Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2TBM3

Protein Details
Accession M2TBM3    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
654-691QSPSGGGGKNKNRKQRQREKRERERQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
433-437KAKKR
516-600RRGMGRGRGPWGDRGRGFRGRGGAGGRGDFGGARGDRGGYGGGNGGRGDFGGGRGDRAGQRGDRGAQGNSRGDKGGGEKGGRAGK
660-676GGKNKNRKQRQREKRER
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG bsc:COCSADRAFT_24390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSDSLEPPAKRARLEADAPTQYGTSASSASALDAPGSPVDDMDDDFYDTTPVKPSALPTAVDGTTASSFAAVAPAPAFHLPGLGSTSEAPVAQPQPQPHDGAAAQDEPEDGEFSDGEAFYDDANANAQTGIPVEPSAANQAQAQHDAPQQGMPLPSELPGANLTSTQDAAAAADTPAADTDGELDAALTAAIDQQNETEDASPEGATFDSKAEFLRVAEANRGDQNAEWQLDSDASDSDSESSSDSSSDDSSDEGELLDPEEQVRLLMAEVADDAGASGLVKVKTLNEMDEKFEKPDITVTEDTKITELGKVESIVGNLVVVKAKMSGDEQVLESGSALCLQNRTVVGKVSEQIGRVEEPRYSFGFNDPAELATLGIEKDTPIYYVDEHSTFTETEPIRRQKHTDASNLHDEETNEVEFSDDEKEAEYKREQKAKKRARADTNEEQAPVNIPTGPRLHVDAPAPPIYRPMEYQGGGLKYSDDEDEDLGMYKPLARPDHFEQIVGQGAPLEDRSHVRRGMGRGRGPWGDRGRGFRGRGGAGGRGDFGGARGDRGGYGGGNGGRGDFGGGRGDRAGQRGDRGAQGNSRGDKGGGEKGGRAGKNQSDRGKQQEQFQQNNQQQRNGPYQDNRSATSASPARQQQDRNQSYPQQPPSQQSPSGGGGKNKNRKQRQREKRERERQQQQQQQQQQQQQQQQSQNKQQENASPAPSGPSNSNAYTNNSNAGWPIPFSGPSQPAIPYASAPPPPPPAVAASYTPQPSYTPQPPVPAQPQAQPQQNQAANWAAWAQWFQVVGAMSGQQPPQPQMAAQMAAQAPAPPPPQSAAQAQYSYPYQGYGQSQAPGINAPQPGNGQASAQSLQDILRALQGGGAPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.45
4 0.45
5 0.45
6 0.43
7 0.37
8 0.3
9 0.26
10 0.21
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.17
41 0.19
42 0.26
43 0.28
44 0.27
45 0.25
46 0.29
47 0.27
48 0.26
49 0.24
50 0.19
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.1
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.16
79 0.21
80 0.24
81 0.26
82 0.33
83 0.35
84 0.37
85 0.32
86 0.34
87 0.29
88 0.28
89 0.28
90 0.22
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.19
128 0.2
129 0.23
130 0.23
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.23
135 0.2
136 0.19
137 0.18
138 0.19
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.04
176 0.03
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.19
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.22
210 0.18
211 0.16
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.16
220 0.12
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.12
272 0.13
273 0.15
274 0.17
275 0.18
276 0.22
277 0.26
278 0.26
279 0.24
280 0.25
281 0.23
282 0.18
283 0.2
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.22
291 0.19
292 0.18
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.19
353 0.18
354 0.18
355 0.16
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.06
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.16
381 0.14
382 0.18
383 0.24
384 0.31
385 0.33
386 0.35
387 0.38
388 0.36
389 0.44
390 0.44
391 0.44
392 0.4
393 0.41
394 0.46
395 0.44
396 0.39
397 0.33
398 0.29
399 0.23
400 0.21
401 0.17
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.09
413 0.12
414 0.13
415 0.18
416 0.23
417 0.31
418 0.35
419 0.43
420 0.54
421 0.61
422 0.67
423 0.68
424 0.71
425 0.72
426 0.75
427 0.74
428 0.71
429 0.66
430 0.59
431 0.51
432 0.44
433 0.34
434 0.28
435 0.2
436 0.13
437 0.09
438 0.08
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.15
448 0.17
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.19
453 0.18
454 0.18
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.18
461 0.18
462 0.17
463 0.16
464 0.13
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.12
480 0.15
481 0.15
482 0.2
483 0.25
484 0.33
485 0.32
486 0.3
487 0.27
488 0.26
489 0.26
490 0.2
491 0.16
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.09
499 0.12
500 0.16
501 0.16
502 0.18
503 0.21
504 0.25
505 0.32
506 0.37
507 0.36
508 0.35
509 0.38
510 0.4
511 0.37
512 0.4
513 0.36
514 0.34
515 0.33
516 0.36
517 0.38
518 0.41
519 0.41
520 0.35
521 0.35
522 0.3
523 0.3
524 0.27
525 0.24
526 0.19
527 0.18
528 0.16
529 0.13
530 0.13
531 0.1
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.1
541 0.05
542 0.06
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.05
552 0.06
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.13
558 0.13
559 0.15
560 0.17
561 0.14
562 0.16
563 0.18
564 0.19
565 0.21
566 0.22
567 0.21
568 0.21
569 0.25
570 0.28
571 0.27
572 0.26
573 0.23
574 0.21
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.19
579 0.18
580 0.18
581 0.22
582 0.28
583 0.27
584 0.26
585 0.26
586 0.29
587 0.36
588 0.43
589 0.45
590 0.45
591 0.49
592 0.55
593 0.59
594 0.55
595 0.55
596 0.57
597 0.59
598 0.58
599 0.6
600 0.62
601 0.59
602 0.66
603 0.6
604 0.56
605 0.52
606 0.5
607 0.53
608 0.47
609 0.47
610 0.44
611 0.48
612 0.51
613 0.49
614 0.46
615 0.4
616 0.38
617 0.33
618 0.34
619 0.31
620 0.25
621 0.28
622 0.3
623 0.32
624 0.35
625 0.39
626 0.41
627 0.48
628 0.52
629 0.5
630 0.51
631 0.55
632 0.56
633 0.61
634 0.58
635 0.54
636 0.52
637 0.53
638 0.55
639 0.53
640 0.48
641 0.41
642 0.4
643 0.36
644 0.4
645 0.37
646 0.35
647 0.39
648 0.47
649 0.56
650 0.58
651 0.65
652 0.69
653 0.77
654 0.83
655 0.85
656 0.87
657 0.88
658 0.93
659 0.94
660 0.95
661 0.95
662 0.95
663 0.94
664 0.93
665 0.93
666 0.92
667 0.91
668 0.88
669 0.87
670 0.86
671 0.84
672 0.82
673 0.79
674 0.77
675 0.75
676 0.74
677 0.71
678 0.7
679 0.69
680 0.7
681 0.71
682 0.72
683 0.73
684 0.69
685 0.64
686 0.6
687 0.57
688 0.54
689 0.5
690 0.43
691 0.34
692 0.31
693 0.31
694 0.29
695 0.25
696 0.2
697 0.2
698 0.21
699 0.22
700 0.26
701 0.25
702 0.29
703 0.31
704 0.3
705 0.29
706 0.25
707 0.24
708 0.21
709 0.2
710 0.16
711 0.13
712 0.15
713 0.13
714 0.14
715 0.16
716 0.21
717 0.21
718 0.22
719 0.23
720 0.21
721 0.22
722 0.22
723 0.21
724 0.17
725 0.18
726 0.22
727 0.23
728 0.23
729 0.25
730 0.28
731 0.29
732 0.28
733 0.26
734 0.24
735 0.24
736 0.26
737 0.24
738 0.22
739 0.26
740 0.27
741 0.26
742 0.23
743 0.22
744 0.23
745 0.29
746 0.32
747 0.35
748 0.35
749 0.41
750 0.43
751 0.49
752 0.5
753 0.5
754 0.46
755 0.44
756 0.5
757 0.51
758 0.57
759 0.53
760 0.51
761 0.53
762 0.53
763 0.47
764 0.42
765 0.39
766 0.31
767 0.29
768 0.26
769 0.17
770 0.15
771 0.16
772 0.13
773 0.11
774 0.12
775 0.11
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.12
782 0.15
783 0.16
784 0.15
785 0.17
786 0.19
787 0.21
788 0.2
789 0.19
790 0.21
791 0.24
792 0.23
793 0.21
794 0.25
795 0.22
796 0.22
797 0.22
798 0.18
799 0.16
800 0.19
801 0.22
802 0.17
803 0.18
804 0.2
805 0.23
806 0.25
807 0.3
808 0.29
809 0.31
810 0.32
811 0.3
812 0.32
813 0.3
814 0.29
815 0.24
816 0.21
817 0.17
818 0.2
819 0.23
820 0.24
821 0.25
822 0.24
823 0.25
824 0.25
825 0.25
826 0.22
827 0.21
828 0.21
829 0.21
830 0.21
831 0.22
832 0.22
833 0.24
834 0.25
835 0.24
836 0.2
837 0.19
838 0.23
839 0.21
840 0.2
841 0.18
842 0.16
843 0.15
844 0.16
845 0.15
846 0.12
847 0.13
848 0.14
849 0.13
850 0.15