Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2SEQ2

Protein Details
Accession M2SEQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-195VVPTGTSGRRRRPRGRDLLEKVPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-185RRRRPR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG bsc:COCSADRAFT_85817  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSASQVPTSPPSELDNARTIVYDPNDPFWRDTEDDDDDMDFVPAEEGHDDDEEGEGDSSFHDAAERLSNLSGVEIAFEYTDDHEEEEEDEEDDDDDENEEEEEEEEDDTELPQRPVMITRDQIMQLLGHAGLGRIFAADFSQRSLLRRRRLDDEEEDDDDDNSDPGTGYDPVVPTGTSGRRRRPRGRDLLEKVPSEQGRELMETGTFGSNPRREDTIKRKKRLAYDIMRRELGIGSDGRQKNATRLLKQDMIPESVADTIIHYNARCYSGQFSDDGNFFFSCAQDFKVRMYDTSNPYDWKYYKTVRYHGGQWTITDASLSPDNRFLAYSSIRSIVSLAPTDPEDDSEPHMLDFNNMGTSNPRGFHSHFGIWSIRFSGDGREIVAGTGDSSVYVYDIERRQSVLRIPGHQDDVNAVCFGDSQSPHILYSGSDDTTLKVWDRRSMGDGREAGVFFGHTEGLTYVDSKGDGRYVLSNGKDQTAKLWDLRKMVSKEKADTIDPYRYTTRFEYRSNGYDYDDFRPHPHDCSLVTFRGHKVLKTLIRCHFSPPGSTDSRYVYSGSYDGSVYIWNMDATLAGKVNVLKATKNSRPRDPDLLAGTYDYWGRNEGKWMTCVRDASWHPNAPMIAATSWNGWGTTQGTCTVHTWNDGVEDDEAEPKVGRRVNAQLQHDERLYKSHEGRSRRHPVWYDDMMDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.31
4 0.31
5 0.3
6 0.27
7 0.28
8 0.28
9 0.3
10 0.27
11 0.33
12 0.37
13 0.38
14 0.39
15 0.35
16 0.39
17 0.33
18 0.34
19 0.34
20 0.33
21 0.32
22 0.32
23 0.3
24 0.24
25 0.22
26 0.19
27 0.13
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.11
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.18
103 0.21
104 0.23
105 0.22
106 0.24
107 0.28
108 0.28
109 0.28
110 0.24
111 0.2
112 0.15
113 0.15
114 0.12
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.16
129 0.17
130 0.2
131 0.3
132 0.37
133 0.43
134 0.5
135 0.52
136 0.56
137 0.6
138 0.63
139 0.6
140 0.59
141 0.54
142 0.5
143 0.47
144 0.4
145 0.34
146 0.28
147 0.22
148 0.15
149 0.1
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.15
163 0.21
164 0.28
165 0.34
166 0.43
167 0.52
168 0.61
169 0.71
170 0.75
171 0.79
172 0.81
173 0.83
174 0.83
175 0.8
176 0.81
177 0.76
178 0.68
179 0.59
180 0.55
181 0.48
182 0.4
183 0.34
184 0.27
185 0.23
186 0.23
187 0.22
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.15
196 0.18
197 0.2
198 0.22
199 0.24
200 0.26
201 0.35
202 0.45
203 0.5
204 0.56
205 0.6
206 0.65
207 0.66
208 0.72
209 0.71
210 0.7
211 0.68
212 0.69
213 0.72
214 0.69
215 0.65
216 0.57
217 0.49
218 0.4
219 0.3
220 0.21
221 0.13
222 0.11
223 0.2
224 0.21
225 0.21
226 0.23
227 0.23
228 0.25
229 0.33
230 0.37
231 0.31
232 0.35
233 0.39
234 0.41
235 0.41
236 0.44
237 0.36
238 0.33
239 0.3
240 0.25
241 0.21
242 0.17
243 0.16
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.21
278 0.25
279 0.27
280 0.3
281 0.3
282 0.27
283 0.27
284 0.31
285 0.28
286 0.26
287 0.26
288 0.28
289 0.34
