Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SLC1

Protein Details
Accession M2SLC1    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-207MEKDAEEKRRLRNEKRRAKKKTDSNAMEWKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-57KKAKEREAKEREEGKERYEAKMAGKSYRR
183-197EKRRLRNEKRRAKKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG bsc:COCSADRAFT_80038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MSGKAGAYGTTGGGDTDFRKTWDRDEMAKKAKEREAKEREEGKERYEAKMAGKSYRRRASTPEDLKQTEARAERIDWSKMIGKQTLTSAAAAVGKRGRGAGAYCGACDLTFKDNIQYVEHLNSKQHLIATGQSGEVRRATVQEVRDRLRYLKRKQDEAKILDVIDLDSRLAMNREQMEKDAEEKRRLRNEKRRAKKKTDSNAMEWKVEGDGVIC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.15
4 0.15
5 0.17
6 0.23
7 0.24
8 0.28
9 0.35
10 0.38
11 0.41
12 0.48
13 0.55
14 0.58
15 0.62
16 0.62
17 0.6
18 0.63
19 0.62
20 0.6
21 0.62
22 0.62
23 0.62
24 0.67
25 0.68
26 0.65
27 0.66
28 0.62
29 0.54
30 0.54
31 0.5
32 0.44
33 0.4
34 0.37
35 0.31
36 0.36
37 0.35
38 0.33
39 0.4
40 0.44
41 0.5
42 0.56
43 0.56
44 0.52
45 0.56
46 0.57
47 0.6
48 0.6
49 0.57
50 0.56
51 0.53
52 0.54
53 0.5
54 0.43
55 0.37
56 0.31
57 0.26
58 0.22
59 0.21
60 0.24
61 0.25
62 0.25
63 0.2
64 0.21
65 0.24
66 0.25
67 0.27
68 0.24
69 0.21
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.17
74 0.15
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.15
128 0.18
129 0.23
130 0.27
131 0.3
132 0.32
133 0.33
134 0.35
135 0.41
136 0.47
137 0.48
138 0.54
139 0.56
140 0.63
141 0.67
142 0.72
143 0.71
144 0.65
145 0.62
146 0.53
147 0.48
148 0.39
149 0.33
150 0.24
151 0.17
152 0.13
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.12
160 0.16
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.25
165 0.25
166 0.29
167 0.33
168 0.35
169 0.4
170 0.44
171 0.51
172 0.58
173 0.66
174 0.72
175 0.75
176 0.8
177 0.82
178 0.89
179 0.91
180 0.9
181 0.91
182 0.9
183 0.9
184 0.9
185 0.9
186 0.85
187 0.82
188 0.83
189 0.76
190 0.68
191 0.57
192 0.47
193 0.36
194 0.3