Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q59SN6

Protein Details
Accession Q59SN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-314TVSPSLKRKRRTAKKSLSPSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-307KRKRRTAKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007155  P:cell adhesion  
GO:0071468  P:cellular response to acidic pH  
GO:0070417  P:cellular response to cold  
GO:0071280  P:cellular response to copper ion  
GO:1900189  P:positive regulation of cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:0010811  P:positive regulation of cell-substrate adhesion  
GO:1900231  P:regulation of single-species biofilm formation on inanimate substrate  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0044011  P:single-species biofilm formation on inanimate substrate  
KEGG cal:CAALFM_CR07060CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MLSTMSNLPIVAGISTTATTGTTSTATASTSTSGSVNTTATNNNNNTSASNSTSASSATANGGIGTNSGNSLQYYYTGNNTSNSVDGNKYSLPSIYFTPQDSINNTSHTYNPYTTVSGAVTPQNYQLDYSQSSTVNNNYQFTLPNQQLSSPQQQQYNRSYSNSLMPNYHYNNTTTNINTNVGSNTSPQLSNSNTPNPISPVLIPDKDNTYNNTNNVLVSSYPSMTMNQIQQQQQQYLQPSQQYQYSYNQYYMQPYYHNPQQSAPQQVQKPAQTEKLPHLSVTNIDYSSLVSYTVSPSLKRKRRTAKKSLSPSSTSSLSMMINHDSTNNGTTSTATTTRSSSTSSATSSSIGVAAADSFPCPQCNKVFQKPYNLKSHMKTHSNEKPYHCNICFKRFARSHDKKRHELLHQGVKNFKCQGYLNDGVTSWGCGKTFARSDALSRHFRTETGWLCIRPLMEEAKRLEEEEQQRQQQAQQQQQVPQQSQVSEQIGVNVGEIKFNDEYYDNSNFIKKLLQSNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.18
27 0.21
28 0.29
29 0.29
30 0.3
31 0.31
32 0.3
33 0.29
34 0.29
35 0.28
36 0.24
37 0.24
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.2
42 0.17
43 0.15
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.17
64 0.19
65 0.2
66 0.2
67 0.21
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.24
88 0.24
89 0.26
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.27
97 0.23
98 0.25
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.21
103 0.18
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.25
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.23
127 0.23
128 0.24
129 0.28
130 0.22
131 0.24
132 0.23
133 0.22
134 0.26
135 0.3
136 0.35
137 0.34
138 0.36
139 0.39
140 0.42
141 0.47
142 0.49
143 0.51
144 0.45
145 0.41
146 0.4
147 0.35
148 0.39
149 0.37
150 0.32
151 0.26
152 0.27
153 0.31
154 0.33
155 0.34
156 0.28
157 0.25
158 0.26
159 0.27
160 0.27
161 0.21
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.19
166 0.17
167 0.16
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.14
176 0.16
177 0.19
178 0.21
179 0.25
180 0.25
181 0.25
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.2
186 0.17
187 0.16
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.22
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.25
197 0.27
198 0.27
199 0.28
200 0.24
201 0.21
202 0.2
203 0.17
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.16
215 0.2
216 0.21
217 0.26
218 0.27
219 0.27
220 0.26
221 0.27
222 0.26
223 0.23
224 0.23
225 0.21
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.22
232 0.25
233 0.24
234 0.24
235 0.26
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.19
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.22
244 0.23
245 0.2
246 0.2
247 0.26
248 0.28
249 0.31
250 0.28
251 0.3
252 0.3
253 0.33
254 0.36
255 0.32
256 0.31
257 0.29
258 0.31
259 0.27
260 0.28
261 0.28
262 0.31
263 0.28
264 0.25
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.16
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.19
284 0.29
285 0.36
286 0.41
287 0.49
288 0.57
289 0.67
290 0.76
291 0.79
292 0.8
293 0.82
294 0.86
295 0.84
296 0.78
297 0.7
298 0.64
299 0.56
300 0.47
301 0.38
302 0.28
303 0.23
304 0.18
305 0.16
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.13
336 0.1
337 0.09
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.07
346 0.09
347 0.1
348 0.13
349 0.16
350 0.25
351 0.32
352 0.4
353 0.5
354 0.51
355 0.61
356 0.67
357 0.69
358 0.71
359 0.69
360 0.64
361 0.59
362 0.65
363 0.62
364 0.59
365 0.55
366 0.55
367 0.58
368 0.6
369 0.61
370 0.57
371 0.59
372 0.58
373 0.64
374 0.57
375 0.58
376 0.56
377 0.58
378 0.62
379 0.54
380 0.58
381 0.54
382 0.6
383 0.61
384 0.68
385 0.71
386 0.72
387 0.79
388 0.76
389 0.79
390 0.79
391 0.73
392 0.71
393 0.68
394 0.68
395 0.64
396 0.6
397 0.6
398 0.54
399 0.54
400 0.49
401 0.41
402 0.34
403 0.32
404 0.33
405 0.34
406 0.37
407 0.34
408 0.31
409 0.3
410 0.28
411 0.26
412 0.24
413 0.17
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.19
419 0.23
420 0.24
421 0.26
422 0.25
423 0.28
424 0.34
425 0.4
426 0.41
427 0.4
428 0.43
429 0.4
430 0.39
431 0.39
432 0.39
433 0.36
434 0.36
435 0.38
436 0.33
437 0.34
438 0.35
439 0.33
440 0.26
441 0.24
442 0.25
443 0.23
444 0.29
445 0.3
446 0.34
447 0.35
448 0.35
449 0.34
450 0.35
451 0.4
452 0.44
453 0.49
454 0.47
455 0.49
456 0.49
457 0.51
458 0.51
459 0.53
460 0.52
461 0.53
462 0.54
463 0.58
464 0.62
465 0.65
466 0.59
467 0.55
468 0.49
469 0.41
470 0.39
471 0.39
472 0.36
473 0.3
474 0.28
475 0.25
476 0.24
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.17
481 0.17
482 0.18
483 0.2
484 0.18
485 0.18
486 0.2
487 0.16
488 0.19
489 0.22
490 0.26
491 0.23
492 0.24
493 0.28
494 0.26
495 0.26
496 0.29
497 0.28