0.85
306 0.8
307 0.73
308 0.65
309 0.58
310 0.49
311 0.41
312 0.4
313 0.33
314 0.29
315 0.31
316 0.3
317 0.3
318 0.37
319 0.44
320 0.46
321 0.54
322 0.64
323 0.67
324 0.76
325 0.81
326 0.83
327 0.79
328 0.76
329 0.78
330 0.74
331 0.68
332 0.61
333 0.57
334 0.48
335 0.44
336 0.4
337 0.36
338 0.33
339 0.38
340 0.42
341 0.44
342 0.54
343 0.61
344 0.64
345 0.69
346 0.76
347 0.78
348 0.78
349 0.81
350 0.77
351 0.79
352 0.77
353 0.76
354 0.7
355 0.68
356 0.68
357 0.65
358 0.6
359 0.52
360 0.51
361 0.47
362 0.49
363 0.44
364 0.44
365 0.43
366 0.43
367 0.47
368 0.42
369 0.43
370 0.42
371 0.47
372 0.5
373 0.52
374 0.58
375 0.6
376 0.7