FuNGI

N1PVU4

Protein Details

Accession

N1PVU4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1118-1142	VPRFDKSGNTRSKQRARKLQLGDID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MERRRKRDLKEQNARAWAGETDVFQVQGSLDSNLKKNTAFIKRLRTALTATNVGTFLQEIRTLSLHKYLAEIISACFEGLTKLKAAGDIAAGVEVLSALHQRFGPQEFTCYLGWYIGRGLATPDKAQLKALATDVREREEKDRIARQRILLRVATELWLVGVLKSLEDVAQPAEAGKVKAAEGMAKPKINGTGSDTADPEPFPLEVLKEMLSQDREHVNLPLVVLFVKTFAWDILGSKSAKTEGRQAVAEDGATHTTNGHAGSATTTENDDGASPDPPLTPPALQQRFQNILLRYFEDVKSHIVRDQERLTIQGKRNAEAYVKSGEVFEDRQTNYEKAIKAQEKLVTSAQTLSEVLGAEMPDLSEKNNNSGGFEGSIGLVKTGEYLRGQAEGAGIWEDEDERRFYENLVDLKDRVPGILLEDGKKKKIENDEQVGKKLDEAADVKEKPVDLEDSSTSIANKTVGAQVDALLARLHELTTKEQVDQFAIDFCFLNSKASRNRLIKSIEEIPKGRTDLLPLYARLVATLGRYLQDVPQAMISYLDDEFRSLQRRKSKDFLGQVRMVNIRYIAELTKFGVVPEHVIFHCLKVSLDDFSRMNIEVIANLLENCGRYLLRNPDTSPRMTSFLETLQRKKAAQHLGQQERMLIENAAYYVNPPERAAIQQKERTTLDLYVRKLVYVDLSKKTLDKVIKQIRKLHWEESEVVDILRKIFVKPGKIRFGNIYLLAMMLAALYRFHPSFSITVLDELLERITVGLEVNDFKYNQRRIAEVKYLGELYMYRIVDSQLVFDMLYRLLNYGHAGGYAQPGIICGMDLPDDFFRVRLVCAVLETCGHCFDKGAAKKKLDFFLSFFQYYVNVKEQLPMDIEFVIQDTYNLLRPQWRLILGNLADAGRVFAEATKQHYRDTAAGKTQEPEEPDEPEADGAMSDDARHDGGEEDEAADADGGEPKSDSDDVAQGDDDKQADDSDDEEHIVVTRPDEYRDPEADADFDRELAKMMAESVESRKFDRKPMFDVPLPMRRTARDASIAAEDSIEDVRAPPPQVNGGAGTMKFALLSKKGNRQQTRSIDLPSDSSFAVAMRSQQQAEKAEQQRIKNLVLNYDLNDDQADGSYDSLHGVPRFDKSGNTRSKQRARKLQLGDIDWT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.65
3	0.56
4	0.45
5	0.38
6	0.3
7	0.23
8	0.19
9	0.19
10	0.19
11	0.16
12	0.16
13	0.13
14	0.14
15	0.14
16	0.13
17	0.16
18	0.19
19	0.24
20	0.26
21	0.28
22	0.26
23	0.28
24	0.36
25	0.41
26	0.45
27	0.48
28	0.55
29	0.59
30	0.63
31	0.62
32	0.55
33	0.49
34	0.49
35	0.47
36	0.4
37	0.36
38	0.34
39	0.31
40	0.28
41	0.25
42	0.18
43	0.14
44	0.12
45	0.14
46	0.13
47	0.15
48	0.17
49	0.18
50	0.2
51	0.25
52	0.24
53	0.22
54	0.23
55	0.23
56	0.21
57	0.21
58	0.2
59	0.14
60	0.16
61	0.16
62	0.13
63	0.11
64	0.11
65	0.11
66	0.12
67	0.14
68	0.12
69	0.13
70	0.14
71	0.15
72	0.16
73	0.14
74	0.13
75	0.11
76	0.11
77	0.09
78	0.09
79	0.07
80	0.06
81	0.05
82	0.04
83	0.05
84	0.07
85	0.07
86	0.09
87	0.1
88	0.11
89	0.15
90	0.18
91	0.23
92	0.21
93	0.25
94	0.24
95	0.27
96	0.26
97	0.25
98	0.22
99	0.19
100	0.19
101	0.16
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.13
106	0.16
107	0.19
108	0.22
109	0.22
110	0.27
111	0.28
112	0.28
113	0.29
114	0.29
115	0.26
116	0.26
117	0.28
118	0.26
119	0.24
120	0.31
121	0.32
122	0.32
123	0.32
124	0.33
125	0.35
126	0.38
127	0.41
128	0.41
129	0.49
130	0.53
131	0.58
132	0.6
133	0.61
134	0.61
135	0.61
136	0.59
137	0.52
138	0.45
139	0.39
140	0.36
141	0.31
142	0.23
143	0.18
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.08
148	0.1
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.1
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.16