290 0.36
291 0.4
292 0.39
293 0.41
294 0.42
295 0.41
296 0.41
297 0.34
298 0.3
299 0.28
300 0.24
301 0.21
302 0.17
303 0.13
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.13
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.14
350 0.15
351 0.18
352 0.21
353 0.21
354 0.19
355 0.21
356 0.22
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.08
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.15
387 0.16
388 0.19
389 0.21
390 0.22
391 0.24
392 0.28
393 0.28
394 0.31
395 0.29
396 0.27
397 0.22
398 0.2
399 0.18
400 0.14
401 0.12
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.1
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.17
426 0.19
427 0.2
428 0.23
429 0.26
430 0.26
431 0.29
432 0.28
433 0.24
434 0.25
435 0.23
436 0.19
437 0.15
438 0.14
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.12
458 0.15
459 0.16
460 0.2
461 0.2
462 0.22
463 0.22
464 0.2
465 0.21
466 0.22
467 0.23
468 0.23
469 0.28
470 0.28
471 0.3
472 0.32
473 0.37
474 0.36
475 0.41
476 0.45
477 0.43
478 0.43
479 0.45
480 0.45
481 0.38
482 0.39
483 0.37
484 0.36
485 0.34
486 0.35
487 0.34
488 0.32
489 0.34
490 0.34
491 0.37
492 0.35
493 0.36
494 0.38
495 0.39
496 0.43
497 0.43
498 0.4
499 0.35
500 0.34
501 0.35
502 0.35
503 0.33
504 0.3
505 0.28
506 0.31
507 0.3
508 0.29
509 0.27
510 0.24
511 0.22
512 0.28
513 0.31
514 0.29
515 0.3
516 0.29
517 0.29
518 0.35
519 0.35
520 0.28
521 0.27
522 0.32
523 0.36
524 0.4
525 0.47
526 0.45
527 0.48
528 0.49
529 0.5
530 0.49
531 0.44
532 0.41
533 0.37
534 0.36
535 0.36
536 0.37
537 0.34
538 0.31
539 0.32
540 0.3
541 0.27
542 0.21
543 0.19
544 0.18
545 0.17
546 0.13
547 0.11
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.1
563 0.1
564 0.13
565 0.16
566 0.16
567 0.16
568 0.22
569 0.3
570 0.37
571 0.47
572 0.5
573 0.56
574 0.63
575 0.67
576 0.69
577 0.63
578 0.61
579 0.56
580 0.52
581 0.43
582 0.36
583 0.3
584 0.23
585 0.23
586 0.17
587 0.13
588 0.15
589 0.17
590 0.17
591 0.23
592 0.27
593 0.28
594 0.31
595 0.33
596 0.35
597 0.37
598 0.37
599 0.32
600 0.35
601 0.37
602 0.4
603 0.46
604 0.45
605 0.41
606 0.43
607 0.42
608 0.34
609 0.31
610 0.25
611 0.18
612 0.15
613 0.16
614 0.13
615 0.15
616 0.14
617 0.13
618 0.11
619 0.13
620 0.13
621 0.14
622 0.14
623 0.17
624 0.18
625 0.2
626 0.21
627 0.23
628 0.22
629 0.23
630 0.22
631 0.18
632 0.2
633 0.18
634 0.19
635 0.15
636 0.16
637 0.14
638 0.17
639 0.17
640 0.15
641 0.16
642 0.15
643 0.2
644 0.22
645 0.22
646 0.24
647 0.33
648 0.41
649 0.49
650 0.53
651 0.56
652 0.56
653 0.61
654 0.58
655 0.52
656 0.43
657 0.41
658 0.4
659 0.39
660 0.41
661 0.44
662 0.49
663 0.54
664 0.6
665 0.66
666 0.71
667 0.66
668 0.69
669 0.66
670 0.66
671 0.67
672 0.65
673 0.58