Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2RDD4

Protein Details
Accession M2RDD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-135GSDSERGRLRRKRSREDFEDDVDADKQPEKKIERHARKRSRDITKDLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-100LRRKR
117-127KKIERHARKRS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR000156  Ran_bind_dom  
IPR045255  RanBP1-like  
Gene Ontology GO:0046907  P:intracellular transport  
KEGG bsc:COCSADRAFT_88360  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00638  Ran_BP1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50196  RANBD1  
Amino Acid Sequences MADTPETQHEAAAPVTSTPTTKDITGTAPTSPARSDKSSDSEGKNVREKLKDTQIDAPPTSNPVSDTDQATKDATNGTTKLGDQSVSGSDSERGRLRRKRSREDFEDDVDADKQPEKKIERHARKRSRDITKDLEAGIAVKPAGSAISSIKESDTDEHMTSPSKSASITTATAATEKRSGSNTSPKNKRSREEAENDTEDTTKGTEIGAANGDTALSEERDSKRLRDKERTQSITDTESKTKIPPGSGFANTSASSPFAAMAAKPQQAKTSDKPDSLPQTSDDKFKASGFGGFAASTTSPFGGLGGSKPSTSSPFGAASGNKLSSFGGSAAPSTLGGGGFGALGGSGTSSFGGSSFGGSLGGGFGGLGGVKTIGSFAAPGGNLEIKGLKEKEKPFGAAADNESSEDEDGDDEDLEKGTEKEERQRQSSQPLLSQHPPETGEEGEQTIWTGRAKLYLMAGEGSNRAWKERGVGTFKFNITVDEPKKARFVLRAEGTHRLLLNAAVTRKMVFGGDAQGEKPKDGRLLFNSPNQDGELEMHLLRMKAENAKQLWEEVTKVQEEQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.19
10 0.19
11 0.22
12 0.25
13 0.24
14 0.22
15 0.25
16 0.25
17 0.26
18 0.26
19 0.27
20 0.28
21 0.3
22 0.33
23 0.34
24 0.39
25 0.44
26 0.49
27 0.48
28 0.51
29 0.54
30 0.56
31 0.59
32 0.59
33 0.58
34 0.57
35 0.57
36 0.56
37 0.61
38 0.59
39 0.55
40 0.58
41 0.59
42 0.59
43 0.57
44 0.5
45 0.41
46 0.4
47 0.37
48 0.29
49 0.23
50 0.21
51 0.25
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.3
56 0.31
57 0.31
58 0.27
59 0.23
60 0.23
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.2
66 0.2
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.16
77 0.17
78 0.21
79 0.25
80 0.28
81 0.36
82 0.44
83 0.53
84 0.6
85 0.68
86 0.75
87 0.8
88 0.84
89 0.82
90 0.82
91 0.76
92 0.7
93 0.64
94 0.53
95 0.45
96 0.36
97 0.29
98 0.23
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.27
103 0.29
104 0.33
105 0.44
106 0.53
107 0.61
108 0.69
109 0.78
110 0.81
111 0.86
112 0.91
113 0.89
114 0.89
115 0.85
116 0.81
117 0.77
118 0.71
119 0.64
120 0.54
121 0.45
122 0.34
123 0.28
124 0.22
125 0.16
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.15
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.19
167 0.22
168 0.32
169 0.38
170 0.44
171 0.53
172 0.58
173 0.65
174 0.68
175 0.66
176 0.65
177 0.65
178 0.63
179 0.61
180 0.6
181 0.56
182 0.53
183 0.5
184 0.43
185 0.36
186 0.28
187 0.21
188 0.16
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.1
206 0.12
207 0.17
208 0.18
209 0.21
210 0.3
211 0.37
212 0.43
213 0.49
214 0.56
215 0.62
216 0.7
217 0.71
218 0.64
219 0.59
220 0.54
221 0.49
222 0.44
223 0.37
224 0.29
225 0.27
226 0.25
227 0.24
228 0.26
229 0.22
230 0.2
231 0.18
232 0.2
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.2
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.15
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.08
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.21
255 0.26
256 0.27
257 0.32
258 0.32
259 0.32
260 0.33
261 0.35
262 0.38
263 0.34
264 0.31
265 0.24
266 0.27
267 0.27
268 0.29
269 0.25
270 0.2
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.11
372 0.09
373 0.14
374 0.15
375 0.19
376 0.25
377 0.28
378 0.34
379 0.35
380 0.36
381 0.32
382 0.34
383 0.32
384 0.27
385 0.27
386 0.23
387 0.21
388 0.19
389 0.19
390 0.16
391 0.14
392 0.11
393 0.09
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.12
406 0.13
407 0.22
408 0.3
409 0.35
410 0.39
411 0.45
412 0.48
413 0.51
414 0.56
415 0.49
416 0.46
417 0.46
418 0.47
419 0.46
420 0.46
421 0.4
422 0.36
423 0.35
424 0.31
425 0.29
426 0.24
427 0.21
428 0.18
429 0.17
430 0.15
431 0.13
432 0.12
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.11
437 0.1
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.15
442 0.14
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.15
450 0.14
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.19
455 0.24
456 0.31
457 0.33
458 0.35
459 0.38
460 0.42
461 0.42
462 0.4
463 0.35
464 0.3
465 0.27
466 0.35
467 0.33
468 0.36
469 0.37
470 0.36
471 0.39
472 0.38
473 0.38
474 0.34
475 0.36
476 0.36
477 0.42
478 0.45
479 0.46
480 0.52
481 0.51
482 0.48
483 0.44
484 0.35
485 0.28
486 0.24
487 0.23
488 0.21
489 0.2
490 0.18
491 0.19
492 0.19
493 0.19
494 0.19
495 0.15
496 0.11
497 0.12
498 0.15
499 0.18
500 0.19
501 0.19
502 0.26
503 0.26
504 0.26
505 0.26
506 0.24
507 0.27
508 0.27
509 0.33
510 0.33
511 0.41
512 0.45
513 0.5
514 0.53
515 0.48
516 0.48
517 0.42
518 0.35
519 0.28
520 0.26
521 0.21
522 0.18
523 0.17
524 0.17
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.18
529 0.19
530 0.24
531 0.29
532 0.35
533 0.35
534 0.4
535 0.4
536 0.39
537 0.39
538 0.33
539 0.31
540 0.27
541 0.3
542 0.27