169	0.17
170	0.24
171	0.28
172	0.29
173	0.29
174	0.29
175	0.33
176	0.29
177	0.28
178	0.27
179	0.29
180	0.3
181	0.32
182	0.32
183	0.29
184	0.28
185	0.27
186	0.21
187	0.15
188	0.12
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.17
198	0.18
199	0.17
200	0.2
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.22
205	0.19
206	0.18
207	0.18
208	0.15
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.11
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.18
227	0.2
228	0.21
229	0.28
230	0.28
231	0.3
232	0.31
233	0.31
234	0.3
235	0.27
236	0.26
237	0.17
238	0.14
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.09
243	0.09
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.16
269	0.26
270	0.3
271	0.31
272	0.33
273	0.39
274	0.41
275	0.43
276	0.44
277	0.35
278	0.35
279	0.35
280	0.35
281	0.3
282	0.29
283	0.28
284	0.23
285	0.23
286	0.23
287	0.24
288	0.23
289	0.23
290	0.25
291	0.26
292	0.29
293	0.31
294	0.29
295	0.27
296	0.29
297	0.29
298	0.32
299	0.35
300	0.36
301	0.35
302	0.32
303	0.34
304	0.32
305	0.31
306	0.25
307	0.23
308	0.19
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.14
316	0.17
317	0.17
318	0.19
319	0.23
320	0.23
321	0.24
322	0.28
323	0.26
324	0.23
325	0.32
326	0.33
327	0.31
328	0.34
329	0.35
330	0.31
331	0.34
332	0.33
333	0.25
334	0.22
335	0.22
336	0.18
337	0.15
338	0.14
339	0.11
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.1
352	0.11
353	0.14
354	0.18
355	0.18
356	0.18
357	0.19
358	0.19
359	0.15
360	0.15
361	0.12
362	0.08
363	0.09
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.07
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.14
393	0.18
394	0.19
395	0.22
396	0.22
397	0.21
398	0.21
399	0.23
400	0.2
401	0.15
402	0.13
403	0.1
404	0.11
405	0.15
406	0.15
407	0.15
408	0.23
409	0.24
410	0.26
411	0.27
412	0.25
413	0.26
414	0.34
415	0.4
416	0.41
417	0.48
418	0.54
419	0.55
420	0.58
421	0.54
422	0.45
423	0.36
424	0.3
425	0.22
426	0.17
427	0.16
428	0.16
429	0.21
430	0.21
431	0.22
432	0.2
433	0.2
434	0.17
435	0.17
436	0.16
437	0.09
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.1
445	0.1
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.1
465	0.15
466	0.16
467	0.16
468	0.18
469	0.18
470	0.17
471	0.15
472	0.13
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.08
477	0.08
478	0.1
479	0.09
480	0.12
481	0.11
482	0.15
483	0.2
484	0.24
485	0.31
486	0.32
487	0.34
488	0.36
489	0.38
490	0.35
491	0.34
492	0.39
493	0.36
494	0.36
495	0.36
496	0.32
497	0.32
498	0.31
499	0.28
500	0.19
501	0.17
502	0.15
503	0.17
504	0.18
505	0.15
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.13
510	0.12
511	0.09
512	0.07
513	0.08
514	0.07
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.09
534	0.16
535	0.17
536	0.22
537	0.3
538	0.34
539	0.38
540	0.42
