Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2TJV2

Protein Details
Accession M2TJV2    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
435-459ADVASTPKKSKKPFRIGGKGRSSKDHydrophilic
510-540EEKAERRRAELKRRNEEAAKKQAQQKKKKRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
441-458PKKSKKPFRIGGKGRSSK
512-540KAERRRAELKRRNEEAAKKQAQQKKKKRF
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG bsc:COCSADRAFT_177213  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSCWRILRLCEQPDNRHVPQLLVKPVFSPDSYIVHLTDLSNVWSEELSLDDIVDRASQEQSPIEVSKQDTAQLGVLLENIAKPLGNADDALCRMTRNGQDGIILHASIILPEPLGRLSWKFQLQKRTSTVLKNELILPLLVSSHIQNERIASLIKTITSKDKAINRLLDQFECSNLDLAAAFPGASSMKTGRRTIKREQAAKHVSALKPFHEAVWRKETEQLEDSGLTSLGLFQEALVQSTPTVPQQLKSNNLEACWWTSVSTHLTVSKAPANKKTRKSAVLSNLRNASESSEEETEDEFDTHEHFKTRNLPVNPMNVTKVSGQKPPLNGHNEDESDSTEEELDLDTPAISCNPTQVQESLQSQYRKSPSPEHLSPPPTIASSAKKTNVSSFRIGGERRGTSPSSSPSPGIPDGEASSDDILTTKEAAPPSPKQADVASTPKKSKKPFRIGGKGRSSKDGASQRATTISPSKIRMRATQSPTAEPPSSPLPHSVTREMTPAEEEVEETPEEKAERRRAELKRRNEEAAKKQAQQKKKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.66
3 0.64
4 0.57
5 0.51
6 0.51
7 0.52
8 0.52
9 0.46
10 0.44
11 0.38
12 0.41
13 0.4
14 0.32
15 0.29
16 0.23
17 0.24
18 0.27
19 0.27
20 0.24
21 0.22
22 0.23
23 0.19
24 0.19
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.18
60 0.16
61 0.12
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.19
82 0.22
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.24
87 0.24
88 0.28
89 0.23
90 0.19
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.11
95 0.12
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.14
105 0.2
106 0.27
107 0.33
108 0.38
109 0.48
110 0.5
111 0.56
112 0.57
113 0.57
114 0.54
115 0.53
116 0.54
117 0.51
118 0.48
119 0.42
120 0.39
121 0.34
122 0.3
123 0.23
124 0.18
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.26
148 0.31
149 0.35
150 0.39
151 0.42
152 0.38
153 0.43
154 0.43
155 0.38
156 0.35
157 0.3
158 0.26
159 0.23
160 0.21
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.14
176 0.18
177 0.22
178 0.3
179 0.38
180 0.44
181 0.5
182 0.57
183 0.6
184 0.63
185 0.62
186 0.64
187 0.61
188 0.56
189 0.53
190 0.49
191 0.42
192 0.41
193 0.39
194 0.3
195 0.29
196 0.28
197 0.25
198 0.26
199 0.28
200 0.27
201 0.34
202 0.34
203 0.31
204 0.37
205 0.36
206 0.33
207 0.31
208 0.28
209 0.21
210 0.2
211 0.2
212 0.14
213 0.13
214 0.09
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.06
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.16
234 0.19
235 0.24
236 0.25
237 0.3
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.22
242 0.21
243 0.16
244 0.14
245 0.1
246 0.09
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.15
256 0.17
257 0.19
258 0.27
259 0.34
260 0.42
261 0.47
262 0.53
263 0.54
264 0.54
265 0.55
266 0.53
267 0.54
268 0.57
269 0.53
270 0.5
271 0.48
272 0.44
273 0.41
274 0.34
275 0.26
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.13
294 0.2
295 0.25
296 0.31
297 0.31
298 0.35
299 0.37
300 0.42
301 0.42
302 0.36
303 0.33
304 0.25
305 0.25
306 0.23
307 0.26
308 0.23
309 0.25
310 0.27
311 0.29
312 0.32
313 0.34
314 0.38
315 0.36
316 0.35
317 0.34
318 0.34
319 0.32
320 0.29
321 0.27
322 0.21
323 0.18
324 0.17
325 0.14
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.12
344 0.14
345 0.17
346 0.2
347 0.2
348 0.25
349 0.26
350 0.25
351 0.31
352 0.33
353 0.33
354 0.34
355 0.39
356 0.4
357 0.46
358 0.49
359 0.48
360 0.52
361 0.51
362 0.48
363 0.42
364 0.36
365 0.28
366 0.26
367 0.23
368 0.21
369 0.23
370 0.28
371 0.3
372 0.32
373 0.32
374 0.38
375 0.42
376 0.41
377 0.39
378 0.36
379 0.35
380 0.37
381 0.37
382 0.34
383 0.33
384 0.3
385 0.29
386 0.31
387 0.3
388 0.27
389 0.3
390 0.3
391 0.29
392 0.29
393 0.28
394 0.25
395 0.29
396 0.28
397 0.25
398 0.21
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.17
403 0.13
404 0.12
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.12
413 0.13
414 0.15
415 0.2
416 0.23
417 0.3
418 0.31
419 0.31
420 0.29
421 0.3
422 0.31
423 0.31
424 0.37
425 0.37
426 0.39
427 0.46
428 0.51
429 0.57
430 0.63
431 0.69
432 0.7
433 0.73
434 0.77
435 0.81
436 0.85
437 0.86
438 0.87
439 0.87
440 0.85
441 0.76
442 0.73
443 0.64
444 0.55
445 0.55
446 0.54
447 0.48
448 0.45
449 0.44
450 0.4
451 0.4
452 0.39
453 0.34
454 0.31
455 0.32
456 0.31
457 0.35
458 0.41
459 0.43
460 0.46
461 0.49
462 0.52
463 0.56
464 0.59
465 0.62
466 0.58
467 0.58
468 0.59
469 0.57
470 0.5
471 0.4
472 0.37
473 0.36
474 0.35
475 0.31
476 0.32
477 0.31
478 0.36
479 0.41
480 0.42
481 0.39
482 0.38
483 0.41
484 0.38
485 0.34
486 0.3
487 0.25
488 0.22
489 0.18
490 0.18
491 0.15
492 0.16
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.15
498 0.18
499 0.26
500 0.33
501 0.37
502 0.43
503 0.52
504 0.6
505 0.7
506 0.75
507 0.77
508 0.78
509 0.79
510 0.8
511 0.79
512 0.79
513 0.78
514 0.79
515 0.75
516 0.72
517 0.76
518 0.77
519 0.79
520 0.81