Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CSA5

Protein Details
Accession B0CSA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-186VNGFKSTHKKKQGGKGKGKKNKNAPPILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-181HKKKQGGKGKGKKNKN
215-234ERRERLAEQRRMEERKRSRR
Subcellular Location(s) mito 19, cyto 4, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305937  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSSRAGGLYGGIQFSSGTVFQPSVPPTTTTAAAAVPTPVPLPQTVDVLTQQPVTTEQTPKPQADPISGKSTPAWSAALAFAPVRRNQAQKTKTAAPRLPAGASLLASAPLNSAFSSTAIVFAPPALIEPANPTQDAPQPATQGWGKKVKPPSMVLDEDVNGFKSTHKKKQGGKGKGKKNKNAPPILLWDPMEQYDPLRPNDYNEYRVWRQKDRIERRERLAEQRRMEERKRSRRSASYSDSEETGSEEDSRPRKAGRFHESFDHWSRADEERAGAAHSSAIGQPLPVAPIERNLTGDEAFQRRLAMSAIPPVSTPPTAPFASPSPPNDDTVPGPSATAVKVNIDSGEEAYLRRLAMAGMAPVQPPPVAPPSPPPLAYNPFAPPSVPPPPPGPPATVISNIFEDKVKAAAAIAAKLGALAASGSQPPAPIEEKKPDPHGFAARLMAKWGHKEGQGLGADGTGIVNALTVEQVSQVKGVKGKPVKAQGHGGSSGKGLKVGSKMGKIINNNEDAKTRDDRERFGDPSRVVVLTNMVGMEDVDDGDLREEIGDECSKNGTVERVVVHPVYPPPPNPDDAVRIFVLFAGPAGAWKTVRELDGRYFGGRSVRARYFPEQRFHRSDLDCSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.1
4 0.09
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.18
9 0.2
10 0.21
11 0.22
12 0.23
13 0.25
14 0.27
15 0.28
16 0.23
17 0.22
18 0.19
19 0.18
20 0.16
21 0.15
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.2
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.21
41 0.24
42 0.27
43 0.29
44 0.37
45 0.43
46 0.44
47 0.44
48 0.43
49 0.41
50 0.42
51 0.45
52 0.4
53 0.43
54 0.42
55 0.41
56 0.37
57 0.38
58 0.31
59 0.27
60 0.23
61 0.15
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.18
69 0.2
70 0.25
71 0.28
72 0.33
73 0.39
74 0.48
75 0.49
76 0.51
77 0.56
78 0.59
79 0.62
80 0.65
81 0.62
82 0.55
83 0.56
84 0.53
85 0.46
86 0.37
87 0.33
88 0.25
89 0.21
90 0.19
91 0.13
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.13
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.25
122 0.27
123 0.26
124 0.24
125 0.25
126 0.25
127 0.28
128 0.29
129 0.28
130 0.3
131 0.35
132 0.33
133 0.38
134 0.46
135 0.49
136 0.5
137 0.49
138 0.5
139 0.47
140 0.48
141 0.43
142 0.37
143 0.31
144 0.29
145 0.26
146 0.21
147 0.15
148 0.14
149 0.15
150 0.22
151 0.29
152 0.37
153 0.45
154 0.51
155 0.58
156 0.68
157 0.76
158 0.77
159 0.81
160 0.82
161 0.83
162 0.86
163 0.87
164 0.85
165 0.85
166 0.84
167 0.82
168 0.79
169 0.7
170 0.64
171 0.61
172 0.56
173 0.49
174 0.41
175 0.33
176 0.27
177 0.25
178 0.23
179 0.17
180 0.15
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.22
185 0.22
186 0.24
187 0.33
188 0.35
189 0.33
190 0.31
191 0.37
192 0.38
193 0.45
194 0.46
195 0.43
196 0.46
197 0.49
198 0.58
199 0.62
200 0.68
201 0.71
202 0.71
203 0.71
204 0.74
205 0.7
206 0.7
207 0.69
208 0.67
209 0.6
210 0.62
211 0.64
212 0.61
213 0.61
214 0.61
215 0.61
216 0.65
217 0.7
218 0.69
219 0.67
220 0.68
221 0.72
222 0.7
223 0.66
224 0.6
225 0.55
226 0.5
227 0.45
228 0.38
229 0.3
230 0.23
231 0.17
232 0.13
233 0.1
234 0.1
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.2
240 0.23
241 0.28
242 0.35
243 0.38
244 0.4
245 0.4
246 0.44
247 0.46
248 0.48
249 0.45
250 0.4
251 0.32
252 0.27
253 0.29
254 0.26
255 0.24
256 0.19
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.07
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.08
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.21
312 0.22
313 0.23
314 0.22
315 0.22
316 0.2
317 0.2
318 0.2
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.16
357 0.2
358 0.22
359 0.23
360 0.23
361 0.23
362 0.26
363 0.27
364 0.25
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.2
369 0.17
370 0.18
371 0.24
372 0.22
373 0.22
374 0.23
375 0.27
376 0.31
377 0.31
378 0.27
379 0.23
380 0.25
381 0.26
382 0.26
383 0.23
384 0.2
385 0.21
386 0.19
387 0.17
388 0.15
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.07
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.09
414 0.12
415 0.15
416 0.19
417 0.25
418 0.3
419 0.32
420 0.39
421 0.39
422 0.38
423 0.39
424 0.4
425 0.36
426 0.33
427 0.35
428 0.3
429 0.28
430 0.26
431 0.25
432 0.22
433 0.23
434 0.25
435 0.23
436 0.21
437 0.23
438 0.22
439 0.26
440 0.25
441 0.23
442 0.19
443 0.16
444 0.14
445 0.13
446 0.12
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.11
461 0.12
462 0.17
463 0.18
464 0.25
465 0.29
466 0.34
467 0.39
468 0.47
469 0.49
470 0.49
471 0.55
472 0.49
473 0.48
474 0.47
475 0.41
476 0.31
477 0.29
478 0.29
479 0.21
480 0.2
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.23
485 0.25
486 0.24
487 0.27
488 0.3
489 0.35
490 0.35
491 0.39
492 0.39
493 0.41
494 0.41
495 0.4
496 0.38
497 0.36
498 0.37
499 0.36
500 0.34
501 0.36
502 0.37
503 0.39
504 0.42
505 0.45
506 0.44
507 0.44
508 0.47
509 0.39
510 0.4
511 0.39
512 0.33
513 0.27
514 0.24
515 0.22
516 0.15
517 0.15
518 0.11
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.1
535 0.13
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.15
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.22
548 0.22
549 0.21
550 0.21
551 0.24
552 0.26
553 0.27
554 0.28
555 0.32
556 0.34
557 0.36
558 0.35
559 0.35
560 0.37
561 0.35
562 0.37
563 0.3
564 0.27
565 0.25
566 0.23
567 0.19
568 0.13
569 0.1
570 0.07
571 0.06
572 0.08
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.17
578 0.18
579 0.21
580 0.22
581 0.24
582 0.28
583 0.34
584 0.35
585 0.33
586 0.3
587 0.3
588 0.33
589 0.34
590 0.33
591 0.34
592 0.37
593 0.4
594 0.45
595 0.51
596 0.56
597 0.58
598 0.64
599 0.64
600 0.67
601 0.7
602 0.69
603 0.69
604 0.62