541	0.44
542	0.44
543	0.5
544	0.51
545	0.49
546	0.48
547	0.44
548	0.42
549	0.4
550	0.33
551	0.25
552	0.19
553	0.13
554	0.1
555	0.1
556	0.08
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.09
566	0.09
567	0.1
568	0.08
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.11
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.11
580	0.1
581	0.11
582	0.12
583	0.11
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.1
600	0.18
601	0.21
602	0.22
603	0.24
604	0.3
605	0.33
606	0.33
607	0.31
608	0.26
609	0.26
610	0.24
611	0.23
612	0.17
613	0.19
614	0.25
615	0.25
616	0.26
617	0.27
618	0.28
619	0.28
620	0.29
621	0.32
622	0.33
623	0.34
624	0.39
625	0.44
626	0.48
627	0.49
628	0.48
629	0.41
630	0.34
631	0.31
632	0.24
633	0.14
634	0.09
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.05
640	0.07
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.1
646	0.14
647	0.19
648	0.21
649	0.26
650	0.31
651	0.32
652	0.35
653	0.35
654	0.33
655	0.3
656	0.28
657	0.29
658	0.29
659	0.3
660	0.3
661	0.3
662	0.27
663	0.26
664	0.23
665	0.19
666	0.19
667	0.22
668	0.19
669	0.21
670	0.22
671	0.22
672	0.23
673	0.25
674	0.23
675	0.22
676	0.3
677	0.39
678	0.44
679	0.47
680	0.55
681	0.54
682	0.59
683	0.59
684	0.53
685	0.46
686	0.44
687	0.41
688	0.36
689	0.33
690	0.24
691	0.21
692	0.17
693	0.14
694	0.12
695	0.12
696	0.1
697	0.08
698	0.14
699	0.17
700	0.23
701	0.3
702	0.37
703	0.44
704	0.44
705	0.45
706	0.43
707	0.44
708	0.38
709	0.32
710	0.25
711	0.16
712	0.15
713	0.13
714	0.1
715	0.07
716	0.04
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.04
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.09
726	0.1
727	0.11
728	0.12
729	0.1
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.09
734	0.09
735	0.08
736	0.05
737	0.05
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.05
744	0.06
745	0.08
746	0.1
747	0.1
748	0.12
749	0.2
750	0.23
751	0.27
752	0.27
753	0.28
754	0.3
755	0.36
756	0.4
757	0.34
758	0.32
759	0.29
760	0.28
761	0.25
762	0.22
763	0.17
764	0.13
765	0.16
766	0.15
767	0.14
768	0.14
769	0.15
770	0.16
771	0.16
772	0.14
773	0.08
774	0.09
775	0.09
776	0.08
777	0.09
778	0.07
779	0.08
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.08
784	0.08
785	0.08
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.09
791	0.08
792	0.08
793	0.06
794	0.07
795	0.07
796	0.07
797	0.06
798	0.04
799	0.05
800	0.05
801	0.06
802	0.08
803	0.08
804	0.09
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.11
812	0.09
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.11
817	0.12
818	0.11
819	0.13
820	0.13
821	0.12
822	0.12
823	0.14
824	0.22
825	0.28
826	0.36
827	0.4
828	0.42
829	0.48
830	0.52
831	0.54
832	0.48
833	0.43
834	0.38
835	0.38
836	0.4
837	0.35
838	0.31
839	0.26
840	0.25
841	0.24
842	0.24
843	0.21
844	0.18
845	0.18
846	0.21
847	0.22
848	0.21
849	0.22
850	0.2
851	0.17
852	0.15
853	0.15
854	0.11
855	0.11
856	0.1
857	0.07
858	0.06
859	0.06
860	0.08
861	0.12
862	0.12
863	0.12
864	0.17
865	0.18
866	0.22
867	0.24
868	0.25
869	0.23
870	0.23
871	0.3
872	0.25
873	0.25
874	0.23
875	0.19
876	0.17
877	0.15
878	0.15
879	0.07
880	0.07
881	0.06
882	0.05
883	0.09
884	0.11
885	0.17
886	0.25
887	0.26
888	0.27
889	0.29
890	0.31
891	0.33
892	0.36
893	0.35
894	0.33
895	0.35
896	0.36
897	0.36
898	0.35
899	0.32
900	0.3
901	0.3
902	0.26
903	0.26
904	0.26
905	0.24
906	0.23
907	0.2
908	0.18
909	0.11
910	0.09
911	0.07
912	0.07
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.07
920	0.07
921	0.08
922	0.09
923	0.09
924	0.09
925	0.09
926	0.09
927	0.08
928	0.07
929	0.06
930	0.05
931	0.1
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.13
937	0.13
938	0.13
939	0.1
940	0.14
941	0.14
942	0.15
943	0.16
944	0.14
945	0.15
946	0.16
947	0.15
948	0.12
949	0.11
950	0.11
951	0.11
952	0.11
953	0.11
954	0.1
955	0.11
956	0.11
957	0.1
958	0.1
959	0.1
960	0.11
961	0.11
962	0.09
963	0.13
964	0.13
965	0.16
966	0.19
967	0.24
968	0.27
969	0.29
970	0.32
971	0.29
972	0.29
973	0.28
974	0.26
975	0.25
976	0.19
977	0.18
978	0.15
979	0.14
980	0.14
981	0.13
982	0.11
983	0.08
984	0.08
985	0.08
986	0.09
987	0.11
988	0.15
989	0.2
990	0.22
991	0.25
992	0.32
993	0.33
994	0.41
995	0.48
996	0.48
997	0.49
998	0.56
999	0.59
1000	0.55
1001	0.6
1002	0.58
1003	0.58
1004	0.56
1005	0.53
1006	0.47
1007	0.42
1008	0.44
1009	0.39
1010	0.37
1011	0.34
1012	0.32
1013	0.3
1014	0.33
1015	0.32
1016	0.27
1017	0.24
1018	0.19
1019	0.15
1020	0.15
1021	0.13
1022	0.08
1023	0.08
1024	0.09
1025	0.13
1026	0.15
1027	0.15
1028	0.17
1029	0.2
1030	0.21
1031	0.22
1032	0.22
1033	0.2
1034	0.23
1035	0.21
1036	0.2
1037	0.17
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.16
1042	0.16
1043	0.24
1044	0.29
1045	0.4
1046	0.47
1047	0.57
1048	0.63
1049	0.66
1050	0.72
1051	0.73
1052	0.73
1053	0.66
1054	0.63
1055	0.57
1056	0.5
1057	0.47
1058	0.39
1059	0.33
1060	0.25
1061	0.22
1062	0.18
1063	0.14
1064	0.15
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.17
1068	0.21
1069	0.22
1070	0.24
1071	0.3
1072	0.31
1073	0.36
1074	0.42
1075	0.43
1076	0.49
1077	0.53
1078	0.54
1079	0.56
1080	0.57
1081	0.55
1082	0.5
1083	0.46
1084	0.42
1085	0.41
1086	0.4
1087	0.35
1088	0.36
1089	0.32
1090	0.27
1091	0.26
1092	0.21
1093	0.17
1094	0.15
1095	0.15
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.1
1100	0.11
1101	0.12
1102	0.15
1103	0.14
1104	0.16
1105	0.18
1106	0.21
1107	0.25
1108	0.24
1109	0.3
1110	0.33
1111	0.42
1112	0.5
1113	0.54
1114	0.6
1115	0.67
1116	0.76
1117	0.8
1118	0.83
1119	0.84
1120	0.82
1121	0.86
1122	0.83
1123	0.81
1124	0.78

N1PVU4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer