FuNGI

M2SW42

Protein Details

Accession

M2SW42

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
141-164	SSNSSNTMRLRRKRKQVETSLDDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	bsc:COCSADRAFT_29340 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSGRPVVHQDYIAKIRYSNALPPPPCPPKLLDIPNTGLSSGQYTSAGFASRLAREQSLNIEADAELGMPIDLVGIPKVFDGDESAIQAMPHPPPLSAADKALMRPPNALGKSTSHVSGATFLRRTEYVTASTTGGSKFESSNSSNTMRLRRKRKQVETSLDDPTNISRHILKGFNIAYPADAYNGQDNAENIRAAESTPEERLAWNKPKHPRNPNLKLLDSYPLLPDWDATPDTGGYMVFKFTAPPINNPLDPSYDPRLDVALLRPAGQTIQDQERYMEDLQAHKLDPTVPPPIARYQFEFFLPSDKSKVRGIKRNFTTYDPTNEADIDFDIAEDDEGQPRKCFKYDNIRTYETSQQVGDPSDTYGDVVALALHDPEKHESEPLRDTKLQKAAYFYPITQRTSLRPRRPGRVDMTEEQPKVDIIEAAGKDPESFERREMYRKRAEGMEIGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.33
3	0.32
4	0.35
5	0.35
6	0.35
7	0.38
8	0.44
9	0.44
10	0.46
11	0.53
12	0.55
13	0.54
14	0.49
15	0.44
16	0.41
17	0.49
18	0.55
19	0.52
20	0.49
21	0.52
22	0.54
23	0.51
24	0.44
25	0.35
26	0.28
27	0.24
28	0.19
29	0.16
30	0.12
31	0.11
32	0.13
33	0.14
34	0.14
35	0.11
36	0.14
37	0.17
38	0.18
39	0.21
40	0.23
41	0.23
42	0.23
43	0.25
44	0.26
45	0.26
46	0.25
47	0.21
48	0.2
49	0.18
50	0.17
51	0.15
52	0.11
53	0.07
54	0.06
55	0.06
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.05
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.06
68	0.09
69	0.11
70	0.12
71	0.13
72	0.14
73	0.13
74	0.13
75	0.15
76	0.15
77	0.13
78	0.16
79	0.15
80	0.15
81	0.16
82	0.21
83	0.23
84	0.21
85	0.22
86	0.2
87	0.21
88	0.23
89	0.27
90	0.27
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.3
95	0.3
96	0.3
97	0.26
98	0.26
99	0.29
100	0.29
101	0.27
102	0.19
103	0.18
104	0.17
105	0.2
106	0.19
107	0.2
108	0.2
109	0.19
110	0.22
111	0.21
112	0.24
113	0.22
114	0.22
115	0.19
116	0.2
117	0.22
118	0.2
119	0.2
120	0.19
121	0.16
122	0.14
123	0.12
124	0.11
125	0.1
126	0.11
127	0.15
128	0.16
129	0.18
130	0.21
131	0.23
132	0.25
133	0.28
134	0.36
135	0.41
136	0.47
137	0.55
138	0.6
139	0.69
140	0.76
141	0.83
142	0.83
143	0.84
144	0.84
145	0.8
146	0.76
147	0.7
148	0.6
149	0.5
150	0.4
151	0.32
152	0.25
153	0.18
154	0.15
155	0.11
156	0.13
157	0.16
158	0.17
159	0.16
160	0.2
161	0.21
162	0.2
163	0.2
164	0.18
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.11
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.11
188	0.1
189	0.11
190	0.13
191	0.19
192	0.26
193	0.28
194	0.35
195	0.43
196	0.51
197	0.6
198	0.66
199	0.69
200	0.71
201	0.75
202	0.77
203	0.73
204	0.66
205	0.58
206	0.5
207	0.44
208	0.34
209	0.26
210	0.18
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.1
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.13
232	0.13
233	0.15
234	0.2
235	0.23
236	0.23
237	0.24
238	0.25
239	0.21
240	0.21
241	0.24
242	0.23
243	0.21
244	0.21
245	0.2
246	0.2
247	0.17
248	0.17
249	0.13
250	0.14
251	0.13
252	0.14
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.12
258	0.1
259	0.15
260	0.16
261	0.17
262	0.17
263	0.18
264	0.2
265	0.2
266	0.18
267	0.14
268	0.15
269	0.17
270	0.17
271	0.17
272	0.14
273	0.14
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.16
278	0.15
279	0.16
280	0.18
281	0.23
282	0.26
283	0.26
284	0.27
285	0.25
286	0.26
287	0.26
288	0.26
289	0.2
290	0.21
291	0.22
292	0.19
293	0.21
294	0.21
295	0.23
296	0.27
297	0.35
298	0.37
299	0.45
300	0.5
301	0.56
302	0.61
303	0.66
304	0.62
305	0.58
306	0.57
307	0.51
308	0.5
309	0.44
310	0.39
311	0.32
312	0.3
313	0.26
314	0.21
315	0.17
316	0.12
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.11
325	0.14
326	0.15
327	0.16
328	0.2
329	0.22
330	0.23
331	0.26
332	0.28
333	0.37
334	0.46
335	0.53
336	0.57
337	0.58
338	0.59
339	0.6
340	0.61
341	0.52
342	0.43
343	0.34
344	0.29
345	0.27
346	0.26
347	0.23
348	0.15
349	0.14
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.1
354	0.08
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.13
365	0.16
366	0.16
367	0.21
368	0.22
369	0.27
370	0.34
371	0.36
372	0.39
373	0.41
374	0.43
375	0.47
376	0.53
377	0.52
378	0.46
379	0.48
380	0.44
381	0.46
382	0.45
383	0.38
384	0.4
385	0.41
386	0.42
387	0.4
388	0.39
389	0.4
390	0.48
391	0.58
392	0.58
393	0.63
394	0.67
395	0.74
396	0.78
397	0.79
398	0.76
399	0.75
400	0.73
401	0.67
402	0.69
403	0.67
404	0.61
405	0.53
406	0.46
407	0.37
408	0.3
409	0.26
410	0.19
411	0.11
412	0.18
413	0.18
414	0.19
415	0.2
416	0.19
417	0.18
418	0.19
419	0.25
420	0.22
421	0.23
422	0.24
423	0.3
424	0.34
425	0.44
426	0.49
427	0.51
428	0.57
429	0.58
430	0.59
431	0.57
432	0.57

M2SW42